大腸菌転写制御ネットワークの包括的解析

• 研究課題/領域番号: 15013221
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 饗場 浩文 名古屋大学, 大学院生命農学研究科, 助教授 (60211687)
• 研究分担者: 饗場 弘二 (饗庭 弘二) 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (20025662) ; 大島 拓 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (50346318) ; 山本 兼由 近畿大学, 農学部, 助手 (40351580)
• 研究期間 (年度): 2003 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 36,000千円 (直接経費: 36,000千円); 2004年度: 18,000千円 (直接経費: 18,000千円); 2003年度: 18,000千円 (直接経費: 18,000千円)
• キーワード: 大腸菌 / 2成分制御系 / 情報伝達 / 転写制御 / マイクロアレイ / クロストーク / ヒスチジンキナーゼ / レスポンスレギュレーター / リン酸化 / ストレス応答

研究概要

本研究では大腸菌をモデルとして、全2成分制御系が関わる細胞機能の全体像を解析した。まず、全2成分制御系を網羅する36株の単独欠失変異株を作製し、遺伝学的解析に加えマイクロアレイ解析、SELEX法を用いた解析などを行った。その結果、各2成分制御系により制御される遺伝子群(レギュロン)の同定とレスポンスレギュレーターの認識配列の同定ならびに推定が進んだ。さらに、大腸菌に存在する2成分制御系のほぼ全てに関して、感知するストレスシグナルの同定が進み、それらは代謝シグナル応答(炭素、窒素、呼吸関連化合物など)とイオン/金属ストレス応答(Fe, Cu, Mg, Zn, K, Pなど)ならびに多面的ストレス応答(細胞表層ストレス、酸化ストレス、浸透圧ストレスなど)に大別できることを示した。また、2成分制御系は単独で機能するのみならず、互いに影響しあいながらネットワークを形成している可能性が示唆された。
上記解析ならびにこれまでの解析から存在が示唆された2成分制御系間のクロストークに関して、精製タンパク質を用いた網羅的リン酸化反応を行い、非ペアのヒスチジンキナーゼとレスポンスレギュレーター間にクロストークを見いだした。さらに、ヒスチジンキナーゼの自己リン酸化、ヒスチジンキナーゼからレスポンスレギュレーターへのリン酸転移、リン酸化型レスポンスレギュレーターの脱リン酸化の各反応ステップによって、それぞれの2成分制御系が特徴づけられることが明らかとなった。今後は、これらin vitroでの解析成果をin vivoの各2成分制御系の働きとの関連で解析する必要がある。個別の解析では、嫌気状態のセンシングに関わる2成分制御系が鞭毛合成の制御に関与することなどが明らかとなった。
本研究の過程で、全2成分制御系遺伝子の欠失株セット、全遺伝子の高発現セット、全タンパク質精製用の発現プラスミドセットと精製タンパク質、大腸菌内two hybrid解析用プラスミドセット、各2成分制御系の活性化状態をモニターするためのレポーター遺伝子セットなどの重要な研究リソースも蓄積した。

研究成果

• [雑誌論文] Extracting relations between promoter sequences and their strengths from microarray data. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kiryu H
  • 雑誌名: Bioinformatics. 21 ページ: 1062-1068
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Analysis of hydrostatic pressure effects on transcription in Escherichia coli by DNA microarray procedure. (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii A
  • 雑誌名: Extremophiles. 9 ページ: 65-73
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 56 ページ: 215-227
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Targeting protein homodimerization : A novel drug discovery system. (2005)
  • 著者名/発表者名: Furuta, E.
  • 雑誌名: FEBS Lett. 579 ページ: 2065-2070
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Implication of membrane localization of target mRNA in the action of a small RNA : mechanism of post-transcriptional regulation of glucose transporter in Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kawamoto H
  • 雑誌名: Genes Dev. 19 ページ: 328-338
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Translation of aberrant mRNAs lacking a termination codon or with a shortened 3'-UTR is repressed after initiation in yeast. (2005)
  • 著者名/発表者名: Inada T
  • 雑誌名: EMBO J. 24 ページ: 1584-1595
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Functional characterization in vitro of all two-component signal transduction systems from Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 280 ページ: 1448-1456
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Extracting relations between promoter sequences and their strengths from microarray data. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kiryu H, Oshima T, Asai K.
  • 雑誌名: Bioinformatics. 21 ページ: 1062-1068
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Analysis of hydrostatic pressure effects on transcription in Escherichia coli by DNA microarray procedure. (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii A, Oshima T, Sato T, Nakasone K, Mori H, Kato C.
  • 雑誌名: Extremophiles. 9 ページ: 65-73
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 56 ページ: 215-227
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Targeting protein homodimerization : A novel drug discovery system. (2005)
  • 著者名/発表者名: Furuta, E., Yamamoto, K., Tatebe, D., Watabe, K., Kitayama, T., Utsumi, R.
  • 雑誌名: FEBS Lett 579 ページ: 2065-2070
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Implication of membrane localization of target mRNA in the action of a small RNA : mechanism of post-transcriptional regulation of glucose transporter in Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kawamoto H, Morita T, Shimizu A, Inada T, Aiba H.
  • 雑誌名: Genes Dev. 19 ページ: 328-338
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Translation of aberrant mRNAs lacking a termination codon or with a shortened 3'-UTR is repressed after initiation in yeast. (2005)
  • 著者名/発表者名: Inada T, Aiba H.
  • 雑誌名: EMBO J. 24 ページ: 1584-1595
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional characterization in vitro of all two-component signal transduction systems from Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Hirao, K., Oshima, T., Aiba, H., Utsumi, R., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 280 ページ: 1448-1456
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Functional characterization in vitro of all two-component signal transduction systems from Escherichia coli. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto K.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 1448-1456
• [雑誌論文] Transcriptional response of Escherichia coli to external copper. (2005)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto K.
  • 雑誌名: Mol.Microbiol. (In press)
• [雑誌論文] Analysis of hydrostatic pressure effects on transcription in Escherichia coli by DNA microarray procedure. (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii A.
  • 雑誌名: Extremophiles 9 ページ: 65-73
• [雑誌論文] Analysis of Gene Expression in Escherichia coli in Response to Changes of Growth-Limiting Nutrient in Chemostat Cultures. (2004)
  • 著者名/発表者名: Hua Q
  • 雑誌名: Appl Environ Microbiol. 70 ページ: 2354-2366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Effects of mutations in the rpoS gene on cell viability and global gene expression under nitrogen starvation in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kabir MS
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 2543-2553
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Signal transduction cascade between EvgA/EvgS and PhoP/PhoQ two-component systems of Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Eguchi, Y.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 186 ページ: 3006-3014
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Molecular characterization of the essential response regulator protein YycF in Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T.
  • 雑誌名: J. Molec. Microbiol. Biotechnol. 6 ページ: 155-163
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Negative Regulation of DNA Repair Gene (ung) Expression by CpxR/CpxA Two-component System in Escherichia coli K-12 and Induction of Mutations by Increased Expression of CpxR. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 186 ページ: 8317-8325
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Metabolic block at early stages of the glycolytic pathway activates the Rcs phosphorelay system via increased synthesis of dTDP-glucose in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: EI-Kazzaz W
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 51 ページ: 1117-1128
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Nascent peptide-mediated ribosome stalling at a stop codon induces mRNA cleavage resulting in nonstop mRNA that is recognized by tmRNA. (2004)
  • 著者名/発表者名: Sunohara, T.
  • 雑誌名: RNA 10 ページ: 378-386
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Enolase in the RNA degradosome plays a crucial role in the rapid decay of glucose transporter mRNA in the response to phosphosugar stress in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Morita T
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 54 ページ: 1063-1075
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Membrane localization itself but not binding to IICB is directly responsible for the inactivation of the global repressor Mlc in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Y
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 53 ページ: 941-951
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Ribosome stalling during translation elongation induces cleavage of mRNA being translated in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Sunohara T
  • 雑誌名: J Biol Chem. 279 ページ: 15368-15375
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Analysis of Gene Expression in Escherichia coli in Response to Changes of Growth-Limiting Nutrient in Chemostat Cultures. (2004)
  • 著者名/発表者名: Hua Q, Yang C, Oshima T, Mori H, Shimizu K.
  • 雑誌名: Appl Environ Microbiol. 70 ページ: 2354-2366
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Effects of mutations in the rpoS gene on cell viability and global gene expression under nitrogen starvation in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kabir MS, Sagara T, Oshima T, Kawagoe Y, Mori H, Tsunedomi R, Yamada M.
  • 雑誌名: Microbiology. 150 ページ: 2543-2553
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Signal transduction cascade between EvgA/EvgS and PhoP/PhoQ two-component systems of Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Eguchi, Y., Okada, T., Minagawa, S., Oshima, T., Mori, H., Yamamoto, K., Ishihama, A., Utsumi, R.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 186 ページ: 3006-3014
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Molecular characterization of the essential response regulator protein YycF in Bacillus subtilis. (2004)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Hashimaoto, Y., Umemoto, Y., Tatebe, D., Furuta, E., Fukamizo, T., Yamamoto, K., Utsumi R.
  • 雑誌名: J. Mol. Microbio. Biotech. 6 ページ: 155-163
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Negative Regulation of DNA Repair Gene (ung) Expression by CpxR/CpxA Two-component System in Escherichia coli K-12 and Induction of Mutations by Increased Expression of CpxR. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara, H., Teramoto, J., Hirao, K., Yamamoto, K., Ishihama, A., Utsumi, R.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 186 ページ: 8317-8325
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Metabolic block at early stages of the glycolytic pathway activates the Rcs phosphorelay system via increased synthesis of dTDP-glucose in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: El-Kazzaz W, Morita T, Tagami H, Inada T, Aiba H.
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 51 ページ: 1117-1128
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Nascent peptide-mediated ribosome stalling at a stop codon induces mRNA cleavage resulting in nonstop mRNA that is recognized by tmRNA. (2004)
  • 著者名/発表者名: Sunohara, T., Jojima, K., Yamamoto, Y, Inada, T, Aiba, H.
  • 雑誌名: RNA 10 ページ: 378-386
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Enolase in the RNA degradosome plays a crucial role in the rapid decay of glucose transporter mRNA in the response to phosphosugar stress in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Morita T, Kawamoto H, Mizota T, Inada T, Aiba H.
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 54 ページ: 1063-1075
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Membrane localization itself but not binding to IICB is directly responsible for the inactivation of the global repressor Mlc in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Y, Itoh F, Kimata K, Aiba H.
  • 雑誌名: Mol Microbiol. 53 ページ: 941-951
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Ribosome stalling during translation elongation induces cleavage of mRNA being translated in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Sunohara T, Jojima K, Tagami H, Inada T, Aiba H.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 279 ページ: 15368-15375
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Effects of mutations in the rpoS gene on cell viability and global gene expression under nitrogen starvation in Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kabir M.S.
  • 雑誌名: Microbiology 150 ページ: 2543-2553
• [雑誌論文] Signal transduction cascade between EvgA/EvgS and PhoP/PhoQ two-component systems of Escherichia coli. (2004)
  • 著者名/発表者名: Eguchi E.
  • 雑誌名: J Bacteriol. 186 ページ: 3006-3014
• [雑誌論文] Negative Regulation of DNA Repair Gene (ung) Expression by CpxR/CpxA Two-component System in Escherichia coli K-12 and Induction of Mutations by Increased Expression of CpxR. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ogasawara H.
  • 雑誌名: J.Bacteriol. 186 ページ: 8317-8325
• [雑誌論文] Identification and classification of two-component systems that affect rpoS expression in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Sugiura, M.
  • 雑誌名: Biosci. Biotech. Biochem. 67 ページ: 1612-1615
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of the Prrl response regulator with special reference to sexual development in Schizosaccharomyces pombe (2003)
  • 著者名/発表者名: Nakamichi, N.
  • 雑誌名: Biosci. Biotech. Biochem. 66 ページ: 547-555
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A defect in a fatty acyl-CoA synthetase gene, lcfl+, results in a decrease in viability after entry into the stationary phase in fission yeast. (2003)
  • 著者名/発表者名: Oshiro, T.
  • 雑誌名: Mol. Genet. Genomics. 269 ページ: 437-442
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Genome-wide analyses revealing a signaling network of the RcsC-YojN-RcsB phosphorelay system in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Hagiwara, D.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 5735-5746
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] In vitro properties of RpoS (sigma(S)) mutants of Escherichia coli with postulated N-Terminal subregion 1.1 or C-terminal region 4 deleted. (2003)
  • 著者名/発表者名: Gowrishankar, J.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 2673-2679
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Identification and molecular characterization of the Mg2+ stimulon of Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Minagawa, S.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 3696-3702
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional regulation of drug efflux genes by EvgAS, a two-component system in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Eguchi Y.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 2819-2828
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Role of a Nonnatural b-C-Nucleotide Unit in DNA as Template for DNA and RNA Synthesis and as Substrate for Nucleolytic Digestion. (2003)
  • 著者名/発表者名: Aketani, S.
  • 雑誌名: Eur. J. Phram. Sci. 20 ページ: 43-51
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Isolation and characterization of inhibitors of the essential histidine kinase, YycG in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus. (2003)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T
  • 雑誌名: J. Antibiotics 56 ページ: 1045-1052
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Two different modes of transcription repression of the Escherichia coli acetate operon by IclR. (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 47 ページ: 183-194
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] SsrA-mediated trans-translation plays a role in mRNA quality control by facilitating degradation of truncated mRNAs. (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, Y.
  • 雑誌名: RNA 9 ページ: 408-418
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Accumulation of Glucose-6-phosphate or Fructose-6-phosphate Is Responsible for Destabilization of Glucose Transporter mRNA in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Morita, T.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 278 ページ: 15608-15614
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characterization of the Prrl response regulator with special reference to sexual development in Schizosaccharomyces pombe. (2003)
  • 著者名/発表者名: Nakamichi, N., Yamada, H., Aiba, H., Aoyama, K., Ohmiya, R., Mizuno, T.
  • 雑誌名: Biosci. Biotech. Biochem. 67 ページ: 547-555
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A defect in a fatty acyl-CoA synthetase gene, lcfl +, results in a decrease in viability after entry into the stationary phase in fission yeast. (2003)
  • 著者名/発表者名: Oshiro, T., Aiba, H., Mizuno, T.
  • 雑誌名: Mol. Genet. Genomics. 269 ページ: 437-442
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification and classification of two-component systems that affect rpoS expression in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Sugiura, M., Aiba, H., Mizuno, T.
  • 雑誌名: Biosci. Biotech. Biochem. 67 ページ: 1612-1615
  • NAID: 110002694276
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Genome-wide analyses revealing a signaling network of the RcsC-YojN-RcsB phosphorelay system in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Hagiwara, D., Sugiura, M., Oshima, T., Mori, H., Aiba, H., Yamashino, T., Mizuno, T.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 5735-5746
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] In vitro properties of RpoS (sigma(S)) mutants of Escherichia coli with postulated N-Terminal subregion 1.1 or C-terminal region 4 deleted. (2003)
  • 著者名/発表者名: Gowrishankar, J., Yamamoto, K., Subbarayan, P.R., Ishihama, A.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 2673-2679
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Identification and molecular characterization of the Mg2+ stimulon of Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Minagawa, S.Ogasawara, H., Kato, A., Yamamoto, K., Eguchi, Y., Oshima, T., S., H., Ishihama, A., Utsumi, R.
  • 雑誌名: J. Bacteriol. 185 ページ: 3696-3702
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Transcriptional regulation of drug efflux genes by EvgAS, a two-component system in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Eguchi Y., Oshima T., Mori H., Aono R., Yamamoto, K., Ishihama A., Utsumi R.
  • 雑誌名: Microbiology 149 ページ: 2819-2828
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Role of a Nonnatural b-C-Nucleotide Unit in DNA as Template for DNA and RNA Synthesis and as Substrate for Nucleolytic Digestion. (2003)
  • 著者名/発表者名: Aketani, S., Tanaka, K., Yamamoto, K., Ishihama, A., Cao, H., Tengeiji, A., Shionoya, M.
  • 雑誌名: Eur. J. Phram. Sci. 20 ページ: 43-51
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Isolation and characterization of inhibitors of the essential histidine kinase, YycG in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus. (2003)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, T., Hashimoto, Y., Yamamoto, K., Hirao, K., Ishihama, A., Hino, M.Watanabe, T., Hashimoto, Y., Yamamoto, K., Hirao, K., Ishihama, A., Hino, M., Utsumi, R.
  • 雑誌名: J. Antibiotics 56 ページ: 1045-1052
  • NAID: 10011826328
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Two different modes of transcription repression of the Escherichia coli acetate operon by IcIR. (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, K., Ishihama, A.
  • 雑誌名: Mol. Microbiol. 47 ページ: 183-194
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] SsrA-mediated frans-translation plays a role in mRNA quality control by facilitating degradation of truncated mRNAs. (2003)
  • 著者名/発表者名: Yamamoto, Y., Sunohara, T., Jojima, K., Inada, T., Aiba, H.
  • 雑誌名: RNA 9 ページ: 408-418
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Accumulation of Glucose-6-phosphate or Fructose-6-phosphate Is Responsible for Destabilization of Glucose Transporter mRNA in Escherichia coli. (2003)
  • 著者名/発表者名: Morita, T., El-Kazzaz, W., Tanaka, Y, Inada, T, Aiba, H.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. ページ: 15608-15614
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Watanabe, T.: "Isolation and characterization of inhibitors of the essential histidine kinase, YycG in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus."J.Antibiotics. 56. 1045-1052 (2003)
• [文献書誌] Eguchi, Y.: "Transcriptional regulation of drug efflux genes by EvgAS, a two-component system in Escherichia coli."Microbiology. 149. 2819-2828 (2003)
• [文献書誌] Aketani, S.: "Role of a Nonnatural b-C-Nucleotide Unit in DNA as Template for DNA and RNA Synthesis and as Substrate for Nucleolytic Digestion."Eur.J.Phram.Sci.. 20. 43-51 (2003)
• [文献書誌] Minagawa, S.: "Identification and molecular characterization of the Mg2+ stimulon of Escherichia coli."J.Bacteriol.. 185. 3696-3702 (2003)
• [文献書誌] Gowrishankar, J.: "In Vitro Properties of RpoS (sigma(S)) Mutants of Escherichia coli with Postulated N-Terminal Subregion 1.1 or C-Terminal Region 4 Deleted."J.Bacteriol.. 185. 2673-2679 (2003)
• [文献書誌] Yamamoto, K.: "Two different modes of transcription repression of the Escherichia coli acetate operon by Ic1R"Mol.Microbiol.. 47. 183-194 (2003)
• [文献書誌] 中道範人: "分裂酵母における胞子形成制御するHis-Aspリン酸リレー情報伝達"日本農芸化学会誌. 78. 50-51 (2004)
• [文献書誌] Yamamoto, Y.: "SsrA-mediated trans-translation plays a role in mRNA quality control by facilitating degradation of truncated mRNAs."RNA. 9. 408-418 (2003)
• [文献書誌] EI-Kazzaz, W.: "Metabolic block at early stages of glycolytic pathway activates the Rcs phosphorelay system via increased synthesis of dTDP-glucose in Escherichia coli."Mol.Microbiol.. 51. 1117-1128 (2004)
• [文献書誌] Sunohara, T.: "Nascent peptide-mediated ribosome stalling at a stop codon induces mRNA cleavage resulting in nonstop mRNA that is recognized by tmRNA."RNA. 10. 378-386 (2004)
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