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ヒト19番染色体長腕領域における新規インプリント遺伝子の網羅的検索と構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 14770292
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 神経内科学
研究機関鳥取大学

研究代表者

前川 真治  鳥取大学, 生命機能研究支援センター・遺伝子探索分野, 助手 (70314606)

研究期間 (年度) 2002 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2003年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2003年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2002年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードゲノム刷り込み現象 / DNAメチル化 / グリオーマ / がん抑制遺伝子
研究概要

19qにはグリオーマ腫瘍抑制能を有する片親性発現遺伝子の存在が示唆されている。Differential methylated region(DMR)は多くのインプリント遺伝子に存在し、新規インプリント遺伝子の同定の有用な指標となりうる。近年メチル化DNA結合カラムクロマトグラフィーを用い同定されたヒト肺組織におけるDMR候補領域の情報をもとに、親起源の明らかなヒト19番染色体を1本保持するマウスA9雑種細胞株を用い、19番染色体上のDMRを検索した。各細胞株より抽出したゲノムDNAをメチル化感受性制限酵素で消化した後、アレル間のメチル化状態をPCRにて解析を行い、19q13.4の約380kb領域内に母方染色体特異的にメチル化状態にあるCpGアイランドを6ヶ所同定した。それらのCpGアイランド近傍に位置する転写物の正常ヒトリンパ芽球様細胞における発現様式を検索し、父性発現を呈する遺伝子を一つ、母性発現を呈する遺伝子を一つ同定した。さらにRACEとRT-PCRを行い、両遺伝子の全長を明らかにした。父性発現遺伝子はC2H2型ジンクフィンガーモチーフを有するタンパク質をコードする遺伝子であり、ヒト正常脳組織における刷り込み状態には個体差が認められた。本領域はヒト19番染色体上の新たなインプリンティングドメインである。さらに同定した2つの新規遺伝子はグリオーマ細胞株9株中2株において発現が低下していた。インプリント遺伝子の発現制御部位であると考えられる2つのDMRのメチル化状態をBisulfite sequencing法により解析したところ、いずれのグリオーマ細胞株も非癌部脳組織に比べ高度なメチル化状態にあった。同定した新規インプリント遺伝子は脳腫瘍形成に何らかの役割を果たすことが考えられた。

報告書

(2件)
  • 2003 実績報告書
  • 2002 実績報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (1件)

  • [文献書誌] Maegawa et al.: "Coordinate Downregulation of a Novel Imprinted Transcript ITUP1 with PEG3 in Glioma Cell Lines"DNA Research. 11. 1-13 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2002-04-01   更新日: 2016-04-21  

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