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枯草菌転写因子の機能とネットワークの解明

研究課題

研究課題/領域番号 14360058
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関東海大学

研究代表者

田中 暉夫  東海大学, 海洋学部, 教授 (10236606)

研究分担者 小倉 光雄  東海大学, 海洋学部, 助教授 (80204163)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
14,700千円 (直接経費: 14,700千円)
2004年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2003年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2002年度: 6,300千円 (直接経費: 6,300千円)
キーワード枯草菌 / AhrC / ComK / aprE発現制御 / ScoC / ybaL(sayA) / マイクロアレー / YclJ / 転写因子 / Helix-Tern-Helix / senS / glnA / ybaL
研究概要

本研究年度では、枯草菌のHelix-Turn-Helix(HTH)を含む転写制御因子およびアルカリプロテアーゼ構造遺伝子aprEの発現制御因子に関する研究を行った。研究手法は、種々の転写制御因子の標的遺伝子をマイクロアレーで調べ、発現の差異が検出された場合にはlacZ fusionでの検討を行った。AhrC(HTH)では、既知の作用以外にプリン分解系遺伝子群の負の制御遺伝子であるpucRが標的であることが判明した。、また、AhrCはaprEの発現を負に制御し、さらに、GlnAの標的であるureオペロンやnrgAの発現を下降させることが確認された。AhrC,GlnAおよびAprEは、窒素源の確保という細胞が生きて行く上でのプロセスと関連が深く、細胞内においてネットワークが形成されていることが示唆された。ComK(HTH)では多くの標的が見つかり、それらの遺伝子の上流にはComKが結合するコンセンサス配列が見いだされた。HTHを含むAnsRとDeoRについても解析したが、既知標的以外は発見できなかった。2成分制御系の制御因子YclJ(HTH)についても検討し、その複数の標的遺伝子の配列から、YclJのコンセンサス配列をを発見した。一方、HTHを含む転写制御因子でaprE発現を正に制御するSenSについて検討し、その標的はaprEの負の制御因子であるSeoCを転写レベルで抑制することを発見した。また、本研究において、機能未知の遺伝子であるybaL(sayAと命名)がSenSとは逆にscoCを転写レベルで正に制御することを見いだした。aprEの発現には多くの正および負の制御因子が関与しているが、その意義は、アルカリプロテアーゼを含む菌体外プロテアーゼは大量に生産・分泌されるので、無駄なエネルギーを不要に使わないよう正負制御因子がバランスを保ちつつ厳密に制御しているものと思われる。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2005 2004 2003 2002 その他

すべて 雑誌論文 (25件) 文献書誌 (5件)

  • [雑誌論文] Genes for SkfA killing factor production protect a Bacillus subtilislipase against degradation.2005

    • 著者名/発表者名
      Westers, H.et al.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. 71

      ページ: 1899-1908

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of the replication region of plasmid pLS32 from the Natto strain of Bacillus subtilis.2005

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, T.et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol 187(in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genes for SkfA killing factor production protect a Bacillus subtilis lipase against degradation2005

    • 著者名/発表者名
      Westers, H. et al.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. 71

      ページ: 1899-1908

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of the replication region of plasmid pLS32 from the Natto strain of Bacillus natto2005

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, T. et al.
    • 雑誌名

      J. Bacteriol. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Genes for SkfA killing factor production protect a Bacillus subtilislipase against degradation.2005

    • 著者名/発表者名
      Westers, H., Peter G., Braun, P., Westers, L., Antelmann, H., Hecker, M., Jongbloed, J.D.H., Yoshikawa, H., Tanaka, T., van Dijl, J.M.l., Quax, W.J.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. in press

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA(YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repressor for the alkaline exprotease gene, aprE.2004

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M.et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 186

      ページ: 3056-3064

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative analysis of the physical maps of four Bacillus subtilis (natto) genomes.2004

    • 著者名/発表者名
      Qui, D.et al.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. 70

      ページ: 6247-6256

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE2004

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M. et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 186

      ページ: 3056-3064

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparative analysis of the physical maps of four Bacillus subtilis (natto) genomes2004

    • 著者名/発表者名
      Qui, D.et al.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. 70

      ページ: 6247-6256

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bacillus subtilis SalA(YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repress or for the alkaline exoprotease gene, aprE.2004

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M., Matsuzawa, A., Yoshikawa H., Tanaka, T.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 186

      ページ: 3056-3064

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Comparative analysis of the physical maps of four Bacillus subtilis (natto) genomes.2004

    • 著者名/発表者名
      Qiu D., Fujita, K., Sakuma, Y., Tanaka, T., Ohashi, Y., Ohshima, H., Tomita, M., Itaya, M.
    • 雑誌名

      Appl.Env.Microbiol. 70

      ページ: 6247-6256

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Involvement of ClpX Protein in the Post-Trancscriptional Regulation of a Competence Specific Transcription Factor, ComK Protein, of Bacillus subtilis.2003

    • 著者名/発表者名
      Nanamiya, H.et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 133

      ページ: 295-302

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes.2003

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, K.et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 100

      ページ: 4678-4683

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Inhibition of Bacillus subtilis aprE expression by lincomycin at the posttranscriptional level through inhibition of ppGpp synthesis.2003

    • 著者名/発表者名
      Arai, A.et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem 133

      ページ: 691-697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Binding of response regulator DegU to tne aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis.2003

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M.et al.
    • 雑誌名

      Mol.Microbiol. 49

      ページ: 1685-1697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Involvement of ClpX Protein in the Post-Transcriptional Regulation of a Competence Specific Transcription Factor, ComK Protein, of Bacillus subtilis2003

    • 著者名/発表者名
      Nanamiya, H. et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 133

      ページ: 295-302

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Essential Bacillus subtilis genes2003

    • 著者名/発表者名
      Kobayashi, K. et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.U S A. 100

      ページ: 4678-4683

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Inhibition of Bacillus subtilis aprE expression by lincomycin at the posttranscriptional level through inhibition of ppGpp synthesis2003

    • 著者名/発表者名
      Arai, A. et al.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 133

      ページ: 691-697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis2003

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M. et al.
    • 雑誌名

      Mol.Microbiol. 49

      ページ: 1685-1697

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK.2002

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M.et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol。 184

      ページ: 2344-2351

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation.2002

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M., Tanaka, T.
    • 雑誌名

      Frontiers in Bioscience 7

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 枯草菌コンピテンス転写因子ComKに制御される遺伝子の全ゲノム解析2002

    • 著者名/発表者名
      田中暉夫
    • 雑誌名

      ゲノムニュース No.4

      ページ: 22-23

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK.2002

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M. et al.
    • 雑誌名

      J.Bacteriol. 184

      ページ: 2344-2351

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation2002

    • 著者名/発表者名
      Ogura, M., Tanaka, T.
    • 雑誌名

      Frontiers in Bioscience 7

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Whole genome analysis of competence transcription factor ComK2002

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, T., Ogura, M.
    • 雑誌名

      Genome News (in Japanese) No.4

      ページ: 22-23

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ogura M., Shimane K., Asai K., Ogasawara N., Tanaka T.: "Binding of response regulator DegU to the aprE promoter is inhibited by RapG, which is counteracted by extracellular PhrG in Bacillus subtilis."Mol.Microbiol. 49. 1685-1697 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Arai A., Kawachi E., Hata M., Ogura M., Tanaka T.: "Inhibition of Bacillus subtilis aprE expression by lincomycin at the posttranscriptional level through inhibition of ppGpp synthesis."J.Biochem.. 134. 691-697 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ogawa M., Matsuzaka A., Yoshikawa H., Tanaka T.: "Bacillus subtilis SalA (YbaL) negatively regulates expression of scoC encoding the repressor for the alkaline exoprotease gene, aprE."J.Bacteriol.. (in press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ogura, M., Yamaguchi, H., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Fujita, Y., Tanaka, T.: "Whole-genome analysis of genes regulated by the Bacillus subtilis competence transcription factor ComK"J. Bacteriol.. 184. 2344-2351 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ogura, M., Tanaka, T.: "Recent progress in Bacillus subtilis two-component regulation"Frontiers in Bioscience. 7. d1815-d1824 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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