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遺伝性疾患診断用パソコンソフト(GenDis)英語版の開発

研究課題

研究課題/領域番号 14572145
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 人類遺伝学
研究機関琉球大学

研究代表者

成富 研二  琉球大学, 医学部, 教授 (20101446)

研究期間 (年度) 2002 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2003年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2002年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワード遺伝性疾患 / パソコンソフトウェア / データベース / 奇形症候群 / 染色体異常 / パソコンソフト
研究概要

(1)基礎となる遺伝性疾患データベースの作成
これまでに完成させているUR-DBMS(琉球大学奇形症候群データベース)の内容を、インターネットのO-MIM情報などを主に参照し、平成16年3月までの最新情報を入力追加した。その結果、総数7,900疾患または遺伝子の症状および解説、文献を作成した。付属ファイルは文献抄録49,500件、mRNA配列ファイル11,100遺伝子、証明ずみの変異遺伝子ファイル1,575遺伝子となった(UR-DBMS Ver.11)。UR-DBMS Ver.11の総容量は約750MBと巨大となった。
(2)パソコン・ソフトウェアの開発
平成14年度に、すでに作成していた日本語版GenDisのプログラムを、英語に書き換え、英語OSでも日本語OSでも使用可能な英語版GenDisを作成し、日本語版と区別するため、syndrome Finderと命名した。このソフトにUR-DBMSの症状データなどを取り込み、症状を入力すると診断候補を一致率の高い順に選択する、遺伝性疾患診断ソフトを完成させた。
平成15年度は、最新のUR-DBMSデータへ追加・変更し、年度末までにSyndrome Finder 2と完成させた。
Syndrome Finderは平成15年から公開を開始し、米国人類遺伝学会でも発表した。平成16年4月には最新のSyndrome Finder 2とUR-DBMS V11を公開開始した。
Syndrome Finderは、全国63施設から使用依頼があった。

報告書

(3件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (19件)

  • [文献書誌] Kurotaki N, Naritomi K et al.: "Haploinsufficiency of the NSD1 gene cuases Sotos syndrome."Nature Genet.. 30. 365-366 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagai T, Naritomi K et al.: "Sotos syndrome and haploinsufficiency of NSD1 : clinical features of intragenic mutations and submicroscopic deletions."J Med.Genet.. 40(4). 285-289 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naritomi K: "University of the Ryukyus-Database for Malformation Syndromes. Version 10"UR-DBMS V10. (Electric Database ; CD-ROM). (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naritomi K: Suyndrome Finder. (Computer software). (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naritomi K: "University of the Ryukyus-Database for Malformation Syndromes. Version 11"UR-DBMS V10. (Electric Database ; CD-ROM). (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naritomi K: Syndrome Finder 2. (Computer software). (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 成富研二: "Prader-Willi症候群の臨床的特徴。1、自然歴。Prader-Willi症候群。糠枝憲二編著"診断と治療社. 21-25 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 成富研二: "形態異常を中心とした先天異常、遺伝性疾患の診断の進め方"医学書院. 137-139 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kurotaki N, Imaizumi K, Harada N, Masuno M, Kondoh T, Nagai T, Ohashi H, Naritomi K, Tsukahara M, Makita Y, Sugimoto T, Sonoda T, Hasegawa T, Chinen Y, Tomita H, Kinoshita A, Mizuguchi T, Yoshiura K, Ohta T, Kishino T, Fukushima Y, Niikawa N, Matsumoto N: "Haploinsufficiency of the NSD1 gene causes Sotos syndrome."Nature Genet.. 30. 365-366 (2002)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagai T, Matsumoto N, Kurotaki N, Harada N, Niikawa N, Ogata T, Imaizumi K, Kurosawa K, Kondoh T, Ohashi H, Tsukahara M, Makita Y, Sugimoto T, sonoda T, Yokoyama T, Uetake K, Sakazume S, Fukushima Y, Naritomi K: "Sotos syndrome and haploinsufficiency of NSD1 : clinical features of intragenic mutations and submicroscopic deletions."J Med Genet. 40(4). 285-289 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Naritomi K: "Haploinsufficiency of the NSD1 gene causes Sotos syndrome."Nature Genet.. 30. 365-366 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Naritomi K: "University of the Ryukyus-Database for Malformation Syndromes. Version 9"UR-DBMS V10 (Electric Database. (CD-ROM). (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Naritomi K: "Sotos syndrome and haploinsufficiency of NSD1 : clinical features of intragenic mutations and submicroscopic deletions."J.Med.Genet.. 40(4). 285-289 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 成富研二: "Prader-Willi症候群の臨床的特徴。1、自然歴。Prader-Willi症候群。藤枝憲二編著"診断と治療社. 21-25 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 成富研二: "形態異常を中心とした先天異常、遺伝性疾患の診断の進め方"医学書院. 137-139 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Naritomi K: "Haploinsufficiency of the NSD1 gene causes Sotos syndrome. 30:365-366,2002"Nature Genet.. 30. 365-366 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Naritomi K: "University of the Ryukyus-Database for Malformation Syndromes. Version 9"UR-DBMS V9 (Electric Database ; CD-ROM). (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 成富研二: "Prader-Willi症候群の臨床的特徴。1、自然歴。Prader-Willi症候群。藤枝憲二編著"診断と治療社. 21-25 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] 成富研二: "ダウン症候群"医学書院. 953-954 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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