遺伝情報系と細胞シグナル系における超分子複合体の立体構造と機能

• 研究課題/領域番号: 15107002
• 研究種目: 基盤研究(S)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 横山 茂之 東京大学, 大学院・理学研究科, 教授 (00159229)
• 研究期間 (年度): 2003 – 2007
• 研究課題ステータス: 完了 (2007年度)
• 配分額: 111,410千円 (直接経費: 85,700千円、間接経費: 25,710千円); 2007年度: 14,820千円 (直接経費: 11,400千円、間接経費: 3,420千円); 2006年度: 16,510千円 (直接経費: 12,700千円、間接経費: 3,810千円); 2005年度: 21,190千円 (直接経費: 16,300千円、間接経費: 4,890千円); 2004年度: 23,920千円 (直接経費: 18,400千円、間接経費: 5,520千円); 2003年度: 34,970千円 (直接経費: 26,900千円、間接経費: 8,070千円)
• キーワード: 結晶構造解析 / 翻訳 / 転写 / 相互作用 / 人工遺伝暗号 / tRNA / X線結晶構造解析 / 立体構造 / RNA修飾 / アミノアシルtRNA合成酵素 / LSD1 / RNAポリメラーゼ / 翻訳制御 / 人工遺伝子暗号 / 複製 / 相同組み換え / Dmc1 / 修飾酵素 / セントロメア / RNAヘリカーゼ / 超分子複合体 / X線結晶解析 / Vase / CENP-B

研究概要

複数の生体高分子間の相互作用のカスケードによって成り立っている遺伝情報発現および細胞シグナル伝達のシステムに着目し、それらを構成する分子(タンパク質や核酸)の複合体の立体構造を解明し、相互作用の詳細を明らかにすることによって、システムの原子レベルでの解明を目指した。具体的には、遺伝暗号の翻訳においてアミノ酸とtRNAを正確に対応づける役割を担うアミノアシルtRNA合成酵素およびtRNAの転写後修飾・プロセシングを担う酵素群について、tRNA等の基質や特異的阻害剤との複合体のX線結晶構造解析を行い、その作用機序を解明した。また、ショウジョウバエにおいて生殖細胞の分化に関与しているDEAD-box RNAヘリケースであるVasaの構造解析に成功した。DEAD-box RNAヘリケースは真核生物に広く存在しており、その作用機構を解き明かした本研究の意義は大きい。さらに、転写を担うRNAポリメラーゼおよび減数分裂において染色体の相同組換反応をつかさどるDmc1の結晶構造をそれぞれ決定し、転写および相同組み換えの機構を解明した。構造解析によって得られた知見を応用し、有用な天然または非天然のアミノ酸を部位特異的にタンパク質に取り込ませるための人工遺伝暗号系の開発を行った。主にチロシンおよびリジン誘導体を導入する系の確立に成功し、有用な蛍光基、反応基、ないし重原子を含む基をもったアミノ酸を任意のタンパク質の任意の部位に取り込ませる技術への道を拓いた。

研究成果

• [雑誌論文] Crystal structure of archaeal tRNA (m(1)G37) methyltransferase aTrm5 (2008)
  • 著者名/発表者名: Goto-Ito, S.
  • 雑誌名: Proteins (In press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure and mutational study of a unique SpoU family archaeal methylase that forms 2'-O-methylcytidine at position 56 of tRNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J Mol Biol 375 ページ: 1064-75
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of histone demethylase LSDI and tranylcypromine at 2.25 A (2008)
  • 著者名/発表者名: Mimasu, S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 366 ページ: 15-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alteration of enzymatic properties of cell-surface antigen CD38 by agonistic anti-CD38 antibodies that prolong B cell survival and induce activation (2008)
  • 著者名/発表者名: Hara-Yokoyama, M.
  • 雑誌名: Int Immunopharmacol 8 ページ: 59-70
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallographic Studies on Multiple Conformational States of Active-site Loops in Pyrrolysyl-tRNA Synthetase (2008)
  • 著者名/発表者名: Yanagisawa, T.
  • 雑誌名: J Mol Biol (In press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure and mutational study of a unique SpoU family archaeal methylase that forms 2^1-O-methylcytidine at position 56 of tRNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M., Bessho, Y., Nishimoto, M., Grosjean, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 375(4) ページ: 1064-1075
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of histone demethylase LSD1 and tranylcypromine at 2.25 A (2008)
  • 著者名/発表者名: Mimasu, S., Sengoku, T, Fukuzawa, S., Umehara, T., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 366(1) ページ: 15-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Alteration of enzymatic properties of cell-surface antigen CD38 by agonistic anti-CD38 antibodies that prolong B cell survival and induce activation (2008)
  • 著者名/発表者名: Hara-Yokoyama, M., Kimura, T., Kaku, H., Wakiyama, M., Kaitsu, Y., Inoue, M., Kusano, S., Shirou, M., Yokoyama, S., katada, T., Hirabayashi, Y., Takatsu, K., Yanagishita, M.
  • 雑誌名: Int Immunopharmacol 8(1) ページ: 59-70
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallographic Studies on Multiple Conformational States of Active-site Loops in Pyrrolysyl-tRNA Synthetase (2008)
  • 著者名/発表者名: Yanagisawa, T., Ishii, R., Fukunaga, R., Kobayashi, T., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: j Mol Biol in press
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of archaeal tRNA(m(1)G37)methyltransferase aTrm5 (2008)
  • 著者名/発表者名: Goto-Ito, S.
  • 雑誌名: Proteins In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clystal structure and mutational study of a unique SpoU farnily archaeal methylase that forms2'-O-methylcytidine at position 56 of tRNA (2008)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J Mol Biol 375 ページ: 1064-1075
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of histone demethylase LSDl and tranylcypromine at 2.25 A (2008)
  • 著者名/発表者名: Mimasu, S.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 366 ページ: 15-22
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural insights into the first step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 14 ページ: 272-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of alanyl-tRNA synthetase from the archaeon Archaeoglobus fulgidus (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63 ページ: 224-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The C-terminal domain of the archaeal leucyl-tRNA synthetase prevents misediting of isoleucyl-tRNA (Ile) (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Biochemistry 46 ページ: 4985-96
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural insights into the second step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea: crystal structure of Sep-tRNA: Cys-tRNA synthase from Archaeoglobus fulgidus (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: J Mol Biol 370 ページ: 128-41
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of the AlaX-M trans-editing enzyme from Pyrococcus horikoshii (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63 ページ: 390-40
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of an archaeal TYW1, the enzyme catalyzing the second step of wye base biosynthesis (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto-Ito, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63 ページ: 1059-68
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of non-natural amino acids into proteins in mammalian cells with an expanded genetic code (2007)
  • 著者名/発表者名: Hino, N.
  • 雑誌名: Nat Protoc 1 ページ: 2957-62
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The structure of the flexible arm of Thermotoga maritima tRNase Z differs from those of homologous enzymes (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63 ページ: 637-41
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of the initial binding of tRNA (Ile) lysidine synthetase TilS with ATP and L-lysine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: Structure 15 ページ: 1642-53
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for functional mimicry of long-variable-arm tRNA by transfer-messenger RNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Bessho, Y.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 104 ページ: 8293-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for interaction of the ribosome with the switch regions of GTP-bound elongation factors (2007)
  • 著者名/発表者名: Connell. S. R.
  • 雑誌名: Mol Cell 25 ページ: 751-64
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural aspects of RbfA action during small ribosomal subunit assembly (2007)
  • 著者名/発表者名: Datta, P. P.
  • 雑誌名: Mol Cell 28 ページ: 434-45
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] A snapshot of the 30S ribosomal subunit capturing mRNA via the Shine-Dalgarno interaction (2007)
  • 著者名/発表者名: Kaminishi, T.
  • 雑誌名: Structure 15 ページ: 289-97
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-specific functionalization of proteins by organopalladium reactions (2007)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K.
  • 雑誌名: Chembiochem 8 ページ: 232-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Curved EFC/F-BAR-domain dimers are joined end to end into a filament for membrane invagination in endocytosis (2007)
  • 著者名/発表者名: Shimada, A
  • 雑誌名: Cell 129 ページ: 761-72
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The putative DNA-binding protein Sto12a from the thermoacidophilic archaeon Sulfolobus tokodaii contains intrachain and interchain disulfide bonds (2007)
  • 著者名/発表者名: Shinkai, A.
  • 雑誌名: J Mol Biol 372 ページ: 1293-304
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of the role of Aurora B on the chromosomal targeting of condensin I (2007)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 35 ページ: 2403-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Let-7 microRNA-mediated mRNA deadenylation and translational repression in amammalian cell-free system (2007)
  • 著者名/発表者名: Wakiyama, M.
  • 雑誌名: Genes Dev 21 ページ: 1857-62
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] TAF4-homology domain from the corepressor ETO is a docking platform for positive and negative regulators of transcription (2007)
  • 著者名/発表者名: Wei, Y.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 14 ページ: 653-61
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of archaeal tRNA(m(1)G37)methyltransferase aTrm5 (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto-lto, S., Ito, T., Ishii, R., Muto, Y., Bessho, Y., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proteins (In press)
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural insights into the first step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 14(4) ページ: 272-279
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of alanyl-tRNA synthetase from the archaeon Archaeoglobus fulgidus (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63(Pt 3) ページ: 224-228
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The C-terminal domain of the archaeal leucyl-tRNA synthetase prevents misediting of isoleucyl-tRNA(lle) (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Biochemistry 46(17) ページ: 4985-4996
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural insights into the second step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea : crystal structure of Sep-tRNA : Cys-tRNA synthase from Archaeoglobus fulgidus (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 370(1) ページ: 128-141
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structure of the AIaX-M trans-editing enzyme from Pyrococcus horikoshii (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63(Pt 3) ページ: 390-400
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structure of an archaeal TYW1, the enzyme catalyzing the second step of wye-base biosynthesis (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto-Ito, S., Ishii, R, Ito, T., Shibata, R, Fusatomi, E., Sekine, S. I., Bessho, Y., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63(Pt 10) ページ: 1059-1068
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of non-natural amino acids into proteins in mammalian cells with an expanded genetic code (2007)
  • 著者名/発表者名: Hino, N., Hayashi, A., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Protoc 1(6) ページ: 2957-2962
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The structure of the flexible arm of Thermotoga maritima tRNase Z differs from those of homologous enzymes (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R., Minagawa, A., Takaku, H., Takagi, M., Nashimoto, M., Yokoyama, S
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63(Pt 8) ページ: 637-641
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis of the initial binding of tRNA(Ile) lysidine synthetase TilS with ATP and L-lysine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M., Yoshikawa, Y., Bessho, Y., Higashijima, K., Ishii, T., Shibata, R, Takahashi, S., Yutani, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Structure 15(12) ページ: 1642-1653
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for functional mimicry of long-variable-arm tRNA by transfer-messenger RNA (2007)
  • 著者名/発表者名: Bessho, Y., Shibata, R., Sekine, S., Murayama, K., Higashijima, K., Hori-Takemoto, C., Shirouzu, M., Kuramistsu, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 104(20) ページ: 8293-8298
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for interaction of the ribosome with the switch reginons of GTP-bound elongation factors (2007)
  • 著者名/発表者名: Connell, S. R., Takemoto, C., Wlison, D. N Wang, H., Murayama, K., Teraka, T., Shirouzu, M., Rost, M., Schuler, M., Giesebrecht, J., Dabrowski, M., Mielke, T., Fucini, P., Yokoyama, S., Spahn, C. M.
  • 雑誌名: Mol Cell 25(5) ページ: 751-764
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural aspects of RbfA action during small ribosomal subunit assembly (2007)
  • 著者名/発表者名: Datta, P. P., Wilson, D. N., Kawazoe, M., Swami, N, K., Kaminishi, T., Sharma, M. R., Booth, T. M., Takemoto, C., Fucini, P., Yokoyama, S., Agrawal, R. K.
  • 雑誌名: Mol Cell 28(3) ページ: 434-445
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A snapshot of the 30S ribosomal subusomal subunit capturing mRNA via the Shine-Dalgarno interaction (2007)
  • 著者名/発表者名: Kaminishi, T., Wilson, D. N., Takemoto, C., Harms, J. M., Kawazoe, M., Schluenzen, F., Hanawa-Suetsugu, K., Shirouzu, M., Fucini, P., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Structure 15(3) ページ: 289-297
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Site-specific functionalization of proteins by organopalladium reactions (2007)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K., Fukuzawa, S., Nakayama, H., Sakamoto, K., Kigawa, T., Yabuki, T., Matsuda, N., Shirouzu, M., Takio, K., Yokoyama, S., Tachibana, K.
  • 雑誌名: Chenbiochem 8(2) ページ: 232-238
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Curved EFC/F-BAR-domain dimers are joined end to end into a filament for membrane invagination in endocytosis (2007)
  • 著者名/発表者名: Shimada, A., Niwa, H., Tsujita, K., Suetsugu, S., Nitta, K., Hanawa-Suetsugu, K., Akasaka, R., Nishino, Y., Toyama, M., Chen, L., Liu, Z. J., Wang, B. C., Yamamoto, M., Terada, T., Miyazawa, A., Tanaka, A., Sugano, S., Shirouzu, M., Nagayama, K., Takenawa, T., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Cell 129(4) ページ: 761-772
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The putative DNA-binding protein Stol2a from the thermoacidophilic archaeon Sulfolobus tokodaii contains intrachain and interchain disulfide bonds (2007)
  • 著者名/発表者名: Shinkai, A., Sekine, S., Urushibata, A., Terada, T., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 372(5) ページ: 1293-1304
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Analysis of the tole of Aurora B on the chromosomal targeting of condensin I (2007)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A., Murayama, A., Katano, M., Urano, T., Furukawa, K., Yokoyama, S., Yanagisawa, J., Hanaoka, F., Kimura, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 35(7) ページ: 2403-2412
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] let-7microRNA-mediated mRNA deadenylation and translationla repression in a mammalian cell-free system (2007)
  • 著者名/発表者名: Wakiyama, M., Takimoto, K., Ohata, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Genes Dev 21(15) ページ: 1857-1862
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A TAF4-homology domain from the corepressor ETO is a docking platform for positive and negative regulators of transcription (2007)
  • 著者名/発表者名: Wei, Y., Liu, S., Lausen, J., Woodrell, C., Cho, S., Biris, N., Kobayashi, N., Wei, Y., Yokoyama, S., Werner, M. H.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 14(7) ページ: 653-661
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structure of the AlaX-M trans-editing enlyme from Pyrococcus horikoshii (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63 ページ: 390-400
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of an archaeal TYWl, the enzyme catalyzing the second step of Wye-base biosynthesis (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto-Ito, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63 ページ: 1059-1068
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of the initial bhlding of tRNA(lle) lysidine synthetase TilS with ATP and L-1ysine (2007)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: Structure 15 ページ: 1642-1653
  • 査読あり
• [雑誌論文] The C-Terminal Domain of the Archaeal Leucyl-tRNA Synthetase Prevents Misediting of Isoleucyl-tRNA^<Ile> (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Biochemistry (In press)
• [雑誌論文] Structural basis of CoA recognition by the Pyrococcus single-domain CoA-vinding proteins (2007)
  • 著者名/発表者名: Hiyama, T. B.
  • 雑誌名: J. Struct. Funct. Genomics (In press)
• [雑誌論文] Structural insights into the first step of RNA-dependent cysteine biosynthesis in archaea (2007)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol. 14 ページ: 272-279
• [雑誌論文] Structural basis for substrate recognition by the editing domain of isoleucyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: J Mol Biol 359 ページ: 901-12
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the single-domain rhodanese homologue TTHA0613 from The rmus thermophilus HB8 (2006)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M.
  • 雑誌名: Proteins 64 ページ: 284-7
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of CoA recognition by the Pyrococcus single-domain CoA-binding proteins (2006)
  • 著者名/発表者名: Hiyama, T. B.
  • 雑誌名: J Struct Funct Genomics 7 ページ: 119-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of the water-assisted asparagine recognition by asparaginyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, W.
  • 雑誌名: J Mol Biol 360 ページ: 329-42
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structures of tyrosyl-tRNA synthetases from Archaea (2006)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J Mol Biol 355 ページ: 395-408
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and mutational studies of the amino acid-editing domain from archaeal/eukaryal phenylalanyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Sasaki, H. M.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 103 ページ: 14744-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural bases of transfer RNA-dependent amino acid recognition and activation by glutamyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Sekine, S.
  • 雑誌名: Structure 14 ページ: 1791-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa (2006)
  • 著者名/発表者名: Sengoku, T.
  • 雑誌名: Cell 125 ページ: 287-300
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] An unnatural hydrophobic base pair system: site-specific incorporation of nucleotide analogs into DNA and RNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Hirao, I.
  • 雑誌名: Nat Methods 3 ページ: 729-35
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regioselective carbon-carbon bond formation in proteins with palladium catalysis; new protein chemistry by organometallic chemistry (2006)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K.
  • 雑誌名: Chembiochem 7 ページ: 134-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] A new protein engineering approach combining chemistry and biology, part I; site-specific incorporation of 4-iodo-L-phenylalanine in vitro by using misacylated soppressor tRNAPhe (2006)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K.
  • 雑誌名: Chembiochem 7 ページ: 1577-81
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tbmperature-dependent biosynthesis of 2-thioribothymidine of Thermus thermophilus tRNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Shigi, N.
  • 雑誌名: J Biol Chem 281 ページ: 2104-13
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The RAC binding domain/IRSp53-MIM homology domain of IRSp53 induces RAC-dependent membrane deformation (2006)
  • 著者名/発表者名: Suetsugu, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 281 ページ: 35347-58
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Negative regulation of condensin I by CK2-mediated phosphorylation (2006)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A.
  • 雑誌名: EMBO J 25 ページ: 5339-48
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the catalytic domain of pyrrolysyl-tRNA synthetase from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei (2006)
  • 著者名/発表者名: Yanagisawa, T.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 62 ページ: 1031-3
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for substrate recognition by the editing domain of isoleucyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 359(4) ページ: 901-912
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the single-domain rhodanese homologue TTHA0613 from Thermus thermophilus HB8 (2006)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M., Mizohata, E., Tatsuguchi, A., Shibata, R, Kishishita, S., Murayama, K., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proteins 64(1) ページ: 284-287
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis of CoA recognition by the Pyrococcus single-domain CoA-binding proteins (2006)
  • 著者名/発表者名: Hiyama, T. B., Zhao, M., Kitago, Y., Yao, M., Sekine, S., Terada, T., Kuroishi, C., Liu, Z. J., Rose, J. P., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Watanabe, N., Yokoyama, S., Tanaka, I., Wang, B. C.
  • 雑誌名: J Struct Funct Genomics 7(3-4) ページ: 119-129
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis of the water-assisted asparagine recognition by asparaginyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, W, Sekine, S., Kuroishi, C., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mot Biol 360(2) ページ: 329-342
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structures of tyrosyl-tRNA synthetases from Archaea (2006)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M., Sakai, H., Takahashi, M., Yanagisawa, T., Kobayashi, T., Murayama, K., Chen, L., Liu, Z. J., Wang, B. C., Kuroishi, C., Kuramitsu, S., Terada, T., Bessho, Y., Shirouzu, M., Sekine, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 355(3) ページ: 395-408
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural and mutational studies of the amino acid-editing domain from archaeal/eukaryal phenylalanyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Sasaki, H. M., Sekine, S., Sengoku, T., Fukunaga, R., Hattori, M., Utsunomiya, Y, Kuroishi, C., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 103(40) ページ: 14744-14749
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural bases of transfer RNA-dependent amino acid recognition and activation by glutamyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Sekine, S., Shichiri, M., Bernier, S., Chenevert, R., Lapointe, J., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Structure 14(12) ページ: 1791-1799
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa (2006)
  • 著者名/発表者名: Sengoku, T., Nureki, O., Nakamura, A., Kobayashi, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Cell 125(2) ページ: 287-300
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A new protein engineering approach combining chemistry and biology, part I; site-specific incorporation of 4-iodo-L-phenylalanine in vitro by using misacylated suppressor tRNAPhe (2006)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K., Fukuzawa, S., Sakamoto, K., Nakayama, H., Kigawa, T., Yabuki, T., Matsuda, N., Shirouzu, M., Takio, K., Tachibana, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Chembiochem 7(10) ページ: 1577-1581
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Temperature-dependent biosynthesis of 2-thioribothymidine of Thermus thermophilus tRNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Shigi, N., Suzuki, T., Terada, T., Shirouzu, M., Yokoyama, S., Watanabe, K
  • 雑誌名: J Biol Chem 281(4) ページ: 2104-2113
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The RAC binding domain/IRSp53-MIM homology domain of IRSp53 induces RAC-dependent membrane deformation (2006)
  • 著者名/発表者名: Suetsugu, S., Murayama, K, Sakamoto, A., Hanawa-Suetsugu, K., Seto, A., Oikawa, T., Mishima, C., Shirouzu, M., Takenawa, T., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 281(46) ページ: 35347-35358
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Negative regulation of condensin I by CK2-mediated phosphorylation (2006)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A., Kimura, K., Yanagisawa, J., Yokoyama, S., Hanaoka, F.
  • 雑誌名: EMBO J 25(22) ページ: 5339-5348
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the catalytic domain of pyrrolysyl-tRNA synthetase from the methanogenic archaeon Methanosarcina mazei (2006)
  • 著者名/発表者名: Yanagisawa, T., Ishii, R., Fukunaga, R, Nureki, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 62(Pt 10) ページ: 1031-1033
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An unnatural hydrophobic base pair system : site-specific incopration of nucleotide analogs into DNA and RNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Hirao, I., Kimoto, M., Mitsui, T., Fujiwara, T., Kawai, R., Sato, A., Harada, Y., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Methods 3(9) ページ: 729-735
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] regioselective carbon-carbon bond formation in proteins with palladium catalysis; new protein chemistry by organometallic chemistry (2006)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K., Fukuzawa, S., Nakayama, H., Kigawa, T., Sakamoto, K., Yabuki, T., Matsuda, N., Shirouzu, M., Takio, K., Tachibana, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Chembiochem 7(1) ページ: 134-139
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of non-natural amino acids into proteins in mammalian cells with an expanded genetic code (2006)
  • 著者名/発表者名: Hino, N.
  • 雑誌名: Nat. Protoc. 1 ページ: 2957-2962
• [雑誌論文] Structural and mutational studies of the amino acid-editing domain from archaeal/eukaryal phenylalanyl-tRNA (2006)
  • 著者名/発表者名: Sasaki, H. M.
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 103 ページ: 14744-14749
• [雑誌論文] Stimulation of Dmcl-mediated DNA strand exchange by the human Rad54B protein (2006)
  • 著者名/発表者名: Sarai, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 34 ページ: 4429-4437
• [雑誌論文] Structural basis of the water-assisted asparagine recognition by asparaginyl-tRNa synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, W.
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 360 ページ: 329-342
• [雑誌論文] Crystal structure of the single-domain rhodanese homologue TTHA0613 from Thermus thermophilus HB8 (2006)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M.
  • 雑誌名: Proteins 64 ページ: 284-287
• [雑誌論文] Structural basis for substrate recognition by the editing domain of isoleucyl-tRNA synthetase (2006)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 359 ページ: 901-912
• [雑誌論文] Structural basis for RNA unwinding by the DEAD-box protein Drosophila Vasa (2006)
  • 著者名/発表者名: Sengoku, T.
  • 雑誌名: Cell (In press)
• [雑誌論文] Crystal structure of the single-domain rhodanese homologue TTHA0613 from Thermus thermophilus HB8 (2006)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M.
  • 雑誌名: Protein Sci. (In press)
• [雑誌論文] Regioselective carbon-carbon bond formation in proteins with palladium catalysis; New protein chemistry by organometallic chemistry (2006)
  • 著者名/発表者名: Kodama, K
  • 雑誌名: Chem Bio Chem. (Published on line)
• [雑誌論文] Crystal structures of tyrosyl-tRNA synthetases from Archaea (2006)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 355 ページ: 395-408
• [雑誌論文] Crystallization of leucyl-tRNA synthetase complexed with tRNALeu from the archaeon Ryrococcus horikoshii (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commu 61 ページ: 30-2
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Aminoacylation complex structures of leucyl-tRNA synthetase and tRNALeu reveal two modes of discriminator-base recognition (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 12 ページ: 915-22
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for non-cognate amino acid discrimination by the valyl-tRNA synthetase editing domain (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 29937-45
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of leucyl-tRNA synthetase from the archaeon Pyrococcus horikoshii reveals a novel editing domain orientation (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: J Mol Biol 346 ページ: 57-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the hypothetical protein TTHA1013 from Thermus thermophilus HB8 (2005)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M.
  • 雑誌名: Proteins 61 ページ: 1117-20
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein photo-cross-linking in mammalian cells by site-specific incorporation of a photoreactive amino acid (2005)
  • 著者名/発表者名: Hino, N.
  • 雑誌名: Nat Methods 2 ページ: 201-6
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the tRNA 3′ processing endoribonuclease tRNase Z from The rmotoga maritima (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 14138-44
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of nonnatural amino acid recognition by an engineered aminoacyl-tRNA synthetase for genetic code expansion (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, T.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 102 ページ: 1366-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural snapshots of the KMSKS loop rearrangement for amino acid activation by bacterial tyrosyl-tRNA synthetase (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, T.
  • 雑誌名: J Mol Biol 346 ページ: 105-17
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of tRNA adenosine deaminase (TadA) from Aquifex aeolicus (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 16002-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The crystal structure of leucyl-tRNA synthetase complexed with tRNALeu in the post-transfer-editing conformation (2005)
  • 著者名/発表者名: Tukalo, M.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 12 ページ: 923-30
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU(TrmH) RNA methyltransferase family (2005)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, K.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 10368-77
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Role of the N-terminal domain of the human DMC1 protein in octamer formation and DNA binding (2005)
  • 著者名/発表者名: Kinebuchi, T.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 28382-7
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the N-terminal RecA-like domain of a DEAD-box RNA helicase, the Dugesia japonica vasa-like gene B protein (2005)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K.
  • 雑誌名: J Struct Biol 150 ページ: 58-68
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of a putative trans-editing enzyme for prolyl-tRNA synthetase from Aeropyrum pernix K1 at 1.7 A resolution (2005)
  • 著者名/発表者名: Murayama, K.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 61 ページ: 26-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Interaction of Era with the 30S ribosomal subunit implications for 30S subunit assembly (2005)
  • 著者名/発表者名: Sharma, M.R.
  • 雑誌名: Mol Cell 18 ページ: 319-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Human centromere protein B induces translational positioning of nucleosomes on alpha-satellite sequences (2005)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280 ページ: 41609-18
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] CpG methylation of the CENP-B box reduces human CENP-B binding (2005)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y.
  • 雑誌名: FEBS J 272 ページ: 282-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization of leucyl-tRNA synthetase complexed with tRNALeu from the archaeon Pyrococcus horikoshii (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Ishitani, R., Nureki, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 61(Pt 1) ページ: 30-32
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Aminoacylation complex structures of leucyl-tRNA synthetase and tRNALeu reveal two modes of discriminator-base recognition (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Struct Mot Biol 12(10) ページ: 915-922
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for non-cognate amino acid discrimination by the valyl-tRNA synthetase editing domain (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(33) ページ: 29937-429945
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of leucyl-tRNA synthetase from the archaeon Pyrococcus horikoshii reveals a novel editing domain orientation (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biot 346(1) ページ: 57-71
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the hypothetical protein TTHA1013 from Thermus thermophilus HB8 (2005)
  • 著者名/発表者名: Hattori, M., Mizohata, E., Manzoku, M., Bessho, Y., Murayama, K., Terada, T., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proteins 61(4) ページ: 1117-1120
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Protein photo-cross-linking in mammalian cells by site-specific incorporation of a photoreactive amino acid (2005)
  • 著者名/発表者名: Hino, N., Okazaki, Y., Kobayashi, T., Hayashi, A., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Methods 2(3) ページ: 201-206
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the tRNA 3' processing endoribonuclease tRNase Z from Thermotoga maritima (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R., Minagawa, A., Takaku, H., Takagi, M., Nashimoto, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(14) ページ: 14138-14144
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis of nonnatural amino acid recognition by an engineered aminoacyl-tRNA synthetase for genetic code expansion (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, T., Sakamoto, K., Takimura, T., Sekine, R., Kelly, V. P., Kamata, K., Nishimura, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 102(5) ページ: 1366-1371
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural snapshots of the KMSKS loop rearrangement for amino acid activation by bacterial tyrosyl-tRNA synthetase (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, T., Takimura, T., Sekine, R., Kelly, V. P., Kamata, K., Sakamoto, K., Nishimura, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 346(1) ページ: 105-117
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of tRNA adenosine deaminase (TadA) from Aquifex aeolicus (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M., Ishii, R., Bessho, Y., Fukunaga, R., Sengoku, T., Shirouzu, M., Sekine, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(16) ページ: 16002-16008
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The crystal structure of leucyl-tRNA synthetase complexed with tRNALeu in the post-transfer-editing conformation (2005)
  • 著者名/発表者名: Tukalo, M., Yaremchuk, A., Fukunaga, R., Yokoyama, S., Cusack, S.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 12(10) ページ: 923-930
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Role of the N-terminal domain of the human DMC1 protein in octamer formation and DNA binding (2005)
  • 著者名/発表者名: Kinebuchi, T., Kagawa, W., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(31) ページ: 28382-28387
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the N-terminal RecA-like domain of a DEAD-box RNA helicase, the Dugesia japonica vasa-like gene B protein (2005)
  • 著者名/発表者名: Kurimoto, K., Muto, Y., Obayashi, N., Terada, T., Shirouzu, M., Yabuki, T., Aoki, M., Seki, E., Matsuda, T., Kigawa, T., Okumura, H., Tanaka, A., Shibata, N., Kashikawa, M., Agata, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Struct Biol 150(1) ページ: 58-68
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structure of a putative trans-editing enzyme for prolyl-tRNA synthetase from Aeropyrum pernix K1 at 1.7 A resolution (2005)
  • 著者名/発表者名: Murayama., K, Kato-Murayama, M., Katsura, K, Uchikubo-Kamo, T., Yamaguchi-Hirafuji, M., Kawazoe, M., Akasaka, R., Hanawa-Suetsugu, K., Hori-Takemoto, C., Terada, T., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 61(Pt 1) ページ: 26-29
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Interaction of Era with the 30S ribosomal subunit implications for 30S subunit assembly (2005)
  • 著者名/発表者名: Sharma, M. R., Barat, C., Wilson, D. N., Booth, T. M., Kawazoe, M., Hori-Takemoto, C., Shirouzu, M., Yokoyama, S., Fucini, P., Agrawal, R., K.
  • 雑誌名: Mol Cell 18(3) ページ: 319-329
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Human centromere protein B induces translational positioning of nucleosomes on alpha-satellite sequences (2005)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y., Tachiwana, H., Yoda, K., Masumoto, H., Okazaki, T., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(50) ページ: 41609-41618
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] "CpG methylation of the CENP-B box reduces human CENP-B binding (2005)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: FEBS J 272(1) ページ: 282-289
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The Aminoacyl-tRNA Synthetases : Chapter7 & 8 (2005)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.
  • 雑誌名: The Aminoacyl-tRNA Synthetase Landes Bioscience
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TrmH0 RNA methyltransferase family (2005)
  • 著者名/発表者名: Watanabe, K., Nureki, O., Fukai, S., Ishiii, Okamoto, H., Yokoyama, S., Endo, Y., Hori, H.
  • 雑誌名: J Biol Chem 280(110 ページ: 10368-10377
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of tRNA adenosine deaminase (TadA) from Aguifex aeolicus (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuratani, M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 16002-16008
• [雑誌論文] Crystal structure of the tRNA 3' processing endoribonuclease tRNase Z from Thermotoga maritima (2005)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 280 ページ: 14138-14144
• [雑誌論文] Aminoacylation complex structures of leucyl-tRNA synthetase and tRNALeu reveal two modes of discriminator-base recognition (2005)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R.
  • 雑誌名: Nat.Struct.Mol.Biol. 12 ページ: 915-922
• [雑誌論文] The crystal structure of leucyl-tRNA synthetase compiexed with tRNALeu in the post-transfer-editing conformation (2005)
  • 著者名/発表者名: Tukalo, M.
  • 雑誌名: Nat.Struct.Mol.Biol. 12 ページ: 287-288
• [雑誌論文] Protein photo-cross-linking in mammalian cells by site-specific incorporation of a non-natural amino acid (2005)
  • 著者名/発表者名: 樋野展正
  • 雑誌名: 実験医学 23 ページ: 2047-2051
• [雑誌論文] Crystal structure of the RNA 2'-phosphotranse from Aeropyrum pernix K1 (2005)
  • 著者名/発表者名: Kato-Murayama M.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. (in press)
• [雑誌論文] Crystal structure of tRNA adenosine deaminase TadA from Aquifex aeolicus (2005)
  • 著者名/発表者名: Kuratani M.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. (in press)
• [雑誌論文] Structural snapshots of the KMSKS loop rearrangement for amino-acid activation by bacterial tyrosyl-tRNA synthetase (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T.
  • 雑誌名: J.Mol.Biol. 346 ページ: 105-117
• [雑誌論文] Structural basis of non-natural amino acid recognition by an engineered aminoacyl-tRNA synthetase for genetic code expansion (2005)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T.
  • 雑誌名: Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102 ページ: 1366-1371
• [雑誌論文] Crystal structures of the CPl domain from Thermus thermophilus isoleucyl-tRNA synthetase and its complex with L-valine (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R
  • 雑誌名: J Biol Chem 279 ページ: 8396-402
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of the editing domain of Thermus thermophilus isoleucyl-tRNA synthetase complexed with pre-and post-transfer editing-substrate analogues (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60 ページ: 19002-19002
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of leucyl-tRNA synthetase from the archaeon pyrococcus horikoshii (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60 ページ: 1916-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] A short peptide insertion crucial for angiostatic activity of human tryptophanyl-tRNA synthetase (2004)
  • 著者名/発表者名: Kise, Y.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 11 ページ: 149-56
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Deep knot structure for construction of active site and cofactor binding site of tRNA modification enzyme (2004)
  • 著者名/発表者名: Nureki, O.
  • 雑誌名: Structure 12 ページ: 593-602
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] tRNA recognition by glutamyl-tRNA reductase (2004)
  • 著者名/発表者名: Randau, L.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279 ページ: 34931-7
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Escherichia coli argU10(Ts)phenotype is caused by a reduction in the cellular level of the argU tRNA for the rare codons AGA and AGG (2004)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, K.
  • 雑誌名: J Bacteriol 186 ページ: 5899-905
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the helicase domains of Vasa complexed with RNA and an ATP analogue (2004)
  • 著者名/発表者名: Sengoku, T.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60 ページ: 320-2
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for transcription regulation by alarmone ppGpp (2004)
  • 著者名/発表者名: Artsimovitch, I.
  • 雑誌名: Cell 117 ページ: 299-310
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of hemimethylated DNA binding by the SeqA protein (2004)
  • 著者名/発表者名: Fujikawa, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 32 ページ: 82-92
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of elongation factor P from Thermus thermophilus HB8 (2004)
  • 著者名/発表者名: Hanawa-Suetsugu, K
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 101 ページ: 9595-600
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally resemble the decoding site of 16S ribosomal RNA (2004)
  • 著者名/発表者名: Hirao, I.
  • 雑誌名: Biochemistry 43 ページ: 3214-21
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structure of a BolA-like protein from Mus musculus (2004)
  • 著者名/発表者名: Kasai, T.
  • 雑誌名: Protein Sci 13 ページ: 545-545
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of a photo-crosslinking component into RNA by T7 transcription mediated by unnatural base pairs (2004)
  • 著者名/発表者名: Kimoto, M.
  • 雑誌名: Chem Biol 11 ページ: 47-55
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for octameric ring formation and DNA interaction of the human homologous-pairing protein Dmcl (2004)
  • 著者名/発表者名: Kinebuchi, T.
  • 雑誌名: Mol Cell 14 ページ: 363-74
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structure of the SEA domain from the murine homologue of ovarian cancer antigen CA125 (MUC16) (2004)
  • 著者名/発表者名: Maeda, T.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279 ページ: 13174-82
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regulation through the secondary channel-structural framework for ppGpp-DksA synergism during transcription (2004)
  • 著者名/発表者名: Perederina, A.
  • 雑誌名: Cell 118 ページ: 297-309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cell cycle-dependent phosphorylation, nuclear localization, and activation of human condensin (2004)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279 ページ: 4551-9
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for substrate selection by T7 RNA polymerase (2004)
  • 著者名/発表者名: Temiakov, D.
  • 雑誌名: Cell 116 ページ: 381-91
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Expression and purification of recombinant human histones (2004)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y
  • 雑誌名: Methods 33 ページ: 3-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cloning, expression, purification, crystallization and initial crystallographic analysis of transcription factor DksA from Escherichia coli (2004)
  • 著者名/発表者名: Vassylyeva, M. N.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60 ページ: 1161-3
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for transcription regulation by alarmone ppGpp (2004)
  • 著者名/発表者名: Artsimovitch, I., Patlan, V., Sekine, S., Vassylyeva, M. N., Hosaka, T., Ochi, K., Yokoyama, S., Vassylyev, D. G.
  • 雑誌名: Cell 117(3) ページ: 299-310
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural and biochemical analyses of hemimethylated DNA binding by the SegA protein (2004)
  • 著者名/発表者名: Fujikawa, N., Kurumizaka, H., Nureki, O., Tanaka, Y., Yamazoe, M., Hiraga, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 32(1) ページ: 82-92
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of elongation factor P from Thermus thermophilus HB8 (2004)
  • 著者名/発表者名: Hanawa-Suetsugu, K., Sekine, S., Sakai, H., Hori-Takemoto, C., Terada, T., Unzai, S., Tame, J. R., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 101(26) ページ: 9595-9600
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] In vitro selection of RNA aptamers that bind to colicin E3 and structurally tesemble the decoding site of 16S ribosomal RNA (2004)
  • 著者名/発表者名: Hirao, I., Harada, Y., Nojima, T., Osawa, Y., Masaki, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Biochemistry 43(11) ページ: 3214-3221
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Solution structure of a BolA-like protein from Musmusculus (2004)
  • 著者名/発表者名: Kasai, T., Inoue, M., Koshiba, S., Yabuki, T., Aoki, M., Nunokawa, E., Seki, E., Matsuda, T., Matsuda, N., Tomo, Y., Shirouzu, M., Terada, T., Obayashi, N., Hamana, H., Shinya, N., Tatsuguchi, A., Yasuda, S., Yoshida, M., Hirota, H., Matsuo, Y., Tani, k., Suzuki, H., Arakawa, T., Carninci, P., Kawai, J., Hayashizaki, Y., Kigawa, T., Yokoyama, S
  • 雑誌名: Protein Sci 13(2) ページ: 545-548
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of a photo-crosslinking component into RNA by T7 transcription mediated by unnatural base pairs (2004)
  • 著者名/発表者名: Kimoto, M., Endo, M., Mitsui, T., Okuni, T., Hirao, I., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Chem Biol 11(1) ページ: 47-55
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for octameric ring formation and DNA interaction of the human homologous-pairing protein Dmcl (2004)
  • 著者名/発表者名: Kinebuchi, T., Kagawa, W., Enomoto, R., Tanaka, K., Miyagawa, K., Shibata, T., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Mol Cell 14(3) ページ: 363-374
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Solution structure of the SEA domain from the murine homologue of ovarian cancer antigen CA125(MUC16) (2004)
  • 著者名/発表者名: Maeda, T., Inoue, M., Koshiba, S., Yabuki, T., Aoki, M., Nunokawa, E., Seki, EMatsuda, T., Motoda, Y., Kobayashi, A., Hiroyasu, F., Shirouzu, M., Terada, T., Hayami, N., Ishizuka, Y., Shinya, N., Tatsuguchi, A., Yoshida, M., Hirota, H., Matsuo, Y., Tani, K., Arakawa, T., Carninci, P., Kawai, J., Hayashizaki, Y., Kigawa, T., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279(13) ページ: 13174-13182
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Regulation through the secondary channel-structural framework for ppGpp-DksA synergism during transcription (2004)
  • 著者名/発表者名: Perederina, A., Svetlov, V., Vassylyeva, M. N., Tahirov, T. H., Yokoyama, S., Artsimovitch, I., Vassylyev, D. G.
  • 雑誌名: Cell 118(3) ページ: 297-309
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Cell cycle-dependent phosphorylation, nuclear localization, and activation of human condensin (2004)
  • 著者名/発表者名: Takemoto, A., Kimura, K., Yokoyama, S., Hanaoka, F.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279(6) ページ: 4551-4559
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Structural basis for substrate selection by t7RNA polymerase (2004)
  • 著者名/発表者名: Temiakov, D., Patlan, V., Anikin, M., McAllister, W. T., Yokoyama, S., Vassylyev, D. G.
  • 雑誌名: Cell 116(3) ページ: 381-391
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Expression and purification of recombinant human histones (2004)
  • 著者名/発表者名: Tanaka, Y., Tawaramoto-Sasanuma, M., Kawaguchi, S., Ohta, T., Yoda, K., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Methods 33(1) ページ: 3-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Cloning, expression, purification, crystallization and initial crystallographic analysis of transcription factor DksA from Escherichia coli (2004)
  • 著者名/発表者名: Vassylyeva, M. N., Perederina, A. A., Svetlov, V., Yokoyama, S., Artsimovitch, I., Vassylyev, D. G.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60(Pt 9) ページ: 1611-1613
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structures of the CP1 domain from Thermus thermophilus isoleucyl-tRNA synthetase and its complex with L-valine (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Fukai, S., Ishitani, R., Nureki, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279(9) ページ: 8396-8402
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of leucy-tRNA synthetase from the archaeon Pyrococcus horikoshii (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60(Pt 10) ページ: 1900-1902
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic study of leucyl-tRNA synthetase from the archaceon Pyrococcus horikoshii (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 11(2) ページ: 149-156
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] A short peptide insertion crucial for angiostatic activity of human tryptophanyl-tRNA synthetase (2004)
  • 著者名/発表者名: Kise, Y., lee, S. E., park, S. G., Fukai, S., Sengoku, T., Ishii, R., Yokoyama, S., Kim, S., Nureki, O.
  • 雑誌名: Nat Struct Mol Biol 11(2) ページ: 149-156
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Deep knte of tRNA modification enzyme (2004)
  • 著者名/発表者名: Nureki, O., Watanabe, K, Fukai, S., Ishii, R, Endo, Y, Hori, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Structure 12(4) ページ: 593-602
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] tRNA recognition by glutamyl-tRNA reductase (2004)
  • 著者名/発表者名: Randau, L., Schauer, S., Ambrogelly, A., Salazar, J. C., Moser, J., Aekine, S., Yokoyama, S., Soll, D., Jahn, D.
  • 雑誌名: J Biol Chem 279(33) ページ: 34931-34937
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] The Escherichia coli argU10(Ts)phenotype is caused by a reduction in the cellular level of the argU tRNA for the rare codons AGA and AGG (2004)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, K., Ishimaru, S., Kobayashi, T., Walker, J. R., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Bacteriol 186(17) ページ: 5899-5905
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminaty X-ray analysis of the helicase domains of Vasa complexed with RNA and an ATP analogue (2004)
  • 著者名/発表者名: Sengoku, T., Nureki, O., Dohmae, N., nakamura, A., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 60(Pt 2) ページ: 320-322
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] tRNA recognition by glutamyl-tRNA reductase. (2004)
  • 著者名/発表者名: Randau L.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 279 ページ: 34931-34937
• [雑誌論文] The Escherichia coli argU10(Ts) phenotype is caused by a reduction in the cellular level of the argU tRNA for the rare codons AGA and AGG (2004)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto K.
  • 雑誌名: J.Bacterlol. 186 ページ: 5899-5905
• [雑誌論文] Structural basis for octameric ring and DNA Interaction of the human homologous-airing protein Dmc1 (2004)
  • 著者名/発表者名: Kinebuchi T.
  • 雑誌名: Mol.Cell 14 ページ: 363-374
• [雑誌論文] Expression and purification of recombinant human histones (2004)
  • 著者名/発表者名: Tanaka Y.
  • 雑誌名: Methods 33 ページ: 3-11
• [雑誌論文] Deep knot structure for construction of active site and cofactor binding site of tRNA modification enzyme (2004)
  • 著者名/発表者名: Nureki O.
  • 雑誌名: Structure 12 ページ: 593-602
• [雑誌論文] Site-specific incorporation of a photo-crosslinking component into RNA by T7 transcription mediated by unnatural base pairs (2004)
  • 著者名/発表者名: Kimoto M.
  • 雑誌名: Chem.Biol. 11 ページ: 47-55
• [雑誌論文] An open-and-shut case? Recent insights into the activation of EGF/ErbB receptor (2003)
  • 著者名/発表者名: Burgess, A.W.
  • 雑誌名: Mol Cell 12 ページ: 541-52
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the tRNA processing enzyme RNase PH from Aquifex aeolic us (2003)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278 ページ: 32397-404
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the Pyrococcus horikoshii DNA primase-UTP complex: implic ations for the mechanism of primer synthesis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ito, N.
  • 雑誌名: Genes Cells 8 ページ: 913-23
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of ribosomal protein L11 methyltransferase from Thermus thermophilus HB8 (2003)
  • 著者名/発表者名: Kaminishi, T.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 59 ページ: 930-2
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Divergent evolutions of trinucleotide polymerization revealed by an archaeal CCA-adding enzyme structure (2003)
  • 著者名/発表者名: Okabe, M.
  • 雑誌名: EMBO J 22 ページ: 5918-27
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of replication origin recognition by the DnaA protein (2003)
  • 著者名/発表者名: Fujikawa, N.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 31 ページ: 2077-8
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the 2'一5'RNA ligase from Thermus thermophilus HB8 (2003)
  • 著者名/発表者名: Kato, M.
  • 雑誌名: J Mol Biol 329 ページ: 903-11
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Activation of the pyrrolysine suppressor tRNA requires formation of a ternary complex with class I and class II lysyl-tRNA synthetases (2003)
  • 著者名/発表者名: Polycarpo, C.
  • 雑誌名: Mol Cell 12 ページ: 287-94
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Reconstitution of Src-dependent phospholipase Cgamma phosphorylation and transient calcium release by using membrane rafts and cell-free extracts from Xenopus eggs (2003)
  • 著者名/発表者名: Sato, K.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278 ページ: 38413-20
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Roles of 5-substituents of tRNA wobble uridines in the recognition of purine-ending codons (2003)
  • 著者名/発表者名: Takai, K.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 31 ページ: 6383-91
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of the human centromere protein B(CENP-B)dimerization dom ain at 1.65-A resolution (2003)
  • 著者名/発表者名: Tawaramoto, M. S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278 ページ: 51454-61
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of replication origin recognition by the DnaA protein (2003)
  • 著者名/発表者名: Fujikawa, N., Kurumizaka, H., Nureki, O., Terada, T., Shirouzu, M., Katayama, T., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Ees 31(8) ページ: 2077-2086
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the 2'-5' RNA ligase from Thermus thermopilus HB8 (2003)
  • 著者名/発表者名: Kato, M., Shirouzu, M., Terada, T., Yamaguchi, H., Murayama, K., Sakai, H., Kuramitsu, S., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Mol Biol 329(5) ページ: 903-911
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Activation of the pyrrolysine suppressor tRNA requires formation of a ternary complex with class I and class II lysyl-tRNA synthetases (2003)
  • 著者名/発表者名: Polycarpo, C., Ambrogelly, A., Ruan, B., Tumbula-Hansen, D., Ataide, S. F., Ishitani, R., Yokoyama, S., Nureki, O., Ibba, M., Soll, D.
  • 雑誌名: Mol Cell 12(2) ページ: 287-294
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Reconstitution of Src-dependent phospholipase Cgamma phosphorylation and transient calcium release by using membrane rafts and cell-free extracts from Xenpus eggs (2003)
  • 著者名/発表者名: Sato, K., Tokmakov, A. A., He, C. L., Kurokawa, M., Iwasaki, T., Shirouzu, M., Fissore, R. A., Yokoyama, S., Fukami, Y.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278(40) ページ: 38413-38420
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Roles of 5-substiutents of tRNA wobble uridines in the recognition of purine-ending codons (2003)
  • 著者名/発表者名: Takai, K., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res 31(22) ページ: 6383-6391
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the human centromere protein B(CENP-B) dimerization domain at 1.65-A resolution (2003)
  • 著者名/発表者名: Tawaramoto, M. S., Park, S. Y., Tanaka, Nureki, O., Kurumizaka, H., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278(51) ページ: 51454-51461
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] An open-and-shut case? Recent insights into the activation of EGF/ErbB receptors (2003)
  • 著者名/発表者名: Burgess, A. W., Cho, H. S., Eigenbrot, C., Ferguson, K. M., Garrett, T. P., Leahy, D. J., Lemmon, M. A., Sliwkowski, M. X., Ward, C. W., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Mol Cell 12(3) ページ: 541-542
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the tRNA processing enzyme RNase PH from Aquifex aeolicus (2003)
  • 著者名/発表者名: Ishii, R., Nureki, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: J Biol Chem 278(34) ページ: 32397-32404
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystal structure of the Pyrococcus horikoshii DNA primase-UTP complex : implications for the mechanism of primase-UTP complex : implications for the mechanism of primer synthesis (2003)
  • 著者名/発表者名: Ito, N., Nureki, O., Shirouzu, M., Yokoyama, S., Hanaoka, F.
  • 雑誌名: Genes Cell 8(12) ページ: 913-923
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Crystallization and preliminaty X-ray diffraction analysis of ribosomal protein L11 methyltransferase from Thermus thermophilus HB8 (2003)
  • 著者名/発表者名: Kaminishi, T., Sakai, H., Takemoto-Hori, C., Terada, T., Nakagawa, N., Maoka, N., Kuramitsu, S., Shirouzu, M., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 59(Pt 5) ページ: 930-932
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Divergent evolutions of trinucleotide polymerization revealed by an archaeal CCA-adding enzyme structure (2003)
  • 著者名/発表者名: Okabe, M., Tomita, K., Ishitani, R., Ishii, R., Takeuchi, N., Arisaka, F., Nureki, O., Yokoyama, S.
  • 雑誌名: EMBO J 22(21) ページ: 5981-5927
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [学会発表] Structural proteomics of transcription and translation proteins (2005)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.
  • 学会等名: 30th FEBS Congress and 9th IUBMB Conference
  • 発表場所: Budapest, Hungary
  • 年月日: 2005-07-02
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Structural basis for the noncognate amino acid editing by isoleucyl-tRNA syntehtase (2004)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.
  • 学会等名: 2004 International Conference on Aminoacyl-tRNA Synt hetases: Ancient Molecules for Future Biology and Medicine(ARS2004)
  • 発表場所: Seoul, SouthKorea
  • 年月日: 2004-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [学会発表] Structural basis for the non-cognate amino acid editing by isoleucyl-tRNA sntehtase (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga, R., Yokoyama, S.
  • 学会等名: 2004 International Conference on Aminoacyl-tRNA Synthetases : Ancient Molecules for Future Biology and Medicine (ARS2004)
  • 発表場所: Seoul, SouthKorea
  • 年月日: 2004-07-04
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [図書] The Aminoacyl-tRNA Synthetases: Chapter 7 & 8 (2005)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama, S.
  • 総ページ数: 14
  • 出版者: Landes Bioscience
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [備考] 「研究成果報告書概要(和文)」より
  • URL: http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/yokoyama-lab/
• [備考]
  • URL: http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/yokoyama-lab/
• [産業財産権] 変異体SepRS及びこれを用いるタンパク質への部位特異的ホスホセリン導入法 (2006)
  • 発明者名: 横山茂之福永流也関根俊一
  • 権利者名: 東京大学理化学研究所
  • 出願年月日: 2006-06-28
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] N.Ito: "Crystal structure of the Pyrococcus horikoshii DNA primase-UTP complex : implications for the mechanism of primer synthesis"Genes Cells. 8. 913-923 (2003)
• [文献書誌] T.Sengoku: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of the helicase domains of Vasa complexed with RNA and an ATP analogue"Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 60. 320-322 (2004)
• [文献書誌] Y.Kise: "A short peptide insertion crucial for angiostatic activity of human tryptophanyl-tRNA synthetase"Nat Struct Mol Biol.. 11. 149-156 (2004)
• [文献書誌] T.Kasai: "Solution structure of a BolA-like protein from Mus musculus"Protein Sci.. 13. 545-548 (2004)
• [文献書誌] N.Fujikawa: "Structural and biochemical analyses of hemimethylated DNA binding by the SeqA protein"Nucleic Acids Res.. 32. 82-92 (2004)
• [文献書誌] R.Fukunaga: "Crystal structures of the CP1 domain from Thermus thermophilus isoleucyl-tRNA synthetase and its complex with L-valine"J.Biol.Chem.. 279. 8396-8402 (2004)