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同一複合体上に存在する脱アデニル化酵素CAF1とCCR4の作用機構解析

研究課題

研究課題/領域番号 14J08195
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 分子生物学
研究機関東京大学

研究代表者

新沼 翔  東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,900千円 (直接経費: 2,900千円)
2016年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2015年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2014年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワード脱アデニル化 / mRNA分解 / ポリ(A)鎖 / CCR4-NOT / CAF1 / CCR4 / ATP / デアデニレーション / RNA分解 / CCR4-NOT複合体 / エキソリボヌクレアーゼ
研究実績の概要

真核生物におけるほとんどのmRNAは3′末端にアデニンが連続する配列、ポリ(A)鎖を持つ。細胞質におけるmRNAの分解は、主としてポリ(A)鎖の分解反応である「脱アデニル化」から始まる。脱アデニル化は主にCCR4-NOT複合体がmRNA上に誘導されることで起こる。本研究で用いたショウジョウバエにおいて、CCR4-NOT複合体の構成因子の内、脱アデニル化活性を持つ因子はCAF1とCCR4の2つである。しかし、CCR4-NOT複合体がCAF1とCCR4という2つの脱アデニル化酵素を持つ生物学的意義は不明である。本研究の目的は、未だ明らかにされていないCAF1とCCR4の使い分け、あるいは協調的作用を生化学的に明らかにすることである。
CAF1及びCCR4はアデニンに強い選択性を持ち、3′末端から一塩基ずつRNAを分解する性質を持つ。しかし本研究のこれまでの結果から、CAF1もしくはCCR4はアデニン以外の塩基を持つRNAを分解できる場合があることが示唆された。本研究ではアデニン以外の塩基選択性にCAF1とCCR4の違いがある可能性を考え、酵素学的な解析を行った。しかしCAF1とCCR4に違いはなく、どちらも上流にポリ(A)配列があれば、3′末端の塩基を問わずRNAを分解できることがわかった。この結果はRNA journalに投稿され、公開された。
CAF1とCCR4の解析を行う過程で、精製したCAF1及びCCR4はその反応にATPを必要としないが、一方でCCR4-NOT複合体による脱アデニル化にはATPが必要であるとする先行研究があることがわかった。そこで脱アデニル化反応におけるATPの必要性について再検証したところ、実はCCR4-NOT複合体の脱アデニル化反応にATPは必要ないことがわかった。この結果もRNA journalに投稿され、公開された。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件、 謝辞記載あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (6件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] ATP is dispensable for both miRNA- and Smaug-mediated deadenylation reactions.2017

    • 著者名/発表者名
      Niinuma S, Tomari Y
    • 雑誌名

      RNA journal

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 866-871

    • DOI

      10.1261/rna.060764.117

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] CCR4 and CAF1 deadenylases have an intrinsic activity to remove the post-poly(A) sequence.2016

    • 著者名/発表者名
      Niinuma S, Fukaya T, Tomari Y
    • 雑誌名

      RNA journal

      巻: 10 号: 10 ページ: 1550-1559

    • DOI

      10.1261/rna.057679.116

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] RNA processing factors Swd2.2 and Sen1 antagonize RNA Pol III-dependent transcription and the localization of condensin at Pol III genes.2014

    • 著者名/発表者名
      Legros, P., Malapert, A., Niinuma, S., Bernard, P., Vanoosthuyse, V.
    • 雑誌名

      PLOS genetics

      巻: 10 号: 11 ページ: e1004794-e1004794

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1004794

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] The CCR4-NOT complex can remove the post-poly(A) sequence2016

    • 著者名/発表者名
      新沼 翔
    • 学会等名
      Keystone Symposia
    • 発表場所
      Colorado(USA)
    • 年月日
      2016-01-24
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Novel non-canonical deadenylation by the CCR4-NOT complex2015

    • 著者名/発表者名
      新沼 翔
    • 学会等名
      日本RNA学会
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌(北海道札幌市)
    • 年月日
      2015-07-15
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Novel non-canonical deadenylation by the CCR4-NOT complex2014

    • 著者名/発表者名
      Niinuma, S., Tomari, Y.
    • 学会等名
      Joint Australia and Japan RNA Meeting
    • 発表場所
      Sydney, Australia
    • 年月日
      2014-11-02 – 2014-11-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Novel non-canonical deadenylation by the CCR4-NOT complex2014

    • 著者名/発表者名
      Niinuma, S., Tomari, Y.
    • 学会等名
      高遠シンポジウム
    • 発表場所
      長野県伊那市
    • 年月日
      2014-08-28 – 2014-08-29
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Novel non-canonical deadenylation by the CCR4-NOT complex2014

    • 著者名/発表者名
      Niinuma, S., Tomari, Y.
    • 学会等名
      分子細胞生物学研究所研究交流会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2014-05-07
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Novel non-canonical deadenylation by the CCR4-NOT complex2014

    • 著者名/発表者名
      Niinuma, S., Tomari, Y.
    • 学会等名
      東京大学生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2014-04-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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