| 研究課題/領域番号 |
15310135
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| 研究種目 |
基盤研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
基礎ゲノム科学
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| 研究機関 | 宮崎大学 (2004-2005)
宮崎大学(医学部) (2003) |
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研究代表者 |
剣持 直哉 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教授 (00133124)
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| 研究期間 (年度) |
2003 – 2005
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| 研究課題ステータス |
完了 (2005年度)
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| 配分額 *注記 |
15,600千円 (直接経費: 15,600千円)
2005年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2004年度: 4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2003年度: 6,400千円 (直接経費: 6,400千円)
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| キーワード | イントロン / 機能性RNA / リボソーム / リボソームタンパク質 / ゲノム / 進化 / snoRNA / RPG / リボソームタンパク |
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| 研究概要 |
1.RP遺伝子データベースRPG (http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp)を構築した。平成18年3月現在、本データベースは40種類の真核生物から集めた約4,000件のRP遺伝子に関する情報を搭載し、そのうち真核生物10種、古細菌4種、真正細菌4種の情報を公開している。
2.核小体低分子RNA (snoRNA)の情報を収集しデータベース化した。snoRNAは多くがRP遺伝子のイントロンにコードされており、イントロンの機能を解明する上で良いモデルとなる。現在、10種類の生物から集めた357個のsnoRNAに関するデータを公開している(snoOPY, http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/)。
3.生物進化の過程におけるイントロンの獲得あるいは欠失のパターンを解析するためのアルゴリズムを開発した。これを用いて7種類の真核生物684遺伝子から集めた10,044個のイントロンを解析した。その結果、進化の過程においてイントロンの獲得は欠失よりも高い頻度で起こっていることが明らかになった。
4.ミトコンドリアRP遺伝子の構造を解析し、細胞質のRP遺伝子と比較した。イントロン挿入部位を両者で比較することにより、現存するミトコンドリアRP遺伝子のイントロンは、真核生物になってから獲得されたものであることが明らかになった。
5.ゼブラフィッシュを用いてsnoRNAをノックダウンする系を開発した。スプライシング部位に設計したモルフォリノ修飾アンチセンスオリゴをゼブラフィッシュ受精卵に注入することにより、標的snoRNAを含むイントロンのスプライシングを阻害した。これにより、ゼブラフィッシュを用いた個体レベルでのsnoRNAの機能阻害に成功した。
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