| 研究課題/領域番号 |
14340237
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
遺伝
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| 研究機関 | 国立精神・神経センター |
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研究代表者 |
北條 浩彦 国立精神・神経センター, 疾病研究第三部, 室長 (60238722)
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| 研究分担者 |
徳永 勝士 東京大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (40163977)
石田 貴文 東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教授 (20184533)
功刀 浩 国立精神・神経センター, 疾病研究第三部, 部長 (40234471)
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| 研究期間 (年度) |
2002 – 2003
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| 研究課題ステータス |
完了 (2003年度)
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| 配分額 *注記 |
11,600千円 (直接経費: 11,600千円)
2003年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2002年度: 8,200千円 (直接経費: 8,200千円)
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| キーワード | HLA / ハプロタイプ / DRB1遺伝子 / Phylogenic tree / DR53 group |
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| 研究概要 |
ヒト白血球抗原(HLA)-DRB1遺伝子は、250以上の対立遺伝子を持つ非常に多型性に富んだ遺伝子である。さらに、DRB1遺伝子と連鎖する機能遺伝子の種類や偽遺伝子の有無によってその領域は少なくとも5つのハプロタイプグループ(DRグループ)に分類される。本研究では、そのDRハプロタイプグループを基にDRB1遺伝子の多様化、系統進化について解析を行った。本研究で主に解析したDRグループは、DR53(DRB1^*07,^*04,^*09対立遺伝子が属している)グループであり、そのDR53グループ特異的に存在する偽遺伝子(Processed Pseudogene)と、その偽遺伝子とDRB1遺伝子を挟むニュートラルな領域(CFDRと暫定的に呼ぶ)との間(偽遺伝子-CFDR)のハプロタイプについてまず解析した。その結果、DR53グループに属する、ヒトDRB1*^07,^*04そしてチンプDRB1^*0701を含むハプロタイプが互いに良く似ていることが明かになった。この結果は、DR53グループに属するDRB1対立遺伝子が共通祖先のDR53ハプロタイプから由来していることを示唆している。次に、これらの結果を基に、偽遺伝子、CFDR領域、DRB1対立遺伝子(DR53グループに限る)の塩基置換率、そして進化速度を解析した。その結果、偽遺伝子、CFDR領域の塩基置換率はほぼ同じであったのに対して、DRB1対立遺伝子の塩基置換率はそれらに比べて高く、それを基に算出された進化速度は、ニュートラルな領域(偽遺伝子も含む)の進化速度よりも速いことが示唆された。これらの結果から、この速い進化速度が、DRB1対立遺伝子の多様化に貢献している可能性が考えられた。以上の研究成果から、従来のDRB1塩基配列データに基づく系統進化研究だけではなく、ハプロタイプを基にしたDRB1対立遺伝子の系統進化研究の重要性が示された。
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