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生体系における一分子力学の建設

研究課題

研究課題/領域番号 14608023
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分企画調査
研究分野 生物物理学
研究機関名古屋大学

研究代表者

RITCHIE Kenneth Patrick  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (20324395)

研究分担者 嶋本 伸雄  国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 教授 (20127658)
石渡 信一  早稲田大学, 理工学部, 教授 (10130866)
猪飼 篤  東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授 (50011713)
柳田 敏雄  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授 (30089883)
宝谷 紘一  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80025444)
研究期間 (年度) 2002
研究課題ステータス 完了 (2002年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2002年度: 3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
キーワード一分子力学 / 細胞間接着 / 分子間相互作用 / 光ピンセット / AFM / 磁気ピンセット / pNレベル / 生体分子機械
研究概要

生体高分子1分子を柔らかい手(例えば、光ピンセットやガラス微小針)を用いて掴んで操作する事が出来るようになった。さらに、一分子力学の方法は、生細胞内で1分子を操作し、細胞の真似をしたり邪魔をしたりすることを可能にした。本質的にヘテロな細胞中で確率過程論的に働く生体分子機械の作動機構を解明するには、一分子力学の方法をさらに発展させる以外にない。本研究では特定領域研究として強力に1分子力学の方法を推進するため、その方法の理論的枠組み、道具立て(特殊装置の開発とその汎用機化)の基盤を形成した。
1分子の操作は金コロイド、ビーズ、AFMチップなどに分子を結合させ、それらを光ピンセット、AFM、磁気ピンセットなどで操作することによって行う。pN-nNレベルの力と0.1-数nmの空間精度が達成される。これらの方法をさらに発展させ、一分子力学の方法と理論を確立した。本年は以下の3つの重点項目について、議論と意見交換をおこなった。
【1】一分子の異性化/構造変化/変形/タンパク質の(アン)フォールディングなどを、1分子に力をかけておこなった。構造変化と力の関係、及び、変化にかかわるポテンシャル(エネルギーランドスケープ)を明らかにした。このとき、分子動力学計算の援用についても議論した。
【2】分子間相互作用の研究を、2分子間に働く力の問題として、直接的に調べる方法と理論について。方法は【1】と同じ。特に、動的な負荷のかけ方と反応過程のエネルギーランドスケープの関係を重視した。
【3】分子間相互作用や分子構造の変化と生理機能とのカップリングについて。

報告書

(1件)
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (7件)

  • [文献書誌] Ritchie, K., Iino, R., Fujiwara, T., Murase, K., Kusumi, A.: "The Fence and Picket Structure of the Plasma Membrane of Live Cells as Revealed by Single Molecule Techniques"Molecular Membrane Biology. (In Press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ritchie.K., Kusumi A.: "Role of the membrane skeletun in creation of microdomains"Subcellular Biochemistry. (In Press). (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ritchie, K., Kusumi A.: "Single molecule probe scanning optical force imaging microscope for viewing live cells"Journal of Biological Physics. 28. 619-626 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Masayoshi Nishiyama, Hideo Higuchi, Toshio Yanagida: "Chemomechanical coupling of the forward and backward steps of single kinesin molecules"Nature Cell Biology. 4. 790-797 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ikuko Fujiwara, Shin Takahashi, Hisashi Tadakuma, Takashi Funatsu, Shin'ichi Ishiwata: "Microscopic analysis of polymerization dynamics with individual actin filaments"Nature Cell Biology. 4. 666-673 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroto Tanaka, Kazuaki Homma, Atsuko Hikikoshi, Iwane, Eisaku Katayama, Reiko Ikebe, Junya Saito, Toshio Yanagida, Mitsuo Ikebe: "The motor domain determines the large step of myosin-V"Nature. 415. 192-195 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Ritchie, K., Kusumi A.: "Methods in Enzymology, V.360"Single Particle Tracking Image Microscopy. 618-634 (2003)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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