| 研究課題/領域番号 |
15209040
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| 研究種目 |
基盤研究(A)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
外科学一般
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
門田 守人 大阪大学, 医学系研究科, 教授 (00127309)
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| 研究分担者 |
関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
藤原 義之 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (40314330)
山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184)
池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356)
中森 正二 大阪大学, 医学系研究科, 講師 (70294080)
矢野 正彦 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (70273646)
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| 研究期間 (年度) |
2003 – 2005
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| 研究課題ステータス |
完了 (2005年度)
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| 配分額 *注記 |
50,180千円 (直接経費: 38,600千円、間接経費: 11,580千円)
2005年度: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2004年度: 13,520千円 (直接経費: 10,400千円、間接経費: 3,120千円)
2003年度: 31,980千円 (直接経費: 24,600千円、間接経費: 7,380千円)
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| キーワード | 消化器癌 / DNAチップ / 遺伝子発現プロファイル / トランスレーショナルリサーチ / 遺伝子発現プロフィル / ヒト全遺伝子型DNAチップ / 遺伝子発現 / オリゴヌクレオチド / 大腸癌 / 肝転移予測 / 予後予測診断 |
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| 研究概要 |
本研究の目的はDNAチップ技術を応用し、従来の病理組織診断ではできなかった消化器癌に対する悪性度・予後予測診断システムを確立し、臨床へ実践的に応用することである。本研究は、臨床フィールドとして、参加施設の協力体制のもと数千例の癌症例のサンプリングと登録を行ない、統一された臨床病理学的データを整理すること、また基礎研究フィールドとして、共同研究契約を締結した実験施設と解析施設において、DNAチップなどを用いた網羅的な分子生物学的解析データの解析を行うことを2本柱とし、2006年4月現在、約4000例の消化器癌症例の登録を完了した。
具体的には、1)大阪大学と関連病院で切除された各癌腫の切除標本および臨床病理学的情報を収集し、標本、情報の整理・管理を行なうマルチセンターシステムを構築した。2)収集された各消化器癌切除標本からmRNAを抽出し厳密なquality checkをした後、target DNA(臨床検体)を調整し、ヒト全遺伝子型DNAチップを用いて、各種の消化器癌で数100から1000例のヒト全遺伝子発現データを取得した。3)大腸癌、胃癌、肝細胞癌、食道癌、膵癌など各疾患で癌の発育・進展に関連する遺伝子群の抽出し、新規腫瘍マーカーや治療標的を同定した。4)各疾患で転移・再発・予後や、化学療法、放射線療法などの治療応答性に関する特徴的な遺伝子発現パターンを認識し、遺伝子発現プロファイルの応用による予測診断システムを確立した。
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