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病態のDNAメチル化解析

研究課題

研究課題/領域番号 15208027
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 基礎獣医学・基礎畜産学
研究機関東京大学

研究代表者

塩田 邦郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80196352)

研究分担者 土井 邦雄  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (70155612)
中山 裕之  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (40155891)
高橋 伸一郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (00197146)
田中 智  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (90242164)
上塚 浩司  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助手 (60251419)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
51,480千円 (直接経費: 39,600千円、間接経費: 11,880千円)
2005年度: 18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円)
2004年度: 20,280千円 (直接経費: 15,600千円、間接経費: 4,680千円)
2003年度: 13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
キーワードDNAメチル化 / エピジェネティクス / 脂肪細胞分化 / ES細胞 / ジメチルスルホキシド / DNAメチル基転移酵素 / エピジェネティックス / Dnmt / 肝臓 / 脂肪細胞 / パイロシークエンス法
研究概要

DNAメチル化はエピジェネティクス系の主要な要因である。組織・細胞特異的にメチル化状態の異なる領域(T-DMR)が哺乳類のゲノムDNAに多く存在し、それらのメチル化・非メチル化の組み合わせによる、細胞の種類に特有のDNAメチル化プロファイルが形成されている。本研究では特定の毒物などで誘導されるメチル化異常ゲノム領域を決定し、DNAメチル化プロファイル異常と病態との対応を目指した。in vitroモデル系の1つとして脂肪前駆細胞の分化前後でのメチル化変化を解析し、分化に伴いメチル化が変化するT-DMRを複数同定した。これらのメチル化状態変化には一過的な上昇あるいは減少といった変化パターンも示し、細胞の分化が従来考えられていたよりも遥かに柔軟であることが判明した。また、外来因子によって誘引される種々の病態に関する報告を重ねるとともに、ジメチルスルホキシド(DMSO)のDNAメチル化に対する影響を検討することで、マウス胚性幹細胞(ES細胞)の浮遊培養で形成される胚様体において、DMSOがゲノムDNAのメチル化異常を引き起こすことも明らかにした。DMSOはDNAメチル基転移酵素(Dnmt)の1つ、Dnmt3aの発現も特異的に促進した。Dnmt3aはがんの発生との関係も示唆されている。DMSOがエピジェネティック因子の発現にまで影響を与えることが明らかになったことで、化学物質の毒性評価などにおいて、エピジェネティクス異常の解析が必要であることが示された。さらに、過形成を示すクローンマウス胎盤で異常なメチル化を呈する遺伝子座の同定に成功し、DNAメチル化異常と病態との関連を示唆する1例を示すとともに、DNAメチル化パターンの維持にはDnmt3aおよびDnmt3bもまた必要であることや、Dnmt遺伝子もまたDNAメチル化による制御を受けていることをそれぞれ発見し報告した。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2006 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (33件) 文献書誌 (3件)

  • [雑誌論文] 哺乳類胚発生におけるエピジェネティクス変化2006

    • 著者名/発表者名
      田中 智, 他
    • 雑誌名

      実験医学 24

      ページ: 1146-1153

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] エピゲノムプロジェクトに向けて2006

    • 著者名/発表者名
      八木 慎太郎, 他
    • 雑誌名

      実験医学 24

      ページ: 1246-1254

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Applying whole-genomu studies of epigenetic regulation to study human disease.2006

    • 著者名/発表者名
      Lieb J.D., et al.
    • 雑誌名

      Cytogenetic and Genomu Research 114 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Epigenetics in differentiation and development. (in Japanese)2006

    • 著者名/発表者名
      Iwatani, M. et al.
    • 雑誌名

      Genome Medicine 5

      ページ: 25-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Epigenetic changes during mammalian embryogenesis. (in Japanese)2006

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, S. et al.
    • 雑誌名

      Experimental Medicine 24

      ページ: 1146-1153

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Toward epigenome project. (in Japanese)2006

    • 著者名/発表者名
      Yagi, S., Shiota, K.
    • 雑誌名

      Experimental Medicine 24

      ページ: 1246-1254

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Applying whole-genome studies of epigenetic regulation to study human disease.2006

    • 著者名/発表者名
      Lieb J.D.et al.
    • 雑誌名

      Cytogenetic and Genome Research 114(in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 哺乳類胚発生におけるエピジェネティック変化2006

    • 著者名/発表者名
      田中 智
    • 雑誌名

      実験医学 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] エピゲノムプロジェクトに向けて2006

    • 著者名/発表者名
      八木 慎太郎
    • 雑誌名

      実験医学 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Applying whole-genome studies of epigenetic regulation to study human disease.2006

    • 著者名/発表者名
      Lieb JD
    • 雑誌名

      Cytogenetic and Genome Research (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 概論-生命科学の新たなパラダイム : エピジェネティクス2005

    • 著者名/発表者名
      塩田 邦郎
    • 雑誌名

      実験医学 23

      ページ: 2096-2099

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DNAメチル化情報からみた哺乳類胚発生と細胞分化2005

    • 著者名/発表者名
      田中 智, 他
    • 雑誌名

      実験医学 23

      ページ: 2100-2106

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 発生・分化とエピジェネティクス2005

    • 著者名/発表者名
      岩谷 美沙, 他
    • 雑誌名

      ゲノム医学 5

      ページ: 25-30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Epigenetics, a new paradigm for life sciences. (in Japanese)2005

    • 著者名/発表者名
      Shiota, K.
    • 雑誌名

      Experimental Medicine 23

      ページ: 2096-2099

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] DNA methylation in mammalian embryogenesis and cell differentiation. (in Japanese)2005

    • 著者名/発表者名
      Tanaka, S., Shiota, K.
    • 雑誌名

      Experimental Medicine 23

      ページ: 2100-2106

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 概論-生命科学の新たなパラダイム:エピジェネティクス2005

    • 著者名/発表者名
      塩田 邦郎
    • 雑誌名

      実験医学 23

      ページ: 2096-2099

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] DNAメチル化情報からみた哺乳類胚発生と細胞分化2005

    • 著者名/発表者名
      田中 智
    • 雑誌名

      実験医学 23

      ページ: 2100-2106

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 発生・分化とエピジェネティクス2005

    • 著者名/発表者名
      岩谷 美沙
    • 雑誌名

      ゲノム医学 5

      ページ: 25-30

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] The Sall3 locus is an epigenetic hotspot of aberrant DNA methylation associated with placentomegaly of cloned mice.2004

    • 著者名/発表者名
      Ohgane, J, et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 253-260

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preference of DNA methyltransferases for CpG islands in mouse embryonic stem cells2004

    • 著者名/発表者名
      Hattori, N., et al.
    • 雑誌名

      Genome Research 14

      ページ: 1733-1740

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stage-by-stage change in DNA methylation status of Dnmt1 locus during mouse early development2004

    • 著者名/発表者名
      Ko, Y.-G., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 280

      ページ: 9627-9634

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Rat strain differences in the early stage of porcine-serum-induced hepatic fibrosis.2004

    • 著者名/発表者名
      Baba, Y., et al.
    • 雑誌名

      Experimental and Toxicologic Pathology 55

      ページ: 325-330

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The Sall3 locus is an epigenetic hotspot of aberrant DNA methylation associated with placentomegaly of cloned mice.2004

    • 著者名/発表者名
      Ohgane, J. et al.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 9

      ページ: 253-260

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preference of DNA methyltransferases for CpG islands in mouse embryonic stem cells.2004

    • 著者名/発表者名
      Hattori, N. et al.
    • 雑誌名

      Genome Research 14

      ページ: 1733-1740

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Stage-by-stage change in DNA methylation status of Dnmt1 locus during mouse early development.2004

    • 著者名/発表者名
      Ko, Y.-G.et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 280

      ページ: 9627-9634

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Rat strain differences in the early stage of porcine-serum- induced hepatic fibrosis.2004

    • 著者名/発表者名
      Baba, Y. et al.
    • 雑誌名

      Experimental and Toxicologic Pathology 55

      ページ: 325-330

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preference of DNA methyltransferases for CpG islands in mouse embryonic stem cells2004

    • 著者名/発表者名
      Hattori, N.et al.
    • 雑誌名

      Genome Research 14

      ページ: 1733-1740

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Stage-by-stage change in DNA methylation status of Dnmt1 locus during mouse early development2004

    • 著者名/発表者名
      Ko, Y.-G.et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 280

      ページ: 9627-9634

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Rat strain differences in the early stage of porcine-serum-induced hepatic fibrosis.2004

    • 著者名/発表者名
      Baba, Y.et al.
    • 雑誌名

      Exp.Toxic.Pathol. 55

      ページ: 325-330

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Effects of exogeneous growth hormone (GH)-treatment on carbon tetrachloride (CCl_4)-induced acute liver injury in GH-deficient Mini rats.2003

    • 著者名/発表者名
      Okada, T., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Toxicologic Pathology 16

      ページ: 49-57

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] T-2 toxin-induced morphological changes in pregnant rats.2003

    • 著者名/発表者名
      Sehata, S., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Toxicologic Pathology 16

      ページ: 59-65

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effects of exogeneous growth hormone (GH)-treatment on carbon tetrachloride (CCl_4)-induced acute liver injury in GH-deficient Mini rats.2003

    • 著者名/発表者名
      Okada, T. et al.
    • 雑誌名

      Journal of Toxicologic Pathology 16

      ページ: 49-57

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] T-2 toxin-induced morphological changes in pregnant rats.2003

    • 著者名/発表者名
      Sehata, S. et al.
    • 雑誌名

      Journal of Toxicologic Pathology 16

      ページ: 59-65

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Okada, T.et al.: "Effects of exogenous growth hormone (GH)-treatment on carbon tetrachloride (CCl4)-induced acute liver injury in GH-deficient Mini rats."J.Toxicol.Pathol.. 16. 49-57 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Sehata, S.et al.: "T-2 toxin-induced morphological changes in pregnant rats."J.Toxicol.Pathol.. 16. 59-65 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Ohgane, J.et al.: "The Sall3 locus is an epigenetic hotspot of aberrant DNA methylation associated with placentomegaly of cloned mice."Genes Cells. 9. 253-260 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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