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ストレス応答センサーキナーゼの構造生物学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 15370046
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

箱嶋 敏雄  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (00164773)

研究分担者 北野 健  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助手 (40346309)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
15,400千円 (直接経費: 15,400千円)
2005年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2004年度: 3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2003年度: 8,700千円 (直接経費: 8,700千円)
キーワードストレス / タンパク質 / 分離 / 精製 / IRE / TRAF / IRF
研究概要

小胞体ストレスセンサータンパク質の一つであるIREの細胞内ドメインの構造研究を推進して、ストレス感知直後のシグナル伝達のメカニズムの構造的基盤を構築することを目的とした。IREはI型膜タンパク質であり、哺乳類細胞にはIREαとIREβがあるが、酵母はIre1pのみである。IRE1の細胞内ドメインはセリン・スレオニンタンパク質キナーゼドメインとRNaseドメインをもち、活性化時に、自己リン酸化とともにRNaseが活性化して、RNAの分解によるストレス応答シグナルを伝達する。このようなタンパク質キナーゼドメインを通してRNase活性を制御するという例は他の受容体にはなく、IRE1は全く新規なシグナル伝達の制御機構をもっている点に注目した。
ヒトIREαとIREβ及び酵母Ire1pの三者について大腸菌ならびに昆虫細胞を用いたタンパク質発現系の検討や精製系の最適化の結果、有望なものとして酵母由来のIre1pのタンパク質キナーゼドメインとRNaseドメインを含むコンストラクトで比較的良好なタンパク質発現を認めた。また、大量発現(2-3L)を試みて、このタンパク質が精製可能であること、比較的に不安定であることを確認した。この試料を用いて、研究室所有の結晶化ロボットにより大規模な結晶化スクリーニングを行った。その結果、再現性に若干問題はあるが、微結晶を得ることに成功した。また、ルーメン内のセンサードメインについても検討して、やはりIre1pのコンストラクトが良好であることがわかった。このドメインについてはドミナントアクティブ型のタンパク質も共同研究者によって得られており、センシングの機構を解明する上で、有力な構造を与える可能性があるので期待している。
以上の成果は、今後、このセンサーキナーゼの構造生物学的研究を推進する上での重要な一歩となった。今後、結晶化条件の精密化を行い、構造解析に耐えうる結晶として、三次元構造解析を完成させたい。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2006 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (27件) 図書 (3件) 文献書誌 (4件)

  • [雑誌論文] Molecular mechanism for the regulation of Rho-kinase by dimerization and its inhibition by fasudil.2006

    • 著者名/発表者名
      H.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Structure 14・3

      ページ: 589-600

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular mechanism for the regulation of Rho-kinase by dimerization and its inhibition by fasudil.2006

    • 著者名/発表者名
      Yamaguchi, H., Kasa, M., Amano, M., Kaibuchi, K., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Structure 14(3)

      ページ: 589-600

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular mechanism for the regulation of Rho-kinase by dimerization and its inhibition by fasudil.2006

    • 著者名/発表者名
      H.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Structure 14・3(in press)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Strucural basis for recruitment of human flap endonuclease 1 to PCNA.2005

    • 著者名/発表者名
      S.Sakurai
    • 雑誌名

      EMBO J. 24・4

      ページ: 683-693

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of the protein histidine phosphatase SixA in the multistep His-Asp phosphorelay.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Hamada
    • 雑誌名

      Genes to Cells 10・1

      ページ: 1-11

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of human Rad GTPase.2005

    • 著者名/発表者名
      A.Yanuar
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 61・11

      ページ: 978-980

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of decameric peroxiredoxin (AhpC) from Amphibacillus xylanus.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Kitano
    • 雑誌名

      Proteins 59・3

      ページ: 644-647

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of human Rad GTPase.2005

    • 著者名/発表者名
      Yanuar, A., Sakurai, S., Kitano, K., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr F61(11)

      ページ: 978-980

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of the protein histidine phosphatase SixA in the multistep His-Asp phosphorelay.2005

    • 著者名/発表者名
      Hamada, K., Kato, M., Shimizu, T., Ihara, K., Mizuno, T., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Genes to Cells 10(1)

      ページ: 1-11

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of recruitment of human flap endonuclease 1 to PCNA.2005

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S., Kitano, K., Yamaguchi, H., Hamada, K., Okada, K., Fukuda, K., Uchida, M., Ohtsuka, E., Morioka, H., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      EMBO J. 24(4)

      ページ: 683-693

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of decameric peroxiredoxin (AhpC) from Amphibacillus xylanus.2005

    • 著者名/発表者名
      Kitano, K., Kita, K., Hakoshima, T., Niimura, Y., Miki, K.
    • 雑誌名

      Proteins 59(3)

      ページ: 644-647

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of human Rad GTPase.2005

    • 著者名/発表者名
      A.Yanuar
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.F 61・11

      ページ: 978-980

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for recruitment of human flap endonuclease 1 to PCNA.2005

    • 著者名/発表者名
      S.Sakurai
    • 雑誌名

      EMBO J. 24・4

      ページ: 683-693

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis of biopterin-induced inhibition of GTP cyclohydrolase I by GFRP, its feedback regulatory proteins.2004

    • 著者名/発表者名
      N.Maita
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 279・49

      ページ: 51534-51540

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal structure of the inhibitory GTP Cyclohydrolase I and GFRP complex2004

    • 著者名/発表者名
      T.Hatakeyama
    • 雑誌名

      Pterins, Folates and Neurotransmitters in Molecular Medicine

      ページ: 16-19

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 核酸分子認識とその機能を中心とした構造生物学2004

    • 著者名/発表者名
      箱嶋 敏雄
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 46

      ページ: 201-208

    • NAID

      10013129619

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要 2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the inhibitory GTP Cyclohydrolase I and GFRP complex.2004

    • 著者名/発表者名
      Hatakeyama, T., Maita, N., Okada, K., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Pterins, Folates and Neurotransmitters in Molecular Medicine (SHS Gesellschaft fur klinische Ernahrung mbH)

      ページ: 16-19

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of biopterin-induced inhibition of GTP cyclohydrolase I by GFRP, its feedback regulatory protein.2004

    • 著者名/発表者名
      Maita, N., Okada, K., Hatakeyama, K., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279(49)

      ページ: 51534-51540

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural Biology of Nucleic-Acid Recognition and its Roles in Regulation of Protein Functions.2004

    • 著者名/発表者名
      Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Nihon kessyo Gakkaishi 46

      ページ: 201-208

    • NAID

      10013129619

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of biopterin-induced inhibition of GTP cyclohydrolase I by GFRP, its feedback regulatory proteins.2004

    • 著者名/発表者名
      N.Maita
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279・49

      ページ: 51534-51540

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Preparation and crystallization of human flap endonuclease FEN-1 in vomplex with proliferating-cell nuclear antigen, PCNA.2003

    • 著者名/発表者名
      S.Sakurai
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr.D D59・5

      ページ: 933-935

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of the Rho GTPase signaling.2003

    • 著者名/発表者名
      T.Hakoshima
    • 雑誌名

      J. Biochem. (Tokyo) 134・3

      ページ: 327-331

    • NAID

      10012057338

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Parallel coiled-coil association of the RhoA-binding domain in Rho-kinase.2003

    • 著者名/発表者名
      T.Shimizu
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 278・46

      ページ: 46046-46051

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Preparation and crystallization of human flap endonuclease FEN-1 in complex with proliferating-cell nuclear antigen, PCNA.2003

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S., Kitano, K., Okada, K., Hamada, K., Morioka, H., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. D59(5)

      ページ: 933-935

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Leucine zippers.2003

    • 著者名/発表者名
      Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Nature Encyclopedia of the Human Genome (Nature Pub.Group) Vol.3

      ページ: 679-683

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural basis of the Rho GTPase signaling.2003

    • 著者名/発表者名
      Hakoshima, T., Shimizu, T., Maesaki, R.
    • 雑誌名

      J.Biochem. (Tokyo) 134(3)

      ページ: 327-331

    • NAID

      10012057338

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Parallel coiled-coil association of the RhoA-binding domain in Rho-kinase.2003

    • 著者名/発表者名
      Shimizu, T., Ihara, K., Maesaki, R., Amano, M., Kaibuchi, K., Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 278(46)

      ページ: 46046-46051

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] タンパク質科学-構造・物性・機能2005

    • 著者名/発表者名
      清水 敏之
    • 総ページ数
      579
    • 出版者
      化学同人
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [図書] タンパク質科学-構造・物性・機能2005

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 総ページ数
      579
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [図書] Nature Encyclopedia of the Human Geneme, Vol.32003

    • 著者名/発表者名
      T.Hakoshima
    • 総ページ数
      1023
    • 出版者
      Nature Pub. Group
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakurai, S.: "Preparation and crystallization of human flap endonuclease FEN-1 in complex with proliferating-cell nuclear antigen, PCNA."Acta Crystallogr.D. D59・5. 933-935 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hakoshima, T.: "Structural basis of the Rho GTPase signaling."J.Biochem. (Tokyo). 134・3. 327-331 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Shimizu, T.: "Parallel coiled-coil association of the RhoA-binding domain in Rho-kinase."J.Biol.Chem.. 278・46. 46046-46051 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Hakoshima, T.: "Nature Encyclopedia of the Human Genome, Vol.3"Nature Pub. Group. 1023 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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