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生体膜中で形成される生理活性天然物の会合体構造

研究課題

研究課題/領域番号 15201048
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物分子科学
研究機関大阪大学

研究代表者

村田 道雄  大阪大学, 理学研究科, 教授 (40183652)

研究分担者 大石 徹  大阪大学, 理学研究科, 助教授 (90241520)
松森 信明  大阪大学, 理学研究科, 助手 (50314357)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
39,910千円 (直接経費: 30,700千円、間接経費: 9,210千円)
2005年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2004年度: 10,790千円 (直接経費: 8,300千円、間接経費: 2,490千円)
2003年度: 24,310千円 (直接経費: 18,700千円、間接経費: 5,610千円)
キーワードアンフォテリシンB / 固体NMR / 抗生物質 / 自己組織化 / 分子会合体 / エルゴステロール / ポリエン抗生物質 / コレステロール
研究概要

本基盤研究において、色々のアンフォテリシンB(AmB)の同位体標識体と脂質などの連結分子を化学的に調製し、NMRを用いてイオンチャネル会合体の構造解析を行った。まず、AmBチャネルが、一分子の長さで生体膜を貫通していることを、リン脂質と部分的に炭素-13標識したAmBの固体NMRを測定し、リン-炭素間の距離を見積もることにより証明した。また、AmBのアミノ基とカルボキシル基をアルキルアミンによって分子内で架橋した誘導体を調製し、エルゴステロール選択性を調べた結果、AmBとエルゴステロールの脂質二重膜での位置関係を推定することができた。次に、AmBとステロールの相互作用を調べる目的で、生合成的に得た全炭素-13標識AmBとフッ素化したエルゴステロールと化学的に結合させた連結体を調製した。この試料を用いてフッ素と炭素-13の距離を固体NMRの測定(REDOR法)によって見積もった。これらの情報を解析することによって、脂質二重膜中でAmBのポリエン部分とエルゴステロールのB環が接近していることを明らかにした。さらにAmBに位置特異的にフッ素および炭層-13標識するために、AmBのオゾン分解物から得られるポリオール部分に化学合成したポリエン部分を融合する合成経路を開発することに成功した。これらの標識体を用いて二量体を調整することができれば、固体NMRによって正確な原子間距離測定が可能となるので正確なチャネル構造を解明できる。一方、渦鞭毛藻が生産するアンフィジノールはAmBと構造的にも作用の点でも共通性と相違点があるので、その特異な膜透過化機構を精査した。その結果、アンフィジノールは大きなチャネルを形成すること、ポリエン側鎖が脂質膜内部に貫入し、エーテル環部分で分子がヘアピン型に屈曲することを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2006 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (38件) 文献書誌 (6件)

  • [雑誌論文] 誘導体および同位体標識化合物を用いたアンフォテリシンBイオンチャンネル準造の解明2006

    • 著者名/発表者名
      松森信明, 大石 徹, 村田道雄
    • 雑誌名

      有機合成化学協会誌 (掲載予定)(印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Derivatization and isotope labeling of amphotericin B aiming at elucidation of the ion-channel structure2006

    • 著者名/発表者名
      Matsumori, N., Oishi, T., Murata, M.
    • 雑誌名

      Journal of Synthetic Organic Chemistry, Japan (In Press)

    • NAID

      10017486791

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dominant formation of a single-length channel by amphotericin B in dimyristoylphosphatidylcholline membrane evidenceb by ^<13>C-^<31>P rotational echo double resonance.2005

    • 著者名/発表者名
      松岡 茂
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 704-710

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Hairpin conformation of amphidinol possibly accounting for potent membrane permeabilizing activities.2005

    • 著者名/発表者名
      蓮台俊宏
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 2795-2802

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bioactive fluorinated derivative of amphotericin B.2005

    • 著者名/発表者名
      松森 信明
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 10667-10675

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bioactive fluorinated derivative of amphotericin B2005

    • 著者名/発表者名
      松森信明
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemesitry Letters. 15

      ページ: 3565-3567

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation and structure elucidation of a new amphidinol with a truncated polyhydroxyl chain from Amphidinium klebsii.2005

    • 著者名/発表者名
      Nagy Morsy
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 8606-8610

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dominant formation of a single-length channel by amphotericin B in dimyristoylphosphatidylcholline membrane evidenced by ^<13>C-^<31>P rotational echo double resonance.2005

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka, S., Ikeuchi, H., Matsumori, N., Murata, M.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 704-710

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Hairpin conformation of amphidinol possibly accounting for potent membrane permeabilizing activities.2005

    • 著者名/発表者名
      Houdai, T., Matsuoka, S., Morsy, N., Matsumori, N., Satake, M., Murata, M.
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 2795-2802

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Bioactive fluorinated derivative of amphotericin B.2005

    • 著者名/発表者名
      Matsumori, N., Umegawa, Y, Oishi, T., Murata, M.
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.Lett. 15

      ページ: 3565-3567

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mycosamine orientation of amphotericin B controlling interaction with ergosterol : sterol-dependent activity of conformation-restricted derivatives with an amino-carbonyl bridge.2005

    • 著者名/発表者名
      Matsumori, N., Sawada, Y., Murata, M.
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 10667-10675

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Isolation and structure elucidation of a new amphidinol with a truncated polyhydroxyl chain from Amphidinium klebsii.2005

    • 著者名/発表者名
      Morsy, N., Matsuoka, S., Houdai, T., Matsumori, N., Adachi, S., Murata, M., Iwashita, T., Fujita, T.
    • 雑誌名

      Tetrahedron. 61

      ページ: 8606-8610

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Dominant formation of a single-length channel by amphotericin B in dimyristoylphosphatidylcholline membrane evidenced by ^<15>C-^<31>P rotational echo double resonance.2005

    • 著者名/発表者名
      松岡 茂
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 704-710

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Hairpin conformation of amphidinol possibly accounting for patent membrane permeabilizing activities.2005

    • 著者名/発表者名
      蓬台俊宏
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 2795-2802

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Ladder-shaped polyether compound, desulfated yessotoxin, interacts with membrane-integral α-helix peptides.2005

    • 著者名/発表者名
      森 めぐみ
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem. 13

      ページ: 5099-5103

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Bioactive fluorinated derivative of amphotericin B.2005

    • 著者名/発表者名
      松森 信明
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.Lett. 15

      ページ: 3565-3567

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Mycosamine orientation of amphotericin B controlling interaction with ergosterol : sterol-dependent activity of conformation-restricted derivatives with an amino-carbonyl bridge.2005

    • 著者名/発表者名
      松森 信明
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 10667-10675

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Isolation and structure elucidation of a new amphidinol with a truncated polyhydroxyl chain from Amphidinium klebsii.2005

    • 著者名/発表者名
      Nagy Morsy
    • 雑誌名

      Tetrahedron. 61

      ページ: 8606-8610

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Dominant formation of a single-length channel by amphotericin B in dimyristoylphosphatidylcholline membrane evidenced by ^<13>C-^<31>Protational echo double resonance.2005

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka, S.
    • 雑誌名

      Biochemistry 44

      ページ: 704-710

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Hairpin conformation of amphidinol possibly accounting for potent membrane permeabilizing activities.2005

    • 著者名/発表者名
      Houdai, T.
    • 雑誌名

      Tetrahedron 61

      ページ: 2795-2802

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Amphotericin B covalent dimers bearing tertarate linkage2004

    • 著者名/発表者名
      松森信明
    • 雑誌名

      Chemistry and Biodiversity 1

      ページ: 346-352

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 「研究成果報告書概要(和文)」より2004

    • 著者名/発表者名
      松森信明
    • 雑誌名

      Chemistry and Biology 11

      ページ: 673-679

    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Membrane permeabilizing activities of amphidinol 3, polyene-polyhydroxy antifungal from marine dinoflagellate2004

    • 著者名/発表者名
      蓮台俊宏
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta 1667

      ページ: 91-100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Amphotericin B covalent dimers bearing tartrate linkage2004

    • 著者名/発表者名
      Matsumori, N., Masuda, R., Murata, M.
    • 雑誌名

      Chem.Biodiver. 1

      ページ: 346-352

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Amphotericin B-ergosterol covalent conjugate with powerful membrane permeabilizing activity.2004

    • 著者名/発表者名
      Matsumori, N., Eiraku, N., Matsuoka, S., Oishi, T., Murata, M., Aoki, T., Ide, T.
    • 雑誌名

      Chem.Biol. 11

      ページ: 673-679

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Membrane permeabilizing activities of amphidinol 3,polyene-polyhydroxy antifungal from marine dinoflagellate.2004

    • 著者名/発表者名
      Houdai, T., Matsuoka, S., Matsumori, N., Murata, M
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta. 1667

      ページ: 91-100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and identification of an endogenous sperm activating and attracting factor isolated from the ascidian Ciona Intestinals ; an example of nanomolar-level structure elucidation of novel natural compound2004

    • 著者名/発表者名
      Oishi, T.
    • 雑誌名

      Tetrahedron 60

      ページ: 6971-6980

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthesis and conformation of deuterated spermidine for investigating weak interaction with polyanionic biomolecules2004

    • 著者名/発表者名
      Maruyoshi, K.
    • 雑誌名

      Tetrahedron 60

      ページ: 5163-5170

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Intact glycation end products containing carboxylmethyl-lysine and glyoxal lysine dimerobtained from synthetic collagen model peptide2004

    • 著者名/発表者名
      Yamada, H.
    • 雑誌名

      Bloor.Med.Chem.Lett. 14

      ページ: 5677-5680

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Membrane permeabilizing activities of amphidinol 3, polyene-polyhydroxy antifungal from marine dinoflagellate2004

    • 著者名/発表者名
      Houdai, T.
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta. 1667

      ページ: 91-100

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Membrane permeabilizing activity of amphotericin B is affected by chain length of phosphatidylcholine added as minor constituent.2003

    • 著者名/発表者名
      松岡 茂
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta 1617

      ページ: 109-115

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Amphotericin of B-phospholipid covalent conjugates : dependence of membrane- permeabilizing activitiy on acyl-chain length.2003

    • 著者名/発表者名
      松岡 茂
    • 雑誌名

      Orgic and Biomolecular Chemistry 1

      ページ: 3882-3884

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 生物現象鍵物質の微量構造決定2003

    • 著者名/発表者名
      村田道雄
    • 雑誌名

      化学と生物 41

      ページ: 114-117

    • NAID

      10012133104

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] NMRの技術進歩と海洋天然物2003

    • 著者名/発表者名
      村田道雄
    • 雑誌名

      先端化学シリーズ 5

      ページ: 50-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Membrane permeabilizing activity of amphotericin B is affected by chain length of phosphatidylcholine added as minor constituent.2003

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka, S., Murata, M.
    • 雑誌名

      Biochim.Biophys.Acta 1617

      ページ: 109-115

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Amphotericin B-phospholipid covalent conjugates : dependence of membrane- permeabilizing activitiy on acyl-chain length.2003

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka, S., Matsumori, N., Murata, M.
    • 雑誌名

      Org.Biomol.Chem. 1

      ページ: 3882-3884

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure determination of bioactive key compounds with a small sample amount2003

    • 著者名/発表者名
      Murata, M.
    • 雑誌名

      Kagaku to Seibutsu 41

      ページ: 114-117

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Technical advances in NMR and marine natural products2003

    • 著者名/発表者名
      Murata, M.
    • 雑誌名

      Frontier Chemistry Series 5

      ページ: 5-54

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 大石 徹: "Synthesis of endogenous sperm-activating and attracting factor isolated from ascidian Ciona intestinalis"Tetrahedron Lett.. 44. 6387-6389 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 泉川 美穂: "Coning of modular type I polyketide synthase genes from Salinomycin producing strain of Streptomyces albus"Bioorg.Med.Chem.. 11. 3401-3405 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 松岡 茂: "Membrane permeabilizing activity of amphotericin B is affected by chain length of phosphatidylcholine added as minor constituent"Biophys.Biochim.Acta.. 1617. 109-115 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 松岡 茂: "Amphotericin B-phospholipid covalent conjugates : dependence of membrane- permeabilizing activity on acyl-chain length"Org.Biomol.Chem.. 1. 3882-3884 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 松森 信明: "Amphotericin B covalent dimers bearing tertrate linkage"Chem.Biodiver.. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 松森 信明: "Amphotericin B-ergosterol conjugate exceeding its cholesterol homologue in membrane permeabilizing activity"Chem.Biol.. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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