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家畜モデル動物を用いた量的経済形質原因遺伝子同定のためのゲノムシフト戦略の確立

研究課題

研究課題/領域番号 14656114
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 基礎獣医学・基礎畜産学
研究機関京都大学

研究代表者

佐々木 義之  京都大学, 農学研究科, 教授 (10041013)

研究分担者 山田 宜永  京都大学, 農学研究科, 助教授 (40253207)
谷口 幸雄  京都大学, 農学研究科, 助手 (10252496)
研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2004年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2003年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2002年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードモデル動物 / OLETF / QTL / コンジェニック / ENU-mutant / 脂肪蓄積 / ポジショナルキャンディデート / クローニング / QTL解析 / ファインマッピング
研究概要

・肥満型OLETFラットでの筋肉内脂肪蓄積に関わる第一染色体上のQTLのポジショナルキャンディデートであるPnlip遺伝子について、〜9.8kbの5'上流隣接領域、〜13.1kbのエクソン/イントロン領域および〜3.6kbの3'下流隣接領域をOLETFとF344でダイレクトシーケンスし、多型について解析した。その結果、転写開始点の上流〜3.4kbの位置に、F344アリルに比べOLETFアリルにおいてサイズが長いVNTR多型が検出された。そこで、当該QTLで、OLETFとは異なるアリルを有することがQTL解析により判明しており、Pnlip遺伝子発現レベルがOLETFに比べ減少しているBNとLETOについても、上記多型部分のシーケンス解析を行った。その結果、OLETFより短くF344と同じサイズであり、Pnlip遺伝子についての発現レベルの増加がOLETF特異的であることに加えて、当該遺伝子のVNTR多型はOLETFに特異的な多型を示すことが明らかになった。Ins1遺伝子では、プロモーター領域に同様なVNTR多型が存在し、それが骨格筋、脂肪組織および膵での発現レベルに影響を及ぼすことで、量的形質である糖尿病発症につながっているらしいとの報告がなされており、今回の発見は興味深いものである。また、当該QTLのゲノム領域内で組み換えが生じている(コンジェニック×F344)×コンジェニックのバッククロス交雑群からの雄選抜個体12匹を用いることで、D1Rat90とD1Rat225の間の2.3cMの領域に当該QTLをファインマッピングした。さらに、上記新規組み換えパックスロス交雑個体を用いることで、ファインマッピングされた当該QTLがPnlip遺伝子のVNTR多型および発現レベルの変化と共分離していることが明らかにされた。これらの結果より、Pnlip遺伝子が筋肉内脂肪蓄積QTLの原因遺伝子であるかもしれないという状況証拠が得られた。
・ENU-mutantであるDBF1について、肥満・脂肪蓄積パラメーターである体重、生殖器脂肪量、腎周囲脂肪量および最長筋内脂肪量の解析を行ったところ、生殖器脂肪量および腎周囲脂肪量に対して最長筋内脂肪量が増加しているあるいは減少しているmutantマウスを検出することができ、家畜モデル動物としての有用性を検討する価値があると考えられた。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2004 その他

すべて 雑誌論文 (5件) 文献書誌 (13件)

  • [雑誌論文] Comparison of age-dependent expression patterns of C/EBP family and PPARγ in Musculus longissimus between Japanese Black and Holstein breeds.2004

    • 著者名/発表者名
      Sakoyama, R.
    • 雑誌名

      Anim.Sci.J. 75

      ページ: 527-533

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Current and future subjects-for QTL analysis methods in livestock.2004

    • 著者名/発表者名
      Miyake, T.
    • 雑誌名

      J.Anim.Genet. 32

      ページ: 43-52

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection of multiple QTL with epistatic effects under inheritance model in an outbred population.2004

    • 著者名/発表者名
      Narita, A.
    • 雑誌名

      Genet.Sel.Evol. 36

      ページ: 415-433

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Generation of a total of 6,483 expressed sequence tags from 60 day-old bovine whole fetus and fetal placenta.2004

    • 著者名/発表者名
      Oishi, M.
    • 雑誌名

      Anim.Biotechnol. 15

      ページ: 1-8

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A national genetic evaluation of carcass traits for the Japanese Black cattle is possible.2004

    • 著者名/発表者名
      Odani, M.
    • 雑誌名

      Anim.Sci.J. 75

      ページ: 353-361

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada, T.: "Aspects and prospects of QTL analysis for marbling gene."J.Anim.Genet.. 30. 21-28 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tanomura, H.: "A congenic strain (F344.OLETF-Imfm) displays the existence of intramuscular fat accumulation QTL on rat chromosome 1."Exp.Anim.. 52. 303-308 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Muramatsu, Y.: "Capn10, a candidate gene responsible for type 2 diabetes mellitus in the OLETF rat."IUBMB Life. 55. 533-537 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ogino, T.: "Serum leptin concentration is linked to chromosomes 2 and 6 in the OLETF rat, an animal model of type 2 diabetes with mild obesity."Mamm.Genome. 14. 239-244 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Oishi, M.: "Generation of a total of 6,483 expressed sequence tags from 60 day-old bovine whole fetus and fetal placenta."Anim.Biotechnol.. In press.

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Muramatsu, Y.: "Chromosomal mapping of HSPCB and MYL1 expressed abundantly in the bovine fetus."Anim.Biotechnol.. 14. 83-86 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada, T.: "Genetic dissection of non-insulin-dependent diabetes mellitus in the OLETF rat. In Animal Frontier Sciences, (Eds.) Sato, E., Miyamoto H., Manabe N."Hokuto Shobo, Kyoto, Japan. 8 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Tanomura, H.: "Detection of a quantitative trait locus for intramuscular fat accumulation using the OLETF rat"J. Vet. Med. Sci.. 64. 45-50 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Kose, H.: "Examination of OLETE-derived non-insulin-dependent diabetes mellitus QTL by construction of a series of congenic rats"Mamm. Genome. 13. 558-562 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada, T.: "Genetic dissection of non-insulin-dependent diabetes mellitus in the OLETF rat"Reproductive Biotechnology. (in press).

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Taniguchi, Y.: "Genomic structure and promoter analysis of the bovine leptin gene"IUBMB Life. 53. 131-135 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Muramatsu, Y.: "Chromosomal assignments of expressed sequence tags for ACTG1, AHSG, COL1A1, GNAS1, and RPLP1 expressed abundantly in the bovine fetus"Anim. Genet.. 33. 230-231 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書
  • [文献書誌] Nagata, Y.: "Differential display method used for the comparison of mRNA expression level among many samples"J. Anim. Genet.. 30. 3-10 (2002)

    • 関連する報告書
      2002 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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