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ダウン症関連遺伝子の発現調節と蛋白の機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 14370323
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 胎児・新生児医学
研究機関杏林大学

研究代表者

清水 淑子  杏林大学, 保健学部, 教授 (50255410)

研究分担者 工藤 純  慶應義塾大学, 医学部, 助教授 (80178003)
松田 貴雄  九州大学, 生体防御医学研究所, 助手 (10304825)
田村 高志  杏林大学, 保健学部, 講師 (70146554)
八巻 明子  杏林大学, 保健学部, 助手 (40296546)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
14,000千円 (直接経費: 14,000千円)
2004年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2003年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2002年度: 6,800千円 (直接経費: 6,800千円)
キーワードダウン症 / SIM2 / DSCR4 / MNB / DYRK1A / 転写調節 / 核移行シグナル / ユビキチン化 / 標的遺伝子 / ARNT2 / デイファレンシャルデイスプレイ法 / CpGアイランドのメチル化 / 恒常発現細胞 / 定量RT-PCR / CpGアイランドメチル化
研究概要

1.ダウン症関連遺伝子SIM2,DSCR4,MNB/DYRK-1Aのプロモーター解析と転写調節因子の同定:プロモーター推定領域を含む欠失変異体や推定シスエレメントの突然変異体を作製し、T98グリオブラストーマ細胞を用いてデュアルルシフェラーゼアッセイやゲルシフトアッセイによりc-Myb,C/EBP結合部位がSIM2遺伝子の転写に重要であることを明らかにした。更にc-Myb,C/EBP β,C/EBP ε抗体を用いたクロマチン沈降法により、特異的にSIM2プロモーター領域の存在を確認した。またヒトSIM2プロモーター領域2.2kbを組み込んだトランスジェニックマウスを作製し、胎仔における発現を解析した。ヒト胎盤特異的に発現されるDSCR4遺伝子を発現する絨毛癌由来細胞JEG3,BeWoを用いてOLF1、E47結合配列が転写に重要であること、MNB/DYRK1A遺伝子の転写開始点は翻訳開始点上流nt-848で、SP1,Oct1,c-Myb結合部位が重要であることを示した。2.SIM1,SIM2蛋白の新規核移行シグナル:GFP融合遺伝子の発現観察によって核移行に必要十分な最小領域はSIM1ではaa368-388,SIM2ではaa367-389で、Arg367,Lys373,Pro385,Tyr386,Gln389を変異させると核局在に大きな変化が見られた。3.SIM2/ARNTヘテロダイマー形成:核移行シグナルを欠くSIM2はARNTまたはARNT2の共導入によって核移行した。SIM2-ARNTの結合にPAS1,PAS2ドメインが、SIM2-ARNT2の結合にはPAS2ドメインが必要であった。4.SIM2蛋白の標的遺伝子群の同定:樹立したSIM2遺伝子強制発現細胞株(HeLa-SIM2)と親細胞(HeLa-mock)から抽出したRNAを用いてDifferential Display法を行った。定量的RT-PCRを用いて確認し、現在2個の遺伝子(HAS2,HLCS)に注目して、プロモーター解析を行っている。5.SIM2蛋白のポリユビキチン化:SIM2蛋白は細胞内でポリユビキチン化され、その反応はParkinやHHARIのようなRING-IBR-RING型E3リガーゼが関与していることを見い出した。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2005 2004 2001 その他

すべて 雑誌論文 (13件) 図書 (2件) 文献書誌 (1件)

  • [雑誌論文] ダウン症関連遺伝子DSCR4の発現解析2005

    • 著者名/発表者名
      浅井聡子, 清水元, 八巻明子, 松田貴雄, 清水淑子
    • 雑誌名

      杏林医会誌 36

      ページ: 32-41

    • NAID

      110002702815

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Transcription factor single-minded 2 (SIM2) is ubiquitinated by the RING-IBR-RING-type E3 ubiquitin ligases2005

    • 著者名/発表者名
      Okui M., Yamaki A, Takayanagi A, Kudoh J, Shimizu N, Shimizu Y
    • 雑誌名

      Exp Cell Res (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression analysis of DSCR4 gene located on Down syndrome chromosomal region2005

    • 著者名/発表者名
      Asai, S., Shimizu, H., Yamaki, A., Matuda, T., Shimizu, Y.
    • 雑誌名

      J.Kyorin Med.Soc.(in Japanese) 36

      ページ: 32-41

    • NAID

      110002702815

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Transcription Factor Single-Minded 2 (SIM2) is ubiquitinated by the RING-IBR-RING-type E3 ubiquitin ligases2005

    • 著者名/発表者名
      Okui, M., Yamaki, A., Takayanagi, A., Kudoh, J., Shimizu, N., Shimizu, Y.
    • 雑誌名

      Exp.Cell Res. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ダウン症関連遺伝子DSCR4の発現解析2005

    • 著者名/発表者名
      浅井聡子, 清水元, 八巻明子, 松田貴雄, 清水淑子
    • 雑誌名

      杏林医学会雑誌 36・1(印刷中)

    • NAID

      110002702815

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM22004

    • 著者名/発表者名
      Yamaki A, Kudoh J, Shimizu N, Shimizu Y
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 313・3

      ページ: 482-488

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] bHLH-PASファミリー転写調節因子の分子生物学2004

    • 著者名/発表者名
      清水 淑子
    • 雑誌名

      杏林医会誌 35

      ページ: 158-166

    • NAID

      110002672218

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM22004

    • 著者名/発表者名
      Yamaki, A., Kudoh, J., Shimizu, N., Shimizu, Y.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 313

      ページ: 482-488

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular Biology of bHLH-PAS transcription factor family2004

    • 著者名/発表者名
      Shimizu, Y.
    • 雑誌名

      J.Kyorin Med.Soc.(in Japanese) 35

      ページ: 158-166

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM22004

    • 著者名/発表者名
      A Yamaki, J Kudoh, N Shimizu, Y Shimizu
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commum 313・3

      ページ: 482-488

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] BHLH-PASファミリー転写調節因子の分子生物学2004

    • 著者名/発表者名
      清水 淑子
    • 雑誌名

      杏林医学会雑誌 35・2

      ページ: 158-166

    • NAID

      110002672218

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms of human single-minded 2 (SIM2) gene expression : Identification of a promoter site in the SIM2 genomic sequence2001

    • 著者名/発表者名
      Yamaki A, Tochigi J, Kudoh J, Minoshima S, Shimizu N, Shimizu Y
    • 雑誌名

      GENE 270

      ページ: 265-275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular mechanisms of human single-minded 2 (SIM2) gene expression : Identification of a promoter site in the SIM22001

    • 著者名/発表者名
      Yamaki, A., Tochigi, J., Kudoh, J., Minoshima, S., Shimizu, N., Shimizu, Y.
    • 雑誌名

      Genomic Sequence, Gene 270

      ページ: 265-275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] スタンダード生化学 第6章II III IV2004

    • 著者名/発表者名
      清水 淑子
    • 出版者
      文光堂
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] スタンダー生化学 第6章II III IV2004

    • 著者名/発表者名
      清水 淑子
    • 出版者
      文光堂
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Akiko Yamaki, Jun Kudoh, Nobuyoshi, Shimizu, Yoshiko Shimizu: "A novel nuclear localization signal in the human single-minded proteins SIM1 and SIM2"Biochemistry and Biophysical Research Communications. 313. 482-488 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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