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ポリケタイド合成酵素の機能改変による新規分子骨格の創出および物質生産系の構築

研究課題

研究課題/領域番号 14J12365
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生物分子化学
研究機関東京大学

研究代表者

張 驪駻  東京大学, 薬学系研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2014-04-25 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
2016年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2015年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2014年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード生合成 / 遺伝子 / ポリケタイド / コンビナトリアル生合成 / ゲノムマイニング / 合成生物学
研究実績の概要

これまでにアミノポリオール化合物であるmediomycin、ECO-02301、neotetrafibricinの3化合物の比較から、1型モジュール型ポリケタイド合成酵素はケトシンターゼドメインとその上流の修飾ドメインが協調して同時に遺伝子組み換えを起こすメカニズムが判明していたが、新たに見出されたneomediomycinのポリケタイド合成酵素を合わせた解析から、この遺伝子組み換えメカニズムが同様に適応されることが分かった。ケトシンターゼの配列解析をneomediomycinに関しても行った結果、これまでに同定されていた、基質の修飾段階の違いを反映する特徴的なモチーフは、neomediomycinにおいても同様に保存されていることが明らかとなった。また、4つのアミノポリオール化合物のポリケタイド合成酵素の配列比較からは、これまで本ドメインの脱水反応における反応機構では本残基は直接の触媒には関わらないとされているチロシン残基が活性に必須であることが示唆された。さらに、アミノ酸配列のアライメント解析により、アシルトランスフェラーゼドメインの後方に位置する保存されたリンカー領域が遺伝子組み換えのホットスポットとなっていることを明らかとした。以上、4つのポリケタイド合成酵素の比較進化解析はこれまでの少数のポリケタイド合成酵素での解析結果を裏付けるものであり、詳細な配列分析により得られた遺伝子進化メカニズムに対する知見は、ポリケタイド合成酵素を自然界が組み替えるメカニズムの一端を明らかとしたものであり、モジュール型ポリケタイド合成酵素の合理的再設計に応用されることが期待出来る。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(3件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 2014 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2017 2016 2015 2014 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 雑誌論文 (2件) (うち国際共著 1件、 査読あり 2件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 2件) 備考 (1件)

  • [国際共同研究] 中国科学院上海有機化学研究所(中国)

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [雑誌論文] Characterization of giant modular PKSs provides insight into genetic mechanism for structural diversification of aminopolyol polyketides2017

    • 著者名/発表者名
      Zhang, L., Hashimoto, T., Qin, B., Hashimoto, J., Kozone, I., Kawahara, T., Okada, M., Awakawa, T., Ito, T., Asakawa, Y., Ueki, M., Takahashi, S., Osada, H., Wakimoto, T., Ikeda, H., Shin-ya, K., Abe, I.
    • 雑誌名

      Angew. Chem. Int. Ed.

      巻: 56 ページ: 1740-1745

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Rational control of polyketide extender units by structure-based engineering of a crotonyl-CoA carboxylase/ reductase in antimycin biosynthesis2015

    • 著者名/発表者名
      Zhang, L., Mori, T., Zheng, Q., Awakawa, T., Yan, Y., Liu, W., Abe, I.,
    • 雑誌名

      Angewandte Chemie International Edition

      巻: 54 号: 45 ページ: 13462-13465

    • DOI

      10.1002/anie.201506899

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Decoding the Genetics of Modular Polyketide Synthases2017

    • 著者名/発表者名
      Lihan Zhang
    • 学会等名
      2nd US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products for Young Scientists
    • 発表場所
      東京工業大学ディジタル多目的ホール (東京都・目黒区)
    • 年月日
      2017-03-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] アンチマイシン生合成マシナリーの解明と多様性指向型合成生物学2016

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻、閻 岩、森 貴裕、淡川 孝義、劉 文、阿部 郁朗
    • 学会等名
      第58回天然有機化合物討論会
    • 発表場所
      東北大学百周年記念会館(宮城県・仙台市)
    • 年月日
      2016-09-13
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] モジュール型ポリケタイド合成酵素の遺伝子分析2016

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻, 秦 斌, 淡川 孝義, 岡田 正弘, 脇本 敏幸, 阿部 郁朗
    • 学会等名
      日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      東京大学農学部(東京都・文京区)
    • 年月日
      2016-09-08
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Deciphering and Manipulating the Modular Polyketide Synthases2016

    • 著者名/発表者名
      Lihan Zhang, Wen Liu, Ikuro Abe
    • 学会等名
      Gordon Research Conference 2016 Natural Products & Bioactive Compounds
    • 発表場所
      Andover, NH (U.S.A.)
    • 年月日
      2016-07-31
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 遺伝子解析に基づくポリエン系化合物の立体配置決定法の確立2016

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻、秦 斌、淡川 孝義、岡田 正弘、脇本 敏幸、阿部 郁朗
    • 学会等名
      第136回日本薬学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜 (神奈川県・横浜市)
    • 年月日
      2016-03-26
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] アンチマイシン生合成のエンジニアリングによる新規骨格類縁体の創出2015

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻、森 貴裕、淡川孝義、Wen Liu、阿部郁朗
    • 学会等名
      第6回食品薬学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学 (岡山県・岡山市)
    • 年月日
      2015-10-30
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] クロトニルCoA 炭酸化酵素AntE の構造に基づく合理的機能改変によるポリケタイド 生合成のエンジニアリング2015

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻、森 貴裕、淡川孝義、Wen Liu、阿部郁朗
    • 学会等名
      第30回日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      富山国際会議場 (富山県・富山市)
    • 年月日
      2015-09-07
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] メディオマイシン生合成遺伝子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻
    • 学会等名
      第20回天然薬物の開発と応用シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2014-11-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] メディオマイシン生合成遺伝子の同定2014

    • 著者名/発表者名
      張 驪駻
    • 学会等名
      2014年度日本放線菌学会大会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2014-06-20 – 2014-06-21
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 自然界が多様な化合物を生み出す遺伝子の組み替えメカニズム

    • URL

      http://www.u-tokyo.ac.jp/ja/utokyo-research/research-news/genetic-mechanism-for-structural-diversification-of-natural-compounds.html

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

URL: 

公開日: 2015-01-22   更新日: 2024-03-26  

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