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トゲウオにおける適応放散をひきおこす生態要因とゲノム要因

研究課題

研究課題/領域番号 14F03381
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 生態・環境
研究機関国立遺伝学研究所

研究代表者

北野 潤  国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 教授 (80346105)

研究分担者 RAVINET MARK  国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 外国人特別研究員
RAVINET Mark  国立遺伝学研究所, 新分野創造センター, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2015年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2014年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードトゲウオ / 適応放散 / 種分化 / ゲノム / 遺伝
研究実績の概要

祖先型の海のイトヨとして北海道厚岸産のニホンイトヨ(日本海型イトヨ)とイトヨ(イトヨ太平洋集団)のゲノムを解析し、ABC法によって分岐年代やボトルネックを推定した。さらにゲノム上で遺伝子浸透の生じている部位を同定した。また、淡水進出したイトヨについても全ゲノムを解読し、淡水進出の年代を推定するとともに、淡水イトヨに見られた適応進化の痕跡、並びに、有害変異の蓄積について解析した。また、生態解析として、安定同位体解析を行い、同署トミヨ間に見られた生態分化に関する知見を論文化した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (2件)

  • [国際共同研究] ベルン大学(スイス)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Trophic niche differentiation and phenotypic divergence among cryptic species of Japanese ninespine stickleback.2016

    • 著者名/発表者名
      Ravinet, M., Ishikawa, A., and Kitano, J.
    • 雑誌名

      Evolutionary Ecology Research

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Comparative Analysis of Japanese Three-Spined Stickleback Clades Reveals the Pacific Ocean Lineage Has Adapted to Freshwater Environments while the Japan Sea Has Not2014

    • 著者名/発表者名
      Ravinet M, Takeuchi N, Kume M, Mori S, Kitano J
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 12 ページ: e112404-e112404

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0112404

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Ancestral polymorphism or recent gene flow? Insight from comparative genome scans2015

    • 著者名/発表者名
      Ravinet, M, Yoshida, K & Kitano J
    • 学会等名
      ESEB 2015
    • 発表場所
      Lausanne, Switzerland
    • 年月日
      2015-08-10 – 2015-08-14
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Speciation-with-gene-flow after strong intrinsic isolation has already evolved2015

    • 著者名/発表者名
      Ravinet, M, Yoshida, K & Kitano J
    • 学会等名
      Gordon Research Conference Speciation 2015
    • 発表場所
      Ventura, CA
    • 年月日
      2015-03-15 – 2015-03-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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