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質量分析によるタンパク質翻訳後修飾のダイナミズム解析

研究課題

研究課題/領域番号 14380293
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

高尾 敏文  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (10197048)

研究期間 (年度) 2002 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
9,500千円 (直接経費: 9,500千円)
2003年度: 3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2002年度: 5,800千円 (直接経費: 5,800千円)
キーワード質量分析 / 分子質量 / 精密質量測定 / ナノエレクトロスプレーイオン化 / リン酸化 / メチオニンスルフォキシド / ヒストン / トリメチルリシン / タンパク質 / 翻訳後修飾 / アセチル化 / アポトーシス / エレクトロスプレーイオン化 / ソフトウェアー / 修飾構造 / メチル化 / ESI / MALDI
研究概要

真核生物で生合成されるタンパク質の多くは、ゲノム情報にはない翻訳後修飾を受けている。未知のものも含めて翻訳後修飾は多種多様の構造を有し、生理機能に深く関わっている。さらに、タンパク質はリン酸化やアセチル化等の可逆的修飾反応によって生理機能が厳密に調節されている。本研究は、様々な生理的条件下で刻々と変化する翻訳後修飾のダイナミズムを解析する目的で、タンパク質翻訳後修飾の構造解析を効率よく行うための方法論ならびに技術開発と種々の修飾基をもつタンパク質の測定、構造解析を行った。その結果、ナノエレクトロスプレーイオン化において精密質量測定を行える方法を考案した。市販のインターフェースを改造して試作したものを用いて行った測定では、サブピコモル量の試料(分子量〜1000)で5ppm以内の誤差でMS及びMS/MSにおける分析が可能であった。これにより、未知の修飾やMS/MSにおいて帰属できない断片イオンの構造を確実に推定できるようになるものと考えられる。また、本インターフェースはオンラインLC-MS、MS/MSのみならず、オフラインの測定にも利用可能であり、汎用性も高い。
ヒストンの種々の修飾基の解析から、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析において特徴的に観測されるトリメチルリシン特異的なフラグメントイオンを見出した。
今後、本研究で得た結果、方法をプロテオミクス研究の最重要課題の一つである"翻訳後修飾の解析"に応用していきたい。

報告書

(3件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (29件)

  • [文献書誌] Konishi, A. et al.: "Involvement of Histone H1.2 in Apoptosis Induced by DNA Double-Strand Breaks."Cell. 114. 673-688 (2003)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Minamino, N. et al.: "Determination of endogenous peptides in the porcine brain : possible construction of Peptidome, a fact database for endogenous peptides."Journal of Chromatography B.. 792. 33-48 (2003)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tsuchiya, K. et al.: "Molecular cloning and characterization of TPP36 and its isoform TPP32, novel substrates of Abl tyrosine Kinase."WEBS Letters.. 537. 203-209 (2003)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mizushima, N. et al.: "Mouse Apg16L, a novel WD-repeat protein, target to the autophagic isolation membrane with the Apg12-Apg5 conjugate."Journal of Cell Science. 16. 1679-1688 (2003)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hirota, J. et al.: "ε-N,N,N-Trimethyllysine-specific ions in matrix-assisted laser desorption/ionization-tandem mass spectrometry."Rapid Commun.Mass Spectrom.. 17. 371-376 (2003)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shen, S. et al.: "A proteomic analysis of leaf sheaths from rice."J.Biochem.. 132. 613-620 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 廣田淳子, 高尾敏文: "化学、ヒストンコード-ヒストン翻訳後修飾のダイナミズムと生理的意義-"化学同人. 56-57 (2002)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Konishi, A.et al.: "Involvement of Histone Hi.2 in Apoptosis Induced by DNA Double-Strand Breaks."Cell. 114. 673-688 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tsuchiya, K.et al.: "Molecular cloning and characterization of TPP36 and its isoform TPP32, novel substrates of Ab1 tyrosine Kinase."FEBS Letters. 537. 203-209 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Minamino, N.et al.: "Determination of endogenous peptides in the porcine brain: possible construction of Peptidome, a fact database for endogenous peptides."Journal of Chromatography B.. 792. 33-48 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mizushima, N.et al.: "Mouse Apgl6L, a novel WD-repeat protein, target to the autophagic isolation membrane with the Apgl2-Apg5 conjugate."Journal of Cell science. 16. 1679-1688 (2003)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hirota, J.et al.: "ε-N, N, N-Trimethyllysine-specific ions in matrix-assisted laser desorption/ionization-tandem mass spectrometry."Rapid Commun.Mass Spectrom.. 17. 371-376 (2003)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakamura A.et al.: "Analysis of the molecular construction of xylogalacturonan isolated from soluble soybean polysaccharides."Biosci.Biotechnol.Biochem.. 66. 1155-1158 (2002)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakamura A.et al.: "Structural studies by stepwise enzymatic degradation of the main backbone of soybean soluble polysaccharides consisting of galacturonan and rhamnogalacturonan."Biosci.Biotechnol.Biochem.. 66. 1301-1313 (2002)

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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shen S.et al.: "A proteomic analysis of leaf sheaths from rice."J.Biochem.(Tokyo). 132. 613-620 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shime H.et al.: "Association of Pasteurella multocida toxin with vimentin."Infect.Immun.. 70. 6460-6463 (2002)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakai D.et al.: "Mouse homologue of coq7/clk-l, longevity gene in Caenorhabditis elegans, is essential for coenzyme Q synthesis, maintenance of mitochondrial integrity, and neurogenesis."Biochem.Biophys.Res.Commun.. 289. 463-471 (2001)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Konishi, A. et al.: "Involvement of histone H1.2 in apoptosis induced by DNA double-strand breaks."Cell. 114. 673-688 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Minamino, N. et al.: "Determination of endogenous peptides in the porcine brain : possible construction of peptidome, a fact database for endogenous peptides."J. Chromatography B.. 792. 33-48 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuchiya, K. et al.: "Molecular cloning and characterization of TPP36 and its isoform TPP32, novel substrates of Abl tyrosine kinase."FEBS Lett.. 537. 203-209 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Mizushima, N. et al.: "Mouse Apg16L, a novel WD-repeat protein, targets to the autophagic isolation membrane with the Apg12-Apg5 conjugate"J. Cell Science. 16. 1679-1688 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Takao, T.: "Proteomics Research by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry"The review of laser engineering. 31. 13-15 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 高尾敏文(分担): "質量分析による蛋白質の配列分析、臨床検査 47巻 11号"医学書院. 1253-1527 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura, A., et al.: "Structural studies by stepwise enzymatic degradation of the main backbone of soybean soluble polysaccharides consisting of galacturonan and rhamnogalacturonan"Biosci. Biotechnol. Biochem. 66. 1301-1313 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Nakamura, A., et al.: "Analysis of the molecular construction of xylogalacturonan isolated from soluble soybean polysaccharides"Biosci. Biotechnol. Biochem. 66. 1155-1158 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Shen S., et al.: "A proteomic analysis of leaf sheaths from rice"J. Biochem(Tokyo). 132. 613-620 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Shime, H., et al.: "Association of Pasteurella multocida toxin with vimentin"Infect. Immun. 70. 6460-6463 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hirota, J., et al.: "ε-N,N,N-Trimethyllysine-specific ions in matrix-assisted laser desorption/ionization-tandem mass spectrometry"Rapid Commun. Mass Spectrom. 17. 371-376 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 廣田淳子, 高尾敏文: "ヒストンコード"ヒストン翻訳後修飾のダイナミズムとその生理的意義「化学」"共立出版. 56-57(分担) (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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