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X線構造に基づく好熱性放線菌α-アミラーゼのシクロデキストリン加水分解機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 14580621
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関東京農工大学

研究代表者

神鳥 成弘  東京農工大学, 工学部, 助教授 (00262246)

研究分担者 坂野 好幸  東京農工大学, 農学部, 教授 (70014959)
研究期間 (年度) 2002 – 2003
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2003年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2002年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワードX線結晶解析 / α-アミラーゼ / シクロデキストリン / 加水分解 / ミュータント酵素 / 好熱性放線菌 / グルコシド結合 / 反応動力学パラメーター / 放射光
研究概要

好熱性放線菌(Thermoactinomyces vulgaris R-47)は,2つのα-アミラーゼ(TVA1,TVA2)を持つ。これらは,デンプンに加えて,通常のα-アミラーゼがほとんど加水分解できない環状オリゴ糖であるシクロデキストリン(CD)やα-1,6結合を規則正しく含む多糖(プルラン)をも加水分解できるという興味深い基質特異性を持つ。また,TVA1はデンプン・プルランなどの高分子量基質に,TVA2は,CD・オリゴ糖などの低分子量基質に対してよく働く。これらの酵素の加水分解機構を解明するために,以下の研究を行った。
不活性型TVA2ミュータント酵素と,α-,β-,γ-CD(それぞれグルコース単位が6,7,8)との複合体の結晶を作成し,X線結晶解析を行い,CD認識・加水分解機構について新たな知見を得たので論文誌に発表した。また,プルラン認識機構を明らかにするために,プルランモデルオリゴ糖(パノシルパノース)との複合体についてもX線結晶解析を行い,α-1,6結合認識について新たな知見を得たので論文誌に発表した。
TVA1不活性型ミュータント酵素とマルトヘキサオースとの複合体のX線結晶解析を行った。その結果,触媒部位とは別に,ドメインNに2箇所の基質結合が認められた。このことは,ドメインNがデンプン結合ドメインとして働き,TVA1が高分子量基質を好むことと密接に関係があると考えられる。この結果は,それを立証する生化学データとともに,論文誌に発表した。
TVA1,TVA2のX線結晶解析の結果から,CDを認識するアミノ酸を相互置換することにより,TVA1とTVA2の基質特異性の相互変換を試みた。その結果,TVA1ミュータント酵素(F313A)において,デンプン:CDに対する加水分解活性比を,野生型TVA2のものに近づけることに成功した。この結果は,論文誌に発表した。

報告書

(3件)
  • 2003 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (11件)

  • [文献書誌] Ohtaki, A., Iguchi, A., Mizuno, M., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Mutual conversion of substrate specificities of Thermoactinomyces vulgarius R-47 α-amylase TVAI and TVAII by site-directed mutagenesis"Carbohydrate Research. 338. 1553-1558 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Abe, A., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Complex structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase I with malto-oligosaccharides demonstrate the role of domain N acting as a starch binding domain."J.Mol.Biol.. 335. 811-822 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mizuno, M., Tonozuka, T., Uechi, A., Ohtaki, A., Ichikawa, K., Kamitori, S., Nishikawa, A., Sakano, Y.: "The Crystal Structure of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase II (TVA II) Complexed with Transglycosylated Product"European Journal of Biochemistry. (2004/04/17受理).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtaki, A., Mizuno, M., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Complex Structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase 2 with acarbose and cyclodextrins demonstrate the multiple substrate recognition mechanism."J.Biol.Chem.. (2004/05/12受理).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtaki A, Iguchi, A., Mizuno M., Tonozuka, T., Sakano, Y,.Kamitori.S.: "Mutual conversion of substrate specificities of Thermoactinomyces vulgarius R-47 α-amylase TVAI and TX/All by site-directed mutagenesis"Carbohydrate Research.. 338. 1553-1558 (2003)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Abe.A., Tonozuka, T., Sakano.Y., Kamitori.S.: "Complex structures of Thermoactinomyces R-47 α-amylase 1 with malto-oligosaccharides demonstrate the role of domain N acting as a starch binding domain."J. Mol. Biol.. 335. 811-822 (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mizuno.M., Tonozuka.T., Uechi.A., Ohtaki.A., Ichikawa.K., Kamitori, S., Nishikawa, A., Sakano, Y: "The Crystal Structure of The Thermoactinomyces vulgaris R-47-Amylase II (TX/A II) Complexed with Transglvcosvlated Product"European Journal of Biochemistry. (in press.). (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtaki, A., Mizuno, M., Tonozuka.T., Sakano.Y, Kamitori.S.: "Complex Structures of The Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-Amylase 2 with acarbose and cyclodextrins demonstrate the multiple substrate recognition mechanism."J. Biol. Chem... (2004)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2003 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohtaki, A., Iguchi, A., Mizuno, M., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori.S.: "Mutual conversion of substrate specificities of Thermoactinomyces vulgarius R-47 α-amylase TVAI and TVAII by site-directed mutagenesis"Carbohydrate Research. 338. 1553-1558 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Abe, A., Tonozuka, T., Sakano, Y., Kamitori, S.: "Complex structures of Thermoactinomyces vulgaris R-47 α-amylase 1 with malto-oligosaccharides demonstrate the role of domain N acting as a starch binding domain"J.Mol.Biol.. 335. 811-822 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tonozuka, T., Yokota, T., Ichikawa, K., Mizino, M., Kondo, S., Nishikawa, A., Kamitori, S., Sakano, Y.: "Crystal structures and substrate specificities of two α-amylases hydrolyzing cyclodextrins and pullulan from Thermoactinomyces vulgaris R-47"Biologia Bratislava. 57,Suppl.11. 71-76 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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