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DNAマーカーを利用した選抜方法の効率評価と最適化に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 14560008
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 育種学
研究機関京都産業大学

研究代表者

米澤 勝衛  京都産業大学, 工学部, 教授 (90026542)

研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2004年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2003年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2002年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
キーワードDNAマーカー / マーカー選抜 / MBS : Marker-based selection / 選抜効率 / 世代促進育種 / 倍加半数体育種 / 自殖性植物 / 多段階選抜 / 成功確率 / 過去情報 / 逆分数重みづけ / 収量検定試験 / モンテ・カルロ・シミュレーション / 逆分散量みづけ
研究概要

自殖性植物における2つの慣行的育種方法、すなわち世代促進集団育種法(GAB)と倍加半数体育種法(DHB)の効率化を計る上で、優良遺伝子との連鎖がわかっているDNAマーカーによる選抜(MBS:Marker-based selection)を組み込んで用いることが有効であるか否かを(目的とする優良遺伝子型の選抜確率の増減で判定)コンピュータシミュレーションによって検討した。GABの場合は、通常無選抜で経過するF_2とF_3集団にMBSを適用した場合の効果を検討し、以下の結論を得た。MBSの効果は、育種目標に関与する遺伝子座数と利用できるマーカーの数に依存し、大まかに言って、前者が12個以上でそのうちの数個以上についてマーカー選抜が可能であれば顕著な効果が期待できる。この場合、MBSの対象であるF_2とF_3集団のサイズがたった100個体くらいであっても、2000個体で世代促進のみを行う通常のGABよりも効率的である。MBSの効果は、優良遺伝子の相反連鎖が多いほど増加し、相引連鎖が多いほど減少する。現実に考えられるほとんどの場合、共優性マーカーのほうが優性マーカーよりも効果的であるが、関与する遺伝子座数が比較的少なくしかも優良遺伝子の多くが相引連鎖している場合は、優性マーカーのほうが効果的である。共優性マーカーを数個以上用いて選抜を行う場合は、ホモ個体だけでなく、ある程度ヘテロ性の高い個体も合わせて選抜することが大切である。MBSをDHBと組み合わせて用いた場合はGABの場合ほど効果的ではないが、関与する遺伝子座数が多くかつ優良遺伝子の多くが互いに相反連鎖している場合には、作出直後の倍加半数体幼個体の中から有望遺伝子型個体を選び出す場面、あるいは、F_2幼個体の中から倍加処理に適した個体を選び出す場面などで、MBSを有効な補助手段として用いることができる。

報告書

(4件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2004 2003 2002 その他

すべて 雑誌論文 (11件) 図書 (1件) 文献書誌 (8件)

  • [雑誌論文] The effective size of mixed sexually and asexually reproducing populations.2004

    • 著者名/発表者名
      Yonezawa, K., Ishii, T., Nagamine T.
    • 雑誌名

      Genetics 166

      ページ: 1529-1539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The effective size of mixed sexually and asexually reproducing populations2004

    • 著者名/発表者名
      Yonezawa, K., Ishii, T., Nagamine T.
    • 雑誌名

      Genetics 166

      ページ: 1529-1539

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] MBSの適用による半数体育種法の効率化2004

    • 著者名/発表者名
      米澤勝衛, 石井卓朗
    • 雑誌名

      育種学研究 6・別冊2

      ページ: 250-250

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] MBS(marker-based selection)の適用による世代促進集団育種法の効率化2004

    • 著者名/発表者名
      石井卓朗, 米澤勝衛
    • 雑誌名

      育種学研究 6・別冊2

      ページ: 249-249

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 成功確立による生産力検定試験方式の最適化:遺伝子型×場所交互作用が大きい場合の最適方式について2004

    • 著者名/発表者名
      石井卓朗, 米澤勝衛
    • 雑誌名

      育種学研究 6・別冊1

      ページ: 325-325

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Range of application of inverse variance weighting for using historical information in stepwise yield screening of plant varieties.2003

    • 著者名/発表者名
      Ishii, T., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 53

      ページ: 305-312

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparison of three different patterns of multi-step yield screening for a finite population of test varieties with a continuous yield distribution.2003

    • 著者名/発表者名
      Ishii, T., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 53

      ページ: 15-20

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Range of application of inverse variance weighting for using historical information in stepwise yield screening of plant varieties2003

    • 著者名/発表者名
      Ishii, T., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 53

      ページ: 305-312

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Comparison of three different patterns of multi-step yield screening for a finite population of test varieties with a continuous yield distribution2003

    • 著者名/発表者名
      Ishii, T., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 53

      ページ: 15-20

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cost efficiency of spatial error control in single plant selection.2002

    • 著者名/発表者名
      Yano, K., Ohsawa, R., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 52

      ページ: 177-184

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Cost efficiency of spatial error control in single plant selection2002

    • 著者名/発表者名
      Yano, K., Ohsawa, R., Yonezawa, K.
    • 雑誌名

      Breeding Science 52

      ページ: 177-184

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] 野生イネの自然史(森島編)、第2章2003

    • 著者名/発表者名
      米澤勝衛
    • 出版者
      北海道大学図書刊行会
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ishii, K.Yonezawa: "Range of application of inverse variance weighting for using historical information in stepwise yield screening of plant varieties"Breeding Science. 53. 305-312 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 石井卓朗, 米澤勝衛: "他殖性作物の主要選抜方式の効率比較:ドミナンスが存在する場合"育種学研究. 5・別1. 202 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] K.Yano, R.Ohsawa, K.Yonezawa: "Cost efficiency of spatial error control in single plant selection"Breeding Science. 52・3. 177-184 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ishii, K.Yonezawa: "Comparison of three different patterns of multi-step yield screening for a finite population of test varieties with..."Breeding Science. 53・1(in press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 米澤勝衛, 石井卓朗: "確率効率指数による選抜方法の最適化:他殖性植物における主要選抜方式の効率比較"育種学研究. 4・別1. 99 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 石井卓朗, 米澤勝衛: "確率理論モデルによる生産力検定試験方式の検討:多年次データを用いた一括選抜方式との比較による多段階選抜方式の有効性"育種学研究. 4・別1. 100 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 石井卓朗, 米澤 勝衛: "他殖性作物の主要選抜方式の効率比較:反復区を設定した場合"育種学研究. 4・別2. 160 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 米澤勝衛(森島編): "野生イネの自然史,第II部,第2章"北大出版(印刷中). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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