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ポジティブ/ネガティブマーカーを用いたタンパク質分泌経路の進化工学

研究課題

研究課題/領域番号 14J08165
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関千葉大学

研究代表者

池 紘平  千葉大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2016年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードgenetic selection / genetic switch / quorum-sensing / directed evolution / synthetic biology
研究実績の概要

グラム陰性菌のQuorum-sensingシステムは,膜透過性の高い分子(HSLs)をシグナルとして利用する非常に扱いやすいExpression system (遺伝子スイッチ)である。HSLsは種によって異なるacyl基構造をもっているが,QSレギュレータのシグナル特異性が低く,さらには標的とするDNA(Box)配列が似通っている。このため,QSシステムは相互に強く干渉しあい,これらをひとつの細胞内で独立に働かせること/複数遺伝子の発現を精緻にコントロールすることが困難であった。昨年度には,Agrobacterium tumefaciens由来のQSアクティベータTraRに我々の進化工学(機能選抜)手法を適用することで,天然QSシステムと,シグナル認識・標的配列の両面で直交性の高いTraシステムをそれぞれ取得した。本年度は,これらシステムを一つの細胞内へと導入し,直交的に実利用可能であることを示した。これまでにも,multi-cellular systemとしてDNA(Box)結合におけるクロストークを避け複数のQuorum-sensingシステムを直交的に使用する工夫がなされてきた。しかしながら,細胞ポピュレーションが外的環境(誘導条件etc…)に左右されるためシステムの堅牢性に大きな課題があった。本研究により得たQSシステムは,単一細胞内でも直交的に利用可能であるため,原理的にポピュレーションバランスの問題から解放され,非常に高い堅牢性を達成することができた。この成果は,29年度に論文として発表する予定である。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Evolutionary design of choline-inducible and choline-repressive T7-based induction systems.2016

    • 著者名/発表者名
      Ike K, Arasawa Y, Koizumi S, Mihashi S, Kawai-Noma S, Kyoichi S, Umeno D
    • 雑誌名

      ACS Synthetic Biology

      巻: 4 号: 12 ページ: 1352-1360

    • DOI

      10.1021/acssynbio.5b00107

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Rapid and Liquid-Based Selection of Genetic Switches Using Nucleoside Kinase Fused with Aminoglycoside Phosphotransferase2015

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Tominaga, Kohei Ike, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, and Daisuke Umeno
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 号: 3 ページ: e0120243-e0120243

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0120243

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] マルチチャンネル型の人工細胞間通信を指向したTraRの進化工学2015

    • 著者名/発表者名
      池 紘平, 河合(野間) 繁子, 斎藤 恭一, 梅野 太輔
    • 学会等名
      日本農芸化学会 関東支部大会
    • 発表場所
      お茶の水女子大学
    • 年月日
      2015-09-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 遺伝子スイッチの機能に及ぼすプロモータ/オペレータ距離の影響2014

    • 著者名/発表者名
      宮口明恵,池紘平,佐伯和哉,河合(野間)繁子,齋藤恭一,梅野太輔
    • 学会等名
      微生物研究会
    • 発表場所
      東京農業大学, 世田谷キャンパス
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 微生物ゲノム工学のハイスループット化を指向した遺伝子マーカーの改良2014

    • 著者名/発表者名
      嶋村陽,池紘平,冨永将大,河合(野間)繁子,斎藤恭一,梅野太輔
    • 学会等名
      微生物研究会
    • 発表場所
      東京農業大学, 世田谷キャンパス
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 改変型T7RNAポリメラーゼのプロモータ特異性解析2014

    • 著者名/発表者名
      大野琢也,池紘平,河合(野間)繁子,齋藤恭一,梅野太輔
    • 学会等名
      微生物研究会
    • 発表場所
      東京農業大学, 世田谷キャンパス
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] T7autogeneの構築とその振る舞い解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐伯和哉,池紘平,河合(野間)繁子,齋藤恭一,梅野太輔
    • 学会等名
      微生物研究会
    • 発表場所
      東京農業大学, 世田谷キャンパス
    • 年月日
      2014-07-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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