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DNA多型を用いた法歯学的個人識別における実用度の高い検査法の開発と精度の向上

研究課題

研究課題/領域番号 14370701
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 矯正・小児・社会系歯学
研究機関東京歯科大学

研究代表者

水口 清  東京歯科大学, 歯学部, 教授 (00133380)

研究分担者 花岡 洋一  東京歯科大学, 歯学部, 助教授 (30180912)
羽賀 俊明  東京歯科大学, 歯学部, 助手 (80287185)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
8,100千円 (直接経費: 8,100千円)
2004年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2003年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2002年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードミトコンドリアDNA多型 / Y染色体多型 / 系統分化 / 変性DNA / マイクロサテライト多型 / SNPs / 物体検査 / 地理的起源の推定 / ミトコンドリア / DNA多型 / 系統分類 / 日本人とマレー人 / 高度変性DNA / 個人識別 / マイクロサテライト / mtDNAのCoding region多型 / ミトコンドリアDNA多型の系統 / Y染色体DNA多型 / Y染色体上Alu配列 / Y染色体多型の系統 / アジア人集団の比較 / PCR法 / 法歯学的個人識別 / Y染色体STR多型 / Y染色体biallelic marker / 常染色体上のSTRとSNPs
研究概要

本研究は従来の歯科的個人識別法に加え,変性度合いの高い法医学上の生物学的資料から広範な情報を得て,個人識別精度をあげて行こうと計画したものである.初年度は211人の日本人のミトコンドリアDNA多型について、coding領域の系統と関連する多型検査を行い,最も詳細な日本人のmtDNAの系統を確立し,新しい系統を含めて33のハプログループに分類した.その後coding領域の多型を検索しながら、全mtDNAゲノムの情報に近い分類から106の系統と197型に分類した.続いて80人をデータベースに追加すると共に30人のマレー人について検査を行い、9種の新しい系統を見い出した。Y染色体多型については263人の資料について16種類のSTR多型の検査と、biallelic markerによる日本人の系統分化を明らかにし、同時にSTR多型からbiallelic markerによる系統が推測可能であることを示し、さらに47zの多型からbiallelic markerの系統を容易に推測する方法を見い出した。mtDNAとY染色体多型は、他のアジア人との比較から、個人識別対象者の地理的な起源の推測に有用であることをとを示した。変性度合いの異なるDNAを収集し、DNA変性がSTRとSNPs検査の際のPCRに及ぼす影響とcontaminationの影響について系統的に検査を行い、高度変性DNAの検査ではSNPsがSTRより信頼度が高いことを示した。また唾液タンパク関連遺伝子familyの多型検査と共に歯科臨床に係わる基礎的研究を行った。
以上のごとく、当該年度において、私達は高度変性DNA検査においてはSNPsの多型検査が信頼度が高いことを示すとともに、mtDNA、Y染色体多型を中心にSNPsの知見を増加した。本研究成果は法歯学実際面におけるDNA多型検査に、極めて有用な知識を提供したものと考えている。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (35件)

すべて 2005 2004 2003 2002 その他

すべて 雑誌論文 (27件) 文献書誌 (8件)

  • [雑誌論文] A point mutation of the ED1 gene in a Japanese family with X-linked hypohidrotic ectodermal dysplasia2005

    • 著者名/発表者名
      Sekiguchi H et al.
    • 雑誌名

      J Pediatric Dent 15

      ページ: 73-77

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Influence of template DNA degradation on the genotypong of SNPs an and STR polymorphisms from forensic materials by PCR.2004

    • 著者名/発表者名
      Utsuno H, Minaguchi K
    • 雑誌名

      Bull Tokyo Dent Coll 45

      ページ: 33-64

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Y染色体上の高変異座位47z2004

    • 著者名/発表者名
      野中 育, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.12

      ページ: 99-102

    • NAID

      10013660838

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] ミトコンドリアDNAのcoding領域の多型と系統分化2004

    • 著者名/発表者名
      丸山 澄, 野平千鶴, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.12

      ページ: 246-248

    • NAID

      10013661148

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cystatin SA, a cysteine poteinase inhibitor, induces interferon-γ expression in CD-4 positive T cells2004

    • 著者名/発表者名
      Kato T et al.
    • 雑誌名

      Biol Chem 385

      ページ: 419-422

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A point mutation of the EDI gene in a Japanese family with X-linked hypohidrotic ectodermal dysplasia.2004

    • 著者名/発表者名
      Sekiguchi H et al.
    • 雑誌名

      Int J Pediat Dent 15

      ページ: 73-75

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Y chromosomal hypervariable locus 47z.2004

    • 著者名/発表者名
      Nonaka I, Minaguchi K
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.12

      ページ: 99-102

    • NAID

      10013660838

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic analysis of mtDNA lineages by sequence polymorphisms of the coding region.2004

    • 著者名/発表者名
      Maruyama S, Nohira C, Minaguchi K
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.12

      ページ: 246-248

    • NAID

      10013661148

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cystatin SA, a cysteine poteinase inhibitor, induces interferon-γ expression in CD-4 positive T cells.2004

    • 著者名/発表者名
      Kato T et al.
    • 雑誌名

      Biol Chem 285

      ページ: 419-422

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Influence of template DNA degradation on the genotyping of SNPs and STR polymorphisms from forensic materials by PCR2004

    • 著者名/発表者名
      Utsuno H, Minaguchi K
    • 雑誌名

      Bull Tokyo Dent Coll 45・1

      ページ: 33-64

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] ミトコンドリアDNAのcoding領域の多型と系統分化2004

    • 著者名/発表者名
      丸山 澄, 野平 千鶴, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.12

      ページ: 246-248

    • NAID

      10013661148

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] DNA analysis of neonatal human remains wrapped and kept in a vinyl bag for 15 years2003

    • 著者名/発表者名
      Minaguchi K et al.
    • 雑誌名

      Legal Medicine 5

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 日本人におけるmtDNAの系統分化2003

    • 著者名/発表者名
      丸山 済, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.11

      ページ: 235-237

    • NAID

      10013995807

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 日本人におけるY染色体多型の系統分化2003

    • 著者名/発表者名
      野中 育, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.11

    • NAID

      10013995816

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] シスタチンによるヒト細胞からのサイトカイン産生誘導2003

    • 著者名/発表者名
      加藤哲男 他
    • 雑誌名

      消化器と免疫 40

      ページ: 23-25

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population.2003

    • 著者名/発表者名
      Maruyama S, Minaguchi K, Saitou N
    • 雑誌名

      Int J Legal Med 117

      ページ: 218-225

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DNA analysis of neonatal human remains wrapped and kept in a vinyl bag for 15 years.2003

    • 著者名/発表者名
      Minaguchi K et al.
    • 雑誌名

      Legal Medicine 5

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic differentiatin of mtDNA polymorphisms in the Japanese population.2003

    • 著者名/発表者名
      Maruyama S, Minaguchi K
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.11

      ページ: 235-237

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Phylogenetic differentiatin of Y chromosome polymorphisms in the Japanese population.2003

    • 著者名/発表者名
      Nonaka I, Minaguchi K
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.11

      ページ: 238-241

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Induction of cytokine production from human cells by cystatins.2003

    • 著者名/発表者名
      Kato T et al.
    • 雑誌名

      Shoukaki to Meneki 40

      ページ: 23-25

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population.2003

    • 著者名/発表者名
      Maruyama S, Minaguchi K, Saitou N
    • 雑誌名

      Int J Leg Med 117

      ページ: 218-225

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Influence of template DNA degradation on the genotypong of SNPs an and STR polymorphisms from forensic materials by PCR.2003

    • 著者名/発表者名
      Utsuno H, Minaguchi K
    • 雑誌名

      Bull Tokyo Dent Coll 45

      ページ: 33-46

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 日本人のmtDNAハプロタイプと人種との比較2002

    • 著者名/発表者名
      丸山 澄, 水口 清, 斉藤成也
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.10

      ページ: 156-159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Y染色体上のSNPsとハプロタイプ解析2002

    • 著者名/発表者名
      野中 育, 水口 清
    • 雑誌名

      DNA多型 Vol.10

      ページ: 176-178

    • NAID

      10013994971

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Salivary cystatins induce interleukin-6 expression via surface molecules in human gingival fibroblasts.2002

    • 著者名/発表者名
      Kato T et al.
    • 雑誌名

      Mol Immunol 39

      ページ: 423-430

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Haprogroups of mitochondrial DNA control region lineages in the Japanese population and comparison with other ethnis groups.2002

    • 著者名/発表者名
      Maruyama S, Minaguchi K, Saitou N
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.10

      ページ: 156-159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Y chromosome SNPs and haplotypes.2002

    • 著者名/発表者名
      Nonaka I, Minaguchi K
    • 雑誌名

      DNA polymorphisms Vol.10

      ページ: 176-178

    • NAID

      10013994971

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Minaguchi, K. et al.: "DNA analysis of neonatal human remains wrapped and kept in a vinyl bag for 15 years"Legal Medicine. 5. S183-S186 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 丸山 済, 水口 清: "日本人におけるmtDNAの系統分化"Legal Medicine. 5. 235-237 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 野中 育, 水口 清: "日本人におけるY染色体多型の系統分化"DNA多型. Vol.11. 238-241 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Maruyama, S., Minaguchi, K., Saitou, N.: "Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population."Int J Legal Med. 117. 218-215 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 丸山 澄, 水口 清, 斉藤成也: "日本人のmtDNAハプロタイプと人種との比較"DNA多型. Vol.10. 156-159 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 野中 育, 水口 清: "Y染色体上のSNPsとハプロタイプ解析"DNA多型. Vol.10. 176-178 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kato, T. et al.: "Salivary cystatins induce interleukin-6 expression via surface molecules in human gingival fibroblasts"Mol Immunol. 39. 423-430 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Minaguchi, K. et al.: "DNA analysis of neonatal human remains wrapped and kept in a vinyl bag for 15 years"Legal Medicine. 5(In press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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