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遺伝子発現におけるマルチ亜鉛フィンガーの役割とそのアーキテクチャーの創製

研究課題

研究課題/領域番号 14370755
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 医薬分子機能学
研究機関京都大学

研究代表者

杉浦 幸雄  京都大学, 化学研究所, 教授 (40025698)

研究分担者 永岡 真  京都大学, 化学研究所, 助手 (60314275)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
14,800千円 (直接経費: 14,800千円)
2004年度: 4,300千円 (直接経費: 4,300千円)
2003年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2002年度: 6,900千円 (直接経費: 6,900千円)
キーワード亜鉛フィンガー / マルチフィンガー / 分子設計 / 転写因子 / DNA認識 / アーキテクチャー / 塩基特異性 / 人工タンパク質 / 遺伝子発現 / タンパク質工学 / タンパク質設計
研究概要

3〜15個の亜鉛フィンガーモチーフを持つ天然および人工マルチ亜鉛フィンガー蛋白質を単離又は創製し、DNA/RNA認識におけるマルチ亜鉛フィンガーの順列や数の変化を追究した。即ち、亜鉛フィンガー蛋白質の核酸結合は、そのレパートリーの中から順列や数を変えて用いることによって遺伝子発現を調節し、このことによって1つのマルチ亜鉛フィンガー蛋白質が幾つもの転写蛋白質を用いるのと同じ役割を演じて、それぞれ腹個の転写因子を用意する手間を節約していることが暗示された。また、個々の亜鉛フィンガーは柔軟な連結部でつながれ、それぞれ独立した"読み取りヘッド"として機能しているように推定されているが、マルチ亜鉛フィンガーの存在は、DNA認識における相補性・共同性によって、核酸結合の親和性や選択性の上昇に大きく寄与している可能性が指摘された。転写因子Sp1由来の3つの亜鉛フィンガーを1ユニットとして、ユニット同志を遺伝子工学的手法を用いて連結させることにより、15個の亜鉛フィンガーを有する新規タンパク質を精製・単離した。ユニット間のリンカー部分には多くの亜鉛フィンガーのリンカー領域に保存されているアミノ酸配列(TGEKP)を採用したが、リンカー配列の影響を検討するため転写因子TFIIIAタイプのリンカーを有する15-亜鉛フィンガータンパク質も創製した。これら新規マルチ亜鉛フィンガータンパク質のDNA結合性を詳細に調べるためGC配列に富んだDNAを新たに調整し、ゲルシフト法・フットプリント法などを駆使した。その結果、45塩基対にも及ぶ5個の連続したGCボックスに特異的に結合できることが判明した。また、GCボックス内にATミスマッチを導入したDNAに対する結合性についても検討した。本研究によって遺伝子調節におけるマルチ亜鉛フィンガーの重要な役割が明らかにされた。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2004 2003 2002 その他

すべて 雑誌論文 (12件) 文献書誌 (6件)

  • [雑誌論文] Creation and Characteristics of Unnatural CysHis_3-Type Zinc Finger Protein2004

    • 著者名/発表者名
      S.Negi
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 325・2

      ページ: 421-425

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence-Selective and Hydrobytic Cleavage of DNA by Zinc Finger Mutants2004

    • 著者名/発表者名
      A.Nomura
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 126・47

      ページ: 15374-15375

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Creation and Characteristics of Unnatural CysHis_3-Type Zinc Finger Protein2004

    • 著者名/発表者名
      Negi, S. et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 325(2)

      ページ: 421-425

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sequence-Selective and Hydrobytic Cleavage of DNA by Zinc Finger Mutants2004

    • 著者名/発表者名
      Nomura, A. et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 126(47)

      ページ: 15374-15375

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Influence of TFIIIA-Type Linker at the N- or C-Terminal of Nine-Zinc Finger Protein on DNA-Binding Site2003

    • 著者名/発表者名
      W.Nomura
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 300・1

      ページ: 87-92

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of Length and Position of an Extended Linker on Sequence-Selective DNA Recognition of Zinc Finger Peptides2003

    • 著者名/発表者名
      W.Nomura
    • 雑誌名

      Biochemistry 42・5

      ページ: 14805-14813

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Influence of TFIIIA-Type Linker at the N- or C-Terminal of Nine-Zinc Finger Protein on DNA-Binding Site2003

    • 著者名/発表者名
      Nomura, W. et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 300(1)

      ページ: 87-92

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of Length and Position of an Extended Linker on Sequence-Selective DNA Recognition of Zinc Finger Peptides2003

    • 著者名/発表者名
      Nomura, W. et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 42(50)

      ページ: 14805-14813

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Artificial DNA-Bending Six-Zinc Finger Peptides with Different Charged Linkers : Distinct Kinetic Properties of DNA Bindings2002

    • 著者名/発表者名
      M.Imanishi
    • 雑誌名

      Biochemistry 41・4

      ページ: 1328-1334

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel Strategy for the Design of a New Zinc Finger : Creation of a Zinc Finger for the AT-Rich Sequence by α-Helix Substitution2002

    • 著者名/発表者名
      M.Nagaoka
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 124・23

      ページ: 6526-6527

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Artificial DNA-Bending Six-Zinc Finger Peptides with Different Charged Linkers : Distinct Kinetic Properties of DNA Bindings2002

    • 著者名/発表者名
      Imanishi, M. et al.
    • 雑誌名

      Biochemistry 41(4)

      ページ: 1328-1334

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel Strategy for the Design of a New Zinc Finger : Creation of a Zinc Finger for the AT-Rich Sequence by α-Helix Substitution2002

    • 著者名/発表者名
      Nagaoka, M. et al.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 124(23)

      ページ: 6526-6527

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Matsushita: "GFP-Linked Zinc Finger Protein Sp1 : Fluorescence Study and Implication for N-Terminal Zinc Finger 1 as Hinge Finger"Bioorg.Med.Chem.. 11・1. 53-58 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] W.Nomura: "Influence of TFIIIA-Type Linker at the N- or C-Terminal of Nine-Zinc Finger Protein on DNA-Binding Site"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 300・1. 87-92 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] W.Nomura: "Effects of Length and Position of an Extended Linker on Sequence-Selective DNA Recognition of Zinc Finger Peptides"Biochemistry. 42・50. 14805-14813 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] M.Imanishi: "Artificial DNA-Bending Six-Zinc Finger Peptides with Different Charged Linkers : Distinct Kinetic Properties of DNA Bindings"Biochemistry. 41・4. 1328-1334 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "Novel Strategy for the Design of a New Zinc Finger : Creation of a Zinc Finger for the AT-Rich Sequence by α-Helix Substitution"J. Am. Chem. Soc.. 124・23. 6526-6527 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] A.Nomura: "Contribution of Individual Zinc Ligands to Metal Binding and Peptide Folding of Zinc Finger Peptides"Inorg. Chem.. 41・14. 3693-3698 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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