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細胞運命を決めるエピゲノム機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 14F04787
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 発生生物学
研究機関京都大学

研究代表者

山中 伸弥  京都大学, iPS細胞研究所, 教授 (10295694)

研究分担者 JOHANSSON ERIK MARTIN  京都大学, iPS細胞研究所, 外国人特別研究員
Johansson Erik Martin  京都大学, iPS細胞研究所, 外国人特別研究員
JOHANSSON Erik Martin  京都大学, iPS細胞研究所, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2016年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
キーワードGlioma / IDH1 / Differentiation / iPSC / DNA methylation / Epigenomics
研究実績の概要

本研究の目的は、iPS細胞にがん特異的ゲノム変異を導入することで、脳腫瘍の発生をインビトロで再現し、遺伝子発現ダイナミクスを中心にした分子機序を明らかにすることである。本研究では、シングルセルエピゲノム解析によって、細胞の分化過程における遺伝子発現制御のダイナミクスを明らかにする。特に細胞分化過程における遺伝子発現のヘテロ性を考慮した解析を行うことによって、シングルセルレベルでの分化の度合いの定義を行い、その分化の度合いに従った遺伝子発現制御を明らかにする。これらのシングルセル技術を脳腫瘍発生モデルに応用することで、脳腫瘍の発生モデルを構築すると共に創薬スクリーニングの基盤を提供する。具体的には、二次性神経膠腫で特異的に見られるIDH1変異体をiPS細胞に導入し、この変異体をアストロサイトなどの神経細胞へ分化させる際に一過的に癌発現させる。その変異体がひきおこす正常分化の異常を捉えることを試みる。さらには複数の変異遺伝子を同時、または連続的に発現させることで多段階発がんモデルを作製する。これらのモデルを用いて、正常な神経分化から逸脱する細胞集団をシングルセル遺伝子発現解析で同定する。さらにはこの分化系を用いて癌様細胞が発生する培養条件で、それらの細胞集団を標的とする化合物の同定を試みる。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (1件)

すべて 2014

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件)

  • [雑誌論文] TLX activates MMP-2, promotes self-renewal of tumor spheres in neuroblastoma and correlates with poor patient survival2014

    • 著者名/発表者名
      Chavali PL, Saini RK, Zhai Q, Vizlin-Hodzic D, Venkatabalasu-bramanian S, Hayashi A, Johansson E, Zeng ZJ, Mohlin S, Påhlman S, Hansford L, Kaplan DR, Funa K
    • 雑誌名

      Cell Death & Disease

      巻: 5 号: 10 ページ: e1502-e1502

    • DOI

      10.1038/cddis.2014.449

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス

URL: 

公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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