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Bam複合体による外膜タンパク質形成の構造基盤の解明

研究課題

研究課題/領域番号 14J09020
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 構造生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

草木迫 司  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
2016年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2015年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
2014年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード構造生命科学 / X線結晶構造解析 / 膜タンパク質 / タンパク質の膜組み込み / 構造生物学
研究実績の概要

本研究では,特に真正細菌の細胞において,外膜タンパク質がどのように外膜に組み込まれるのか,その形成メカニズムの構造基盤を解明することを目的として,外膜タンパク質の膜組み込み装置であるBam複合体に着目して構造研究を推進してきた.これまでにBam複合体の中核因子である膜タンパク質BamAの結晶化に成功していたが,最終的にBamAならびにBam複合体の構造決定には至らなかった.2016年には,海外の他研究室からBam複合体の構造が相次いで報告された.これらの報告から外膜タンパク質形成メカニズムの構造基盤の一端が示された.しかしながら,Bam複合体と基質タンパク質とがどのように相互作用して,またBam複合体がどのような構造変化を伴って基質タンパク質を外膜に組み込むのかということに関しては,未だ不明な点が多く残されている.今後はBam複合体と基質タンパク質との複合体の構造解析や膜組み込み過程におけるダイナミクス研究の進展が予想される.また前年度に引き続いて,Vibrio choleraeに由来する多剤排出輸送体MATEトランスポーターの構造・ダイナミクス研究も進め,本年度はその成果の一部を国際誌に発表した.決定した異なる2つのコンフォメーションの結晶構造と,得られた構造情報に基づく電子スピン共鳴解析の結果から,原核生物に由来するMATEトランスポーターに共通した基質排出メカニズムが示唆された.

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (2件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 オープンアクセス 2件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件)

  • [国際共同研究] Vanderbilt University(米国)

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [国際共同研究] Vanderbilt University(米国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] LCP crystallization and X-ray diffraction analysis of VcmN, a MATE transporter from Vibrio cholerae.2016

    • 著者名/発表者名
      2.Kusakizako, T.; Tanaka, Y.; Hipolito, C. J.; Kuroda, T.; Ishitani, R.; Suga, H.; Nureki, O.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F Struct. Biol. Commun.

      巻: 72(Pt 7) 号: 7 ページ: 552-557

    • DOI

      10.1107/s2053230x16008931

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] 7.Crystal Structures of SecYEG in Lipidic Cubic Phase Elucidate a Precise Resting and a Peptide-Bound State2015

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Tanaka, Yasunori Sugano, Mizuki Takemoto, Takaharu Mori, Arata Furukawa, Tsukasa Kusakizako, Kaoru Kumazaki, Ayako Kashima, Ryuichiro Ishitani, Yuji Sugita, Osamu Nureki, Tomoya Tsukazaki
    • 雑誌名

      Cell report

      巻: 13 号: 8 ページ: 1561-1568

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2015.10.025

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Structural analysis of a MATE transporter from Vibrio cholerae2016

    • 著者名/発表者名
      Kusakizako, T., Tanaka, Y., Maturana A. D., Hipolito, C. J., Kuroda, T., Ishitani, R., Suga, H., Nureki, O.
    • 学会等名
      The 9th K. H. Kuo Summer School of Electron Microscopy & Crystallography and 2016 Kuo Symposium on 3D Cryo-EM Molecular Imaging
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2016-06-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Vibrio cholerae由来多剤排出トランスポーターMATEのX線結晶構造解析2015

    • 著者名/発表者名
      草木迫 司, 田中 良樹, Andres D. Maturana, Christopher J. Hipolito, 黒田 照夫, 石谷 隆一郎, 菅 裕明, 濡木 理
    • 学会等名
      第10回トランスポーター研究会年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学芝共立キャンパス (東京都港区)
    • 年月日
      2015-06-20
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Structural analysis of a MATE transporter from Vibrio cholerae2015

    • 著者名/発表者名
      Kusakizako, T., Tanaka, Y., Maturana, A. D., Hipolito, C. J., Kuroda, T., Ishitani, R., Suga, H., Nureki, O.
    • 学会等名
      "Multi-Drug Efflux Systems" Gordon Research Conference
    • 発表場所
      Lucca (Barga), Italy
    • 年月日
      2015-04-29
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] X-ray crystallographic analysis of a MATE multidrug transporter from V. cholerae2014

    • 著者名/発表者名
      Kusakizako, T., Tanaka, Y., Maturana, A.D., Hipolito, C.J., Kuroda, T., Ishitani, R., Suga, H., Nureki, O.
    • 学会等名
      The 23rd Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 年月日
      2014-08-11
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書

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公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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