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分子間Diels-Alderaseの構造・機能解明

研究課題

研究課題/領域番号 15370040
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

田中 勲  北海道大学, 大学院・理学研究科, 教授 (70093052)

研究分担者 姚 閔  北海道大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40311518)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
15,400千円 (直接経費: 15,400千円)
2004年度: 5,600千円 (直接経費: 5,600千円)
2003年度: 9,800千円 (直接経費: 9,800千円)
キーワードDiels-Alder反応 / natural Diels-Alderase / 酵素反応機構 / 多段階反応 / 二次代謝産物 / マクロフォミン酸合成酵素 / LUMOエネルギー / X線結晶構造 / 多段階触媒 / 基質複合体
研究概要

Diels-Alder反応はジエンおよびジエノフィルが上下から接近し,二重結合の電子軌道の重なりから協奏的にシクロヘキセン環を合成する付加反応である.本研究が行われるまでDiels-Alder反応を触媒する酵素の報告はなく,Diels-Alder反応触媒酵素が存在するかどうか,また,存在した場合にはどのようなメカニズムにより反応が進行するのかという命題に対して多分野からの興味が注がれていた.我々は平成15年度に報告したように,まずマクロフォミン酸合成酵素(MPS)の立体構造を解析した.立体構造情報から反応進行に重要だと考えられる残基に変異を施したミュータントを多種作製し,それぞれHPLCにより酵素活性を定量した.この結果,2-ピロンの2位カルボニル酸素および5位アシル酸素がそれぞれArg101グアニジル窒素,Tyr169フェノール酸素と水素結合を形成し,この水素結合がMPSの炭素・炭素結合反応において重要な働きをしていることがわかった.
Diels-Alder反応はジエンのHOMOとジエノフィルのとの相互作用で進行するが,一般にジエノフィルに導入された電子吸引基や,ジエノフィルの反応溶液中のLewis酸との相互作用,水素結合の形成はLUMOエネルギーを低下させ,Diels-Alder反応を加速することが知られている.天然に存在するDiels-Alderaseの場合では,触媒である蛋白質と基質2-ピロンとの水素結合が形成され,より反応性が加速されることが明らかになった.また,天然型Diels-AlderaseはDiels-Alder反応の直前の反応をも触媒し,Diels-Alder反応が最も起こりやすい活性化された基質を効率的な方位で活性部位にトラップし,自発的なDiels-Alder反応の進行を促進するという見解を得るに至った.

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (18件) 文献書誌 (4件)

  • [雑誌論文] Structure of macrophomate synthase2004

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D60

      ページ: 1187-1197

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 世界初Diels-Alderaseの構造に見る,合理的触媒戦略2004

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      生物物理 44

      ページ: 32-35

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 天然界のDiels-Alder反応-Diels-Alder reaction in nature-2004

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー 62

      ページ: 37-38

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure of macrophomate synthase2004

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D60(7)

      ページ: 1187-1197

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Insight into the Advantage of Natural Diels-Alderase2004

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Biophysics 44(1)

      ページ: 32-35

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Diets-Alder reaction in nature2004

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Bioscience & Industry (Japan Bioindustry Association) 62(1)

      ページ: 37-38

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structure of macrophomate synthase2004

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Acta Cryst. D60・7

      ページ: 1187-1197

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 世界初Diels-Alderaseの構造に見る,合理的触媒戦略2004

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      生物物理 44・1

      ページ: 32-35

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 天然界のDiels-Alder反応 -Diels-Alder reaction in nature-2004

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー 62・1

      ページ: 37-38

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Insight into a natural Diels-Alder reaction from the structure of macrophomate synthase2003

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Nature 422

      ページ: 185-189

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 天然型ディールス・アルダラーゼの結晶解析2003

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 45

      ページ: 384-390

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 世界初のDiels-Alderase2003

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      Photon Factory News 21

      ページ: 22-27

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Insight into a natural Diels-Alder reaction from the structure of macrophomate synthase2003

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Nature 422(6928)

      ページ: 185-189

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Structure Analysis of Natural Diels-Alderase2003

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Journal of the Crystallographic of Japan 45(6)

      ページ: 384-390

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] First Diels-Alderase2003

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Photon Factory News 21(2)

      ページ: 22-27

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Insight into a natural Diels-Alder reaction from the structure of macrophomate synthase2003

    • 著者名/発表者名
      Toyoyuki Ose
    • 雑誌名

      Nature 422・6928

      ページ: 185-189

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 天然型ディールス・アルダラーゼの結晶解析2003

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 45・6

      ページ: 384-390

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 世界初のDiels-Alderase2003

    • 著者名/発表者名
      尾瀬農之
    • 雑誌名

      Photon Factory News 21・2

      ページ: 22-27

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Toyoyuki Ose: "Insight into a natural Diels-Alder reaction from the structure of macrophomate synthase"Nature. 422・6928. 185-189 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 尾瀬農之: "天然型ディールス・アルダラーゼの結晶解析"日本結晶学会誌. 45・6. 384-390 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 尾瀬農之: "世界初Diels-Alderaseの構造に見る,合理的触媒戦略"生物物理. 44・1. 32-35 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 尾瀬農之: "天然界のDiels-Alder反応-Diels-Alder reaction in nature-"バイオサイエンスとインダストリー. 62・1. 37-38 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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