• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

エンドファイト窒素固定菌の核酸塩基配列からの直接探索

研究課題

研究課題/領域番号 15380047
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物栄養学・土壌学
研究機関東京大学

研究代表者

米山 忠克  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (70124360)

研究分担者 安藤 象太郎  (独)農業・生物系特定産業技術研究機構, 畜産草地研究所, 研究室長 (00370578)
大脇 良成  (独)農業・生物系特定産業技術研究機構, 畜産草地研究所, 主任研究官 (60355542)
藤原 徹  東京大学, 生物生産工学センター, 助教授 (80242163)
林 浩昭  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (60180973)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
15,400千円 (直接経費: 15,400千円)
2005年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
2004年度: 4,200千円 (直接経費: 4,200千円)
2003年度: 7,000千円 (直接経費: 7,000千円)
キーワード生物的窒素固定 / エンドファイト / サトウキビ / サツマイモ / パイナップル / 窒素固定 / nifH / PCR / 窒素固定菌
研究概要

品種、栽培した場所、サンプリングの部位(茎と葉)や時期を変えたサトウキビからDNAを抽出し、ニトロゲナーゼ(nifH)相同配列のPCR増幅を行い、塩基配列の相同性を検索した。その結果、DNA抽出の条件によらずBradyrhizobium属とKlebsiella属のnifH遺伝子と高い相同性を持つクローンが高い頻度で出現した。ポットで栽培したサトウキビの根と茎からBradyrhizobium属のnifH遺伝子と相同性の高い配列の存在を確認し、またそのnifH遺伝子の発現を検出した。これらのnifH遺伝子相同配列には多様性があり、Bradyrhizobium属がサトウキビに内生し、窒素固定を行っていることが示唆された。一方、圃場で栽培したサトウキビの茎からはClostridium属とKlebsiella属のnifH遺伝子と相同性の高い配列の発現を検出した。圃場で栽培したパイナップルの葉からはAzoarcus属とXanthobacter属のnifH遺伝子と相同性の高い配列の発現を検出した。
圃場で栽培したサツマイモの葉、葉柄、茎および塊根から抽出したDNAおよびRNAより、nested PCRによりnifH遺伝子断片を増幅し、塩基配列の相同性を検索した。サツマイモのDNAからは、Paenibacillus azotofixans, Herbaspirillum seropedicae、Anabaena 7120, Rhizobium leguminosarum等のnifH遺伝子と高い相同性を示す遺伝子断片が得られた。またサツマイモ体内では、Bradyrhizobium sp.やuncultured bacteriumのnifH遺伝子と高い相同性を示す遺伝子の発現が認められた。これらのことから、サツマイモ体内には複数の窒素固定細菌が感染し、窒素固定機能を発現しているものと推定された。
このように本研究によってサトウキビ、パイナップル、サツマイモの植物体内からnifH遺伝子の発現がはじめて確認された。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (22件) 文献書誌 (3件)

  • [雑誌論文] サツマイモ体内からのエンドファイトnifH遺伝子の検出2006

    • 著者名/発表者名
      大脇良成, 寺門純子, 山川博幹, 田中福代, 米山忠克, 藤原伸介
    • 雑誌名

      第47回 日本植物生理学会年会 講演要旨集

      ページ: 253-253

    • NAID

      130006987294

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of endophytic nifH sequence in sweet potato2006

    • 著者名/発表者名
      Y.Ohwaki, J.Terakado, H.Yamakawa, F.Tanaka, T.Yoneyama, S.Fujihara
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol. 47 suppl., s171

    • NAID

      130006987294

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of nifH sequences in sugarcane (saccharum officinarum L.) and pineapple (Ananas comosus [L.] Merr).2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, M.Goto, S.Meuchang, P.Thongaar, T.Fujiwara, H.Hayashi, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 51・2

      ページ: 303-308

    • NAID

      110004704746

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Contamination of diverse nifH-like DNA into commercial PCR primers.2005

    • 著者名/発表者名
      M.Goto, S.Ando, Y.Hachisuka, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      FEBS Microbiology Letters 246・1

      ページ: 33-38

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] エンドファイテイック窒素固定 第三タイプの植物-微生物窒素固定システム2005

    • 著者名/発表者名
      安藤象太郎, 大脇良成, 後藤匡裕, 米山忠克
    • 雑誌名

      化学と生物 43・12

      ページ: 788-794

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 実績報告書 2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] PCR試薬中へのnifH様断片の混入2005

    • 著者名/発表者名
      後藤匡裕, 蜂須賀祐介, 安藤象太郎, 米山忠克
    • 雑誌名

      植物微生物研究会 第15回研究交流会 講演要旨集

      ページ: 82-83

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of nifH sequences in sugarcane (saccharum officinarum L.) and pineapple (Ananas comosus [L.] Merr.2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, M.Goto, S.Meuchang, P.Thongaar, T.Fujiwara, H.Hayashi, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 51 (2)

      ページ: 303-308

    • NAID

      110004704746

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Contamination of diverse nifH-like DNA into commercial PCR primers.2005

    • 著者名/発表者名
      M.Goto, S.Ando, Y.Hachisuka, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      FEBS Microbiology Letters 246 (1)

      ページ: 33-38

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Endophytic nitrogen fixation : The third type of plant-microbe nitrogen-fixing system2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, R.Owaki, M.Goto, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Kagaku to Seibutsu 43 (12)

      ページ: 788-794

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Contamination of nif-like DNA in PCR reagent2005

    • 著者名/発表者名
      M.Goto, Y.Hachisuka, S.Ando, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Abstracts of the 15th annual meeting of Japanese Society of Plant Microbe Interac.

      ページ: 82-83

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Detection of nifH sequences in sugarcane (saccharum officinarum L.) and pineapple (Ananas comosus [L.] Merr.2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, M.Goto, S.Meuchang, P.Thongaar, T.Fujiwara, H.Hayashi, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition 51・2

      ページ: 303-308

    • NAID

      110004704746

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] サツマイモ体内からのnifH遺伝子の検出.2005

    • 著者名/発表者名
      寺門純子, 大脇良成, 山川博幹, 田中福代, 米山忠克, 藤原伸介
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学会 講演要旨集 51

      ページ: 49-49

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] PCR試薬中へのnifH様断片の混入2005

    • 著者名/発表者名
      後藤匡裕, 蜂須賀祐介, 安藤象太郎, 米山忠克
    • 雑誌名

      植物微生物研究会 第15回研究交流会 講演要旨集 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] サツマイモ体内からのエンドファイトnifH遺伝子の検出.2005

    • 著者名/発表者名
      大脇良成, 寺門純子, 山川博幹, 田中福代, 米山忠克, 藤原伸介
    • 雑誌名

      第47回日本植物生理学会年会 講演要旨集 (印刷中)

    • NAID

      130006987294

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Detection of nifH sequences in sugarcane (Saccharum officinarum L.) and pineapple (Ananas comosus [L.] Merr.)2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, M.Goto S.Meunchang, P.Thongraar, T.Fujiwara, H.Hayashi, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Soil Science and Plant Nutrition (印刷中)

    • NAID

      110004704746

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Contamination of diverse nifH-like DNA into commercial PCR primers2005

    • 著者名/発表者名
      M.Goto, S.Ando, Y.Hachisuka, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] サトウキビからのnifH相同配列の検出2005

    • 著者名/発表者名
      安藤象太郎, 寺下優, 後藤匡裕, 蜂須賀佑介, 林浩昭, 米山忠克
    • 雑誌名

      植物微生物研究会 第14回研究交流会 講演要旨集 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] サツマイモから検出されたエンドファイトnifH遺伝子の多様性2005

    • 著者名/発表者名
      大脇良成, 山川博幹, 田中福代, 寺門純子, 米山忠克, 藤原伸介
    • 雑誌名

      植物微生物研究会 第14回研究交流会 講演要旨集 (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Role of nitrogen fixation for sustainable sugarcane production.2004

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, S.Meunchang, S.Thippayarugs, P.Prasertsak, N.Matsumoto, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Proceedings of the International Symposium on Sustaiabe Sugarcane and Sugar Production Technology.

      ページ: 156-159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Role of nitrogen fixation for sustainable sugarcane production.2004

    • 著者名/発表者名
      S.Ando, S.Meunchang, S.Thippayarugs, P.Prasertsak., N.Matsumoto, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Proceedings of the International Symposium on Sustainable Sugarcane and Sugar Production Technology.

      ページ: 156-159

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Role of nitrogen fixation for sustainable sugarcane production2004

    • 著者名/発表者名
      A.Shotaro, S.Meunchang, S.Thippayarugs, P.Prasertsak, N.Matsumoto, T.Yoneyama
    • 雑誌名

      Proceedings of the International Symposium on Sustainable Sugarcane and Sugar Production Technology

      ページ: 156-159

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] サトウキビにおける植物内生菌による窒素固定2004

    • 著者名/発表者名
      安藤象太郎
    • 雑誌名

      農業技術 59・5

      ページ: 208-212

    • NAID

      40006180998

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] 後藤匡裕, 安藤象太郎, 林浩昭, 藤原徹, 米山忠克: "PCRを用いたサトウキビ茎からの植物内生窒素固定微生物の検出"植物微生物研究会 第13回研究交流会 講演要旨集. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 大脇良成, 高畑康紀, 米山忠克, 藤原伸介: "重窒素自然存在比法および重窒素同位体希釈法を用いたエンドファイトによるサツマイモの窒素固定量の推定"植物微生物研究会 第13回研究交流会 講演要旨集. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 安藤象太郎: "サトウキビにおける植物内生菌による窒素固定"農業技術. (印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

URL: 

公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi