• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

DNAプールを用いたマイクロサテライトマーカーによる2型糖尿病全ゲノム相関解析

研究課題

研究課題/領域番号 14571096
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 代謝学
研究機関愛媛大学

研究代表者

牧野 英一  愛媛大学, 医学部, 教授 (50009578)

研究分担者 大沼 裕  愛媛大学, 医学部, 助手 (00294794)
大澤 春彦  愛媛大学, 医学部, 助教授 (90294800)
研究期間 (年度) 2002 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2003年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2002年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワード糖尿病 / 感受性遺伝子 / SNP / 多型 / ハプロタイプ
研究概要

糖尿病発症予防法の確立には感受性遺伝子の同定が必須である。そこで本研究では、DNAプールを用いて全ゲノムをスクリーニングし、日本人の2型糖尿病感受性マーカーあるいは原因遺伝子を同定することを目的とする。
当初は、DNAプールを用いて、マイクロサテライトによる全ゲノムのスクリーニングを計画していた。一方、申請者らも参加しているミレニアムプロジェクトにおいて、マイクロサテライト及びSNPを用いた全ゲノム解析が順調に進行し、一次スクリーニングが終了する見通しとなった。更に平成15年には2次スクリーニングが開始され、その結果同定された感受性座位の解析の一部を担う方が良いと考えられる状況に至った。
そこで、脂肪細胞に特異的に発現する転写因子FOXC2、及びインスリンの抗脂肪分解作用を媒介するphophodiesterase 3B(PDE3B)、resistinについて解析を進めることにした。これらは、2型糖尿病におけるインスリン抵抗性の有力な候補遺伝子である。
まず、2型糖尿病24名についてFOXC2の全エクソン及び1kbの5'flanking領域をPCR直接シークエンス法によりスクリーニングした。同定したSNPを、対照200名、2型195名で解析した。その結果、対照で-512C>T(32.3%)、-350G>T(13.0%)、+1548C>T(10.0%)を同定した。これらのSNP及び4種の主要ハプロタイプはいずれも2型とは関連しなかった。
また、PDE3Bについては、高頻度のSNP-465G>T及び+1389G>Aについて、対照200名、2型207名をタイピングした。各SNP単独、及びハプロタイプは2型と関連しなかった。
また、ResistinのSNP299G>Aはインスリン抵抗性症候群と関連を認めなかった。
以上より、FOXC2及びPDE3B遺伝子のSNPは、日本人2型糖尿病感受性に影響する主要な因子ではないことが想定された。

報告書

(3件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (11件)

  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5' flanking region of the human phosphodiesterase 3B gene : Absence of evidence for major effects of identified polymorphisms on susceptibility to Japanese type 2 diabetes."Mol Genet Metab. 79. 43-51 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the FOXC2 gene : The absence of evidence for the association of three frequent SNPs and four common haplotypes with Japanese type 2 diabetes."Diabetes. 52. 562-567 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ochi, M. et al.: "The absence of evidence for major effects of the frequent SNP 299G>A in the resistin gene on susceptibility to insulin resistance syndrome associated with Japanese type 2 diabetes."Diabetes Res Clin Pract. 61. 191-198 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Osawa H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms in the FOXC2 gene : The absence of evidence for the association of three frequent single nucleotide polymorphisms and four common haplotypes with Japanese type 2 diabetes."Diabetes. 52. 562-567 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Osawa H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms in the 5' flanking region of the human phosphodiesterase 3B gene : Absence of evidence for major effects of identified polymorphisms on susceptibility to Japanese type 2 diabetes."Mol Genet Metab. 79. 43-51 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ochi, M. et al.: "The absence of evidence for major effects of the frequent SNP 299G>A in the resistin gene on susceptibility to insulin resistance syndrome associated with Japanese type 2 diabetes."Diabetes Res Clin Pract. 61. 191-198 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the 5' flanking region of the human phosphodiesterase 3B gene : Absence of evidence for major effects of identified polymorphisms on susceptibility to Japanese type 2 diabetes."Mol Genet Metab. 79. 43-51 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the FOXC2 gene : The absence of evidence for the association of three frequent SNPs and fourcommon haplotypes with Japanese type 2 diabetes."Diabetes. 52. 562-567 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ochi, M. et al.: "The absence of evidence for major effects of the frequent SNP 299G>A in the resistin gene on susceptibility to insulin resistance syndrome associated with Japanese type 2 diabetes."Diabetes Res Clin Pract. 61. 191-198 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisrns (SNPs) in the 5'flanking region of the human phosphodiesierase 3B gene: Absence of evidence for major effects of identified polymorphisms on susceptib ility to Japanese type 2 diabetes"Mol Genet Metab. (発売予定). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Osawa, H. et al.: "Systematic search for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the FOXC2 gene: The absence of ev idence for the association of three frequent SNPs and four common haplotypes with Japanese type 2 diabetes."Diabetes. 52. 562-567 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

URL: 

公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi