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植物の温度ストレス応答におけるRNA分解酵素DCP凝集の意義とその役割の解明

研究課題

研究課題/領域番号 14J08936
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 応用分子細胞生物学
研究機関名古屋大学 (2015)
東京大学 (2014)

研究代表者

元村 一基  名古屋大学, トランスフォーマティブ 生命分子研究所, 特別研究員(PD)

研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 300千円)
2015年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2014年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード植物 / 環境応答 / 高温 / RNA分解 / デキャッピング / 細胞質顆粒 / 植物の高温ストレス / mRNA分解 / RNA顆粒 / 細胞生物学
研究実績の概要

本研究では、環境ストレス応答においてmRNAが分解を伴った量的・質的変動を起こすことに着目し、この現象の一端を担うと考えられる、mRNA分解酵素DCP1とDCP2について研究を行った。本年度はまず高温処理前後におけるDCP1SA植物トランスクリプトーム実験の解析からはじめた。解析により、DCP1SAでは通常温度時にはほとんど通常植物と同様のRNAの蓄積を示していること、一方で高温処理によって短時間でmRNAの蓄積量が変化していることが分かってきた。
これらの変動したmRNAには、DCP1とDCP2が直接分解を行う標的mRNAと、直接の標的ではなく、二次的な影響により変動したものが含まれているのではないかと考えられた。そこでDCP1SAで安定化を示したmRNAのうちの数種類について、転写阻害剤を加えた植物に高温処理をしてタイムコースを取り、その変動率からこれらのmRNAの半減期を算出した。
本解析の結果、DCP1SA植物で安定化を示したmRNAのうち、一部のmRNAは高温時に分解されていることが示唆された。また、一部のmRNAは分解とは独立して、転写に依存したmRNA量の変動が引き金となってDCP1SAで量的変動が起きていることが示唆された。本研究手法により、様々な細胞応答の総和であるmRNA量の変動から、DCP1とDCP2に依存したmRNA分解の直接的な標的候補だけ同定することに成功した。
本研究成果から、植物が高温応答時にリン酸化を通じてDCP2の局在を変化させることで、細胞内RNA分布を変化させることが示唆された。更に、このリン酸化依存的に選択的なmRNA分解が引き起こされていることが示唆され、高温応答におけるmRNA分解機構とその意義の一端を明らかにすることができた。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] Diffuse Decapping Enzyme DCP2 Accumulates in DCP1 Foci Under Heat Stress in Arabidopsis thaliana2015

    • 著者名/発表者名
      Motomura K, Le TN. Q, Hamada T, Kutsuna N, Mano S, Nishimura M and Watanabe Y.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology

      巻: 56 号: 1 ページ: 107-115

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu151

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Imaging Analysis in Roles of mRNA Decay at Early Plant Development2016

    • 著者名/発表者名
      元村 一基,栗原大輔、丸山大輔、渡邊 雄一郎,東山哲也
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      盛岡
    • 年月日
      2016-03-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] TARPタンパク質が関与するsiRNA生合成経路の解析2016

    • 著者名/発表者名
      塚田道雄、都筑正行、深尾陽一朗、栗原志夫、松井南、元村 一基、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      盛岡
    • 年月日
      2016-03-18
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 初期発生におけるmRNA分解タンパク質の 局在・変異体のイメージング解析2016

    • 著者名/発表者名
      元村 一基、濱田隆宏、渡邊雄一郎、東山哲也
    • 学会等名
      第5回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] TARPタンパク質が関与するsiRNA生合成経路の解析2016

    • 著者名/発表者名
      塚田道雄、都筑正行、深尾陽一朗、栗原志夫、松井南、元村 一基、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      第5回植物RNA研究ネットワークシンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-01-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナtudorタンパク質によるsiRNA制御メカニズムの解析2015

    • 著者名/発表者名
      塚田道雄、都筑正行、元村 一基、深尾陽一朗、田村謙太郎、西村いくこ、渡邊雄一郎、濱田隆宏
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2015-09-08
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] 発生過程におけるmRNA分解酵素DCPの局在2015

    • 著者名/発表者名
      元村 一基、濱田隆宏、渡邊雄一郎、東山哲也
    • 学会等名
      日本植物学会
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2015-09-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] RNA 分解酵素DCP は選択的RNA 代謝を通じて高温耐性に寄与する2015

    • 著者名/発表者名
      元村 一基、Le Thi Nhat Quy、倉田哲也、朽名夏麿、真野昌二、西村幹夫、濱田隆宏、渡邊雄一郎
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 年月日
      2015-03-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける新規tudorタンパク質の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      塚田 道雄,都筑 正行,元村 一基,深尾 陽一朗,田村 謙太郎,西村 いくこ,渡邊 雄一郎,濱田隆宏
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 年月日
      2015-03-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 種子内におけるmiRNA の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      吉田 誠也,都筑 正行,元村 一基,濱田 隆宏,渡邊 雄一郎
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 年月日
      2015-03-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シロイヌナズナにおけるストレス顆粒形成機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      福澤 麻里奈,佐藤 繭子,元村 一基,柳川 由紀,西村 いくこ,豊岡 公徳,渡邊 雄一郎,濱田 隆宏
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 年月日
      2015-03-17
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 生物学的ストレス下における植物RNA 顆粒の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      重政 理紗,元村 一基,別役 重之,濱田 隆宏,渡邊 雄一郎
    • 学会等名
      日本植物生理学会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京都世田谷区)
    • 年月日
      2015-03-16
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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