ABO分泌型遺伝子FUT2多型の世界の諸集団における分布

• 研究課題/領域番号: 14570399
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 法医学
• 研究機関: 久留米大学
• 研究代表者: KWESI Teye (2003) 久留米大学, 医学部, 助手 (80352128); 木村 博司 (2002) 久留米大学, 医学部, 教授 (20112039)
• 研究分担者: 岡村 寅彦 久留米大学, 医学部, 助手 (60343688) ; 副島 美貴子 久留米大学, 医学部, 助手 (80279140) ; 神田 芳郎 久留米大学, 医学部, 教授 (90231307) ; KWESI Teye 久留米大学, 医学部, 助手 (80352128)
• 研究期間 (年度): 2002 – 2003
• 研究課題ステータス: 完了 (2003年度)
• 配分額: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円); 2003年度: 900千円 (直接経費: 900千円); 2002年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
• キーワード: FUT2 / 分泌型 / SNPs / ニューギニア / スリランカ / 多様性 / null allele / タミル / シンハラ / Papua New Guinea / Irianese

研究概要

ニューギニアとスリランカの集団についてFUT2多型解析をおこなった。ニューギニアに関してはIrianese90名Admixed Irianese101名、Papua New Guineans32名、スリランカではSinhalese54名、Tamil58名についてFUT2コーディングエクソンをPCR増幅しダイレクトシークエンスをおこなった。これまで解析した集団では非分泌型アレルの頻度は約50%であったがIrianeseでは1人が分泌型とのヘテロ接合体でAdmixed Irianeseでも10〜20%と非常に低かった。分泌型アレルではニューギニア人に特徴的なものが比較的高い頻度で存在し、そのうちSe^<375>はアフリカ人にのみ低頻度認められているものであった。他の人種との遺伝的な距離を調べた結果近隣のインドネシア、サモアの集団からも分化しておりニューギニア人が比較的早い時期にアフリカから移住し近隣の人種から隔離していた可能性が示された。スリランカでは二つの集団ともアレルの構成はバングラディッシュと似ていたがSinhaleseでは非分泌型アレルの割合が38%であるのに対しTamilでは53%であり主要な非分泌型アレルが異なっていた。またバングラディッシュ人で13%を占めたアジア人特異的なse^<385>は見出だされずイラン人に認めたSe^<278>が存在した。これらの結果からスリランカの2集団は遺伝的に同一ではなく、またアジア人の影響が少ないということが示唆された。さらにFUT2の3.8kb下流のSTR多型解析の結果、アフリカ人は最も多様性が高くヨーロッパ人、日本人とハプロタイプの一部を共有しアフリカ起源説を裏付ける結果となり、またコーディング多型と同様人種差が存在した。
以上、本研究によりFUT2が人種特異的な多型パターンを有することがさらに示された。

研究成果

• [文献書誌] Pang H, Soejima M, Koda Y, Kimura H.: "A novel tetrameric short tandem repeat located in the 3'flanking region of the human ABO-Secretor gene (FUT2) and association between FUT2 and FUT2/01"Hum Biol.. (In press). (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Ishida T, Tachida H, Wang B, Pang H, Soejima M, Soemantri A, Kimura H: "DNA sequence variation of the human ABO-secretor locus (FUT2)in New Guinean populations : possible early human migration from Africa."Hum Genet.. 113. 534-541 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Tachida H, Soejima M, Takenaka O, Kimura H.: "Population differences in DNA sequence variation and linkage disequilibrium at the PON1 gene."Ann Hum Genet.. 68. 110-119 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Teye K, Quaye I, Koda Y, Soejima M, Pang H, Tsuneoka M, Amoah AG, Adjei A, Kimura H.: "A novel I247T missense mutation in the haptoglobin 2 beta-chain decreases the expression of the protein and is associated with ahatolobinemia."Hum Genet.. 114. 499-502 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Teye K, Tsuneoka M, Arima N, Koda Y, Nakamura Y, Ueta Y, Shirouzu K, Kimura H: "Increase expression of a Myc target gene Mina53 in human colon cancer."Am J Pathol.. 164. 205-216 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Teye K, Quaye I, Koda Y, Soejima M, Tsuneoka M, Pang H, Ekem I, Amoah A, Adjei A, Kimura H.: "A-61C and C-101G Hp gene promoter polymorphisms are, respectively associated with ahaptoglobinaemia and hypohaptoglobinaemia in Ghana."Clin Genet.. 64. 439-443 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Tsuneoka M, Umata T, Kimura H, Koda Y, Nakajima M, Kosai K, Takahashi T, Takahashi Y, Yamamoto A.: "c-Myc induces autophagy in rat 3Yl fibroblast cells."Cell Struct Funct.. 28. 195-204 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Seto Y, Takeichi S, Kimura H.: "Fatal subarachnoid hemorrhage complicating actinomycotic meningitis."Forensic Sci Int.. 134. 169-171 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Amano S, Yamagishi S, Koda Y, Tsuneoka M, Soejima M, Okamoto T, Inagaki Y, Yamada K, Kimura H.: "Polymorphisms of sorbitol dehydrogenase (SDH) gene and susceptibility to diabetic retinopathy."Med Hypotheses.. 60. 550-551 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Pang H, Koda Y, Yamagishi SI, Amano S, Inagaki Y, Okamoto T, Yamada K, Kimura H.: "N-acetylglucosamine-phosphate mutase genotype and diabetic microvascular complications."Diabetic Med.. 20. 419-420 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Yamagishi S, Amano S, Inagaki Y, Okamoto T, Koda Y. Soejima M, Kimura H.: "Pigment epithelium-derived factor Met72Thr polymorphism in patients with diabetic icroangiopathy."Int J Clin Pharmacol Res.. 22. 67-71 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Yamagishi S, Amano S, Okamoto T, Inagaki Y, Yamada K, Kimura H.: "Haptoglobin genotype and diabetic microangiopathies in Japanese diabetic patients."Diabetologia.. 45. 1039-1040 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Pang H, Koda Y, Soejima M, Kimura H.: "Identification of human phosphoglucomutase 3 (PGM3) as N-acetylglucosamino-phospate mutase (AGM1)."Ann Hum Genet.. 66. 139-144 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Tsuneoa M, Koda Y, Soejima M, Teye K, Kimura H.: "A novel myc target gene, mina53, that is involved in cell proliferation."J Biol Chem.. 277. 35450-35459 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Wang B, Pang H, Koda Y, Soejima M, Kimura H.: "Polymorphisms of eight STR loci in Chinese and African (Xhosa) populations."Forensic Sci Int.. 125. 279-280 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Tsuneoka M, Yasumoto K, Higashitani T, Sagawa K, Kimura H.: "Hetorozygosity for two novel null alleles of the KEL gene causes the Kell-null phenotype in a Japanese woman."Br J Haematol.. 117. 220-225 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Nakayama K, Fukamachi S, Kimura H, Koda Y, Soemantri A, Ishida T.: "Distinctive distribution of AIM1 polymorphism among major human populations with different skin color."J Hum Genet.. 47. 92-94 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Sato H, Maeda Y, Kimura H.: "Three-base deletion and one-base insertion of the alpha(1,4)galactosyltransfeerase gene responsible for the phenotype."Transfusion. 42. 48-51 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] Pang H, Soejima M, Koda Y, Kimura H.: "A novel tetrameric short tandem repeat located in the 3' flanking region of the human ABO-Secretor gene (FUT2) and association between FUT2 and FUT2/01 loci."Hum Biol.. (in press). (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Tachida H, Soejima M, Takenaka O, Kimura H.: "Population differences sequence in DNA variation and linkage disequilibrium at the PON1 gene."Ann Hum Genet.. 68. 110-119 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Teye K, Quaye IK, Koda Y, Soejima M, Pang H, Tsuneoka M, Amoah AG, Adjei A, Kimura H.: "A novel 1247T missense mutation in the haptoglobin 2 beta-chain decreases the expression of the protein and is associated with ahaptoglobinemia."Hum Genet.. 114. 499-502 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Teye K, Tsuneoka M, Arima N, Koda Y, Nakamura Y, Ueta Y, Shirouzu K, Kimura H.: "Increased expression of a Myc target gene Mina53 in human colon cancer."Am J Pathol.. 164. 205-216 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Teye K, Quaye I, Koda Y, Soejima M, Tsuneoka M, Pang H, Ekem I, Amoah A, Adjei A, Kimura H.: "A-61C and C-101G Hp gene promoter polymorphisms are, respectively, associated with ahaptoglobinaemia and hypohaptoglobinaemia in Ghana."Clin Genet.. 64. 439-443 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Ishida T, Tachida H, Wang B, Pang H, Soejima M, Soemantri A, Kimura H.: "DNA sequence variation of the human ABO-secretor locus (FUT2) in New Guineanpopulations : possible early human migration from Africa."Hum Genet.. 113. 534-541 (2004)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Tsuneoka M, Umata T, Kimura H, Koda Y, Nakajima M, Kosai K, Takahashi T, Takahashi Y, Yamamoto A.: "c-Myc induces autophagy in rat 3Y1 fibroblast cells. Cell"Struct Funct.. 28. 195-204 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Seto Y, Takeichi 5, Kimura H.: "Fatal subarachnoid hemorrhage Complicating actinomycotic meningitis."Forensic Sci Int.. 134. 169-171 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Amano S, Yamagishi S, Koda Y, Tsuneoka M, Soejima M, Okamoto T, Inagaki Y, Yamada K, Kimura H.: "Polymorphisms of sorbitol dehydrogenase (SDH) gene and susceptibility to diabetic retinopathy."Med Hypotheses.. 60. 550-551 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Pang H, Koda Y, Yamagishi SI, Amano S, Inagaki Y, Okamoto T, Yamada K, Kimura H.: "N-acetylglucosamine-phosphate mutase genotype and diabetic microvascular complications."Diabetic Med.. 20. 419-420 (2003)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Yamagishi S, Amano S, Inagaki Y, Okamoto T, Koda Y, Soejima M, Kimura H.: "Pigment epithelium-derived factor Met72Thr polymorphism in patients with diabetic icroangiopathy."Int J Clin Pharmacol Res.. 22. 67-71 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Yamagishi S, Amano S, Okamoto T, Inagaki Y, Yamada K, Kimura H.: "Haptoglobin genotype and diabetic microangiopathies in Japanese diabetic patients."Diabetologia.. 45. 1039-1040 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Pang H, Koda Y, Soejima M, Kimura H.: "Identification of human phosphoglucomutase 3 (PGM3) as N-acetylglucosamine-phosphate mutase (AGM1)."Ann Hum Genet.. 66. 139-144 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Tsuneoka M, Koda Y, Soejima M, Teye K, Kimura H.: "A novel myc target gene, mina53, that is involved in cell proliferation."J Biol Chem.. 277. 35450-35459 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Wang B, Pang H, Koda Y, Soejima M, Kimura H.: "Polymorphisms of eight STR loci in Chinese and African (Xhosa)populations."Forensic Sci Int.. 125. 279-280 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Tsuneoka M, Yasumoto K, Higashitani T, Sagawa K, Kimura H.: "Heterozygosity for two novel null alleles of the KEL gene causes the Kell-null phenotype in a Japanese woman."Br J Haematol.. 117. 220-225 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Nakayama K, Fukamachi S, Kimura H, Koda Y, Soemantri A, Ishida T.: "Distinctive distribution of AIM1 polymorphism among major human populations with different skin color."J Hum Genet.. 47. 92-94 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y, Soejima M, Sato H, Maeda Y, Kimura H.: "Three-base deletion and one-base 'insertion of the alpha( 1,4)galactosyltransferase gene responsible for the p phenotype."Transfusion.. 42. 48-51 (2002)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Koda Y et al.: "DNA sequence variation of the human ABO-secretor locus (FUT2) in New Guinean populations : possible early human migration from Africa."Human Genetics. 113. 534-541 (2003)
• [文献書誌] Teye K et al.: "A-61C and C-101G Hp gene promoter polymorphisms are, respectively, associated with ahaptoglobinaemia and hypohaptoglobinaemia in Ghana."Clinical Genetics. 64. 439-443 (2003)
• [文献書誌] Koda Y et al.: "Population differences in DNA sequence variation and linkage disequilibrium at the PON1 gene."Annnals of Human Genetics. (in press). (2004)
• [文献書誌] H.Pang: "N-acetylglucosamine-phosphate mutase genotype and diabetic microvascular complications"Diabetic Med. (in press).
• [文献書誌] S.Yamagishi: "PEDF Met72Thr polymorphism in patients with diabetic microangiopathy"Int.J.Clin.Pharm.Res. (in press).
• [文献書誌] M.Tsuneoka: "A novel Myc target gene, mina53, that is involed in cell proliferation"J.Biol.Chem. 277. 35450-35459 (2002)
• [文献書誌] H.Pang: "Identification of human phosphoglucomutase 3 (PGM3) as N-acetylglucosamine-phosphate mutase (AGM1)"Ann.Hum.Genet. 66. 139-144 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Haptoglobin genotype and diabetic microangiopathies in Japanese diabetic patients"Diabetologia. 45. 1039-1040 (2002)
• [文献書誌] B.Wang: "Polymorphisms of eight STR loci in Chinese and African (Xhosa) populations"Forensic Sci.Int. 125. 279-280 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Three-base deletion and one-base insertion of the α(1,4)galactosyltransferase gene responsible for the p phenotype"Transfusion. 42. 48-51 (2002)
• [文献書誌] Y.Koda: "Heterozygosity for two novel alleles of the KEL gene causes the Kell-null phenotype in a Japanese woman"Br.J.Haematol. 117. 220-225 (2002)
• [文献書誌] K.Nakayama: "Distinctive distribution of AIM1 polymorphism among major human populations with different skin color"J.Hum.Genet. 47. 92-94 (2002)