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新プロテアーゼファミリーの発見に基づく致死性遺伝病に関わるCLN2の生化学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 15380072
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

小田 耕平  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 教授 (50081584)

研究分担者 尾山 廣  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助教授 (50221700)
平賀 和三  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助手 (50252549)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
12,700千円 (直接経費: 12,700千円)
2004年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
2003年度: 9,900千円 (直接経費: 9,900千円)
キーワード致死性遺伝病 / セリン-カルボキシルプロテアーゼ / CLN2 / 新プロテアーゼファミリー / セドリシン
研究概要

申請者は、ズブチリシン類似の基本骨格を持ち、触媒残基がSer-Glu-Aspのcatalytic triadで構成される新規プロテアーゼファミリー、serine-carboxyl peptidase(S53)を発見した。本研究では、この内、脳変性疾患、バッテン病の発症に関与するCLN2に焦点をあて、その構造と機能を明確にすることを目的とした。
1.CLN2に保存されたSer280残基とGlu77残基の機能解析
Ser280残基のAla改変体は、酵素活性が完全に消失した。CLN2は、触媒Ser残基を修飾し、阻害活性を発現するIso-Val-Ile-Ala-Phe-Hで酵素活性が消失した。また、Glu77残基のAla改変体は、酵素活性が野生型酵素の1/10^4と著しく低下した。以上より、CLN2の触媒残基は、Ser280-Glu77-Asp81のcatalytic triadであることを生化学的に実証した。
2.CLN2のサブサイト構造解析
CLN2のサブサイトは、細菌由来酵素(S5〜S3')に比べて短く、S3〜S3'で構成されていること、また、P2位に電荷を持つアミノ酸を受容できる点やP3位にかさの小さなアミノ酸を好むことなどの特徴を明らかにした。これらの結果は、CLN2の分子モデルとも一致した。
3.CLN2の立体構造予測
Kumamolisinの立体構造を基にCLN2の分子モデルを構築した。その結果、CLN2がtripeptidyl peptiase活性、即ち、基質のアミノ末端側から3アミノ酸残基を順次切断する根拠を得ることに成功した。
4.CLN2の立体構造解析
野生型のCLN2(成熟型)をカイコ・バキュロウイルス系で多量生産し、精製酵素を得た。現在、共同研究者であるWlodawer教授(米国・国立ガン研究所・副所長)のもとで、合成阻害剤との複合体を調製し、結晶化を試みている。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (20件) 文献書誌 (6件)

  • [雑誌論文] Two inhibitor molecules bound in the active site of Pseudomonas sedolisin : a model for the bi-product complex following cleavage of a peptide substrate.2004

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 314

      ページ: 638-645

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The molecular structure and catalytic mechanism of a novel carboxyl peptidase from Scytalidium lignicolum.2004

    • 著者名/発表者名
      Fujinaga M
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci. USA 101

      ページ: 3364-3369

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallographic and biochemical investigations of kumamolisin-As, a serine-carboxyl peptidase with collagenase activity.2004

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 21500-21510

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 1.2 Å crystal structure of the serine carboxyl proteinase pro-kumamolisin ; structure of an intact pro-subtilase.2004

    • 著者名/発表者名
      Comellas-Bigler M
    • 雑誌名

      Structure (Camb) 12

      ページ: 1313-1323

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 新規プロテアーゼファミリー、セドリシンの発見2004

    • 著者名/発表者名
      小田 耕平
    • 雑誌名

      化学と工業 78

      ページ: 174-181

    • NAID

      40006158512

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Two inhibitor molecules bound in the active site of Pseudomonas sedolisin : a model for the biproduct complex following cleavage of a peptide substrate.2004

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A., et al.
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 314

      ページ: 638-645

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The molecular structure and catalytic mechanism of a novel carboxyl peptidase from Scytalidium lignicolum.2004

    • 著者名/発表者名
      Fujinaga M., et al.
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101

      ページ: 3364-3369

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystallographic and biochemical investigations of kumamolisin-As, a serine-carboxyl peptidase with collagenase activity.2004

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A., et al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 21500-21510

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 1.2 Å crystal structure of the serine carboxyl proteinase pro-kumamolisin ; structure of an intact pro-subtilase.2004

    • 著者名/発表者名
      Comellas-Bigler M., et al.
    • 雑誌名

      Structure (Camb) 12

      ページ: 1313-1323

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A novel family of proteinases, sedolisin. (in Japanese)2004

    • 著者名/発表者名
      Oda, K.
    • 雑誌名

      Kagaku to Kogyo 78

      ページ: 174-181

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] The molecular structure and catalytic mechanism of a novel carboxyl peptidase from Scytalidium lignicolum.2004

    • 著者名/発表者名
      Fujinaga M
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101

      ページ: 3364-3369

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 1.2 Åclystal structure of the serine carboxyl proteinase pro-kumamolisin ; structure of an intact pro-subtilase.2004

    • 著者名/発表者名
      Comellas-Bigler M
    • 雑誌名

      Structure(Camb) 12

      ページ: 1313-1323

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural and enzymatic properties of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases.2003

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A
    • 雑誌名

      Acta Biochim Pol. 50

      ページ: 81-102

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Collagenolytic serine-carboxyl proteinase from Alicyclobacillus sendaiensis strain NTAP-1 : purification, characterization, gene cloning, and heterologous expression.2003

    • 著者名/発表者名
      Tsuruoka N
    • 雑誌名

      Appl.Environ.Microbiol. 69

      ページ: 162-169

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A model of tripeptidyl-peptidase I (CLN2), a ubiquitous and highly conserved member of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases.2003

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol. 3

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 新規プロテアーゼファミリー・sedolisinの構造と機能2003

    • 著者名/発表者名
      小田 耕平
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとバイオインダストリー 61

      ページ: 11-16

    • NAID

      10011624165

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Collagenolytic serine-carboxyl proteinase from Alicyclobacillus sendaiensis strain NTAP-1 : purification, characterization, gene cloning, and heterologous expression.2003

    • 著者名/発表者名
      Tsuruoka N., et al.
    • 雑誌名

      Appl.Environ.Microbiol. 69

      ページ: 162-169

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structural and enzymatic properties of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases.2003

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A., et al.
    • 雑誌名

      Acta Biochemica Polonica 50

      ページ: 81-102

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] A model of tripeptidyl-peptidase I (CLN2), a ubiquitous and highly conserved member of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases.2003

    • 著者名/発表者名
      Wlodawer A., et al.
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol. 3(1)

      ページ: 8-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structures and functions of a novel proteinase family, sedolisin. (in Japanese)2003

    • 著者名/発表者名
      Oda, K., et al.
    • 雑誌名

      Bioscience and Bioindustry 61

      ページ: 11-16

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tsuruoka, N: "Collagenolytic serine-carboxyl proteinase from Alicyclobacillus sendaiensis strain NTAP-1 : purification, characterization, gene cloning, and heterologous expression"Appl.Environ.Microbiol.. 69・1. 162-169 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Wlodawer, A.: "Structural and enzymatic properties of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases"Acta Biochim.Pol.. 50・1. 81-102 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Wlodawer, A.: "A model of tripeptidyl-peptidase I (CLN2), a ubiquitous and highly conserved member of the sedolisin family of serine-carboxyl peptidases"BMC Struct.Biol.. 3・1. 8 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 小田 耕平: "新規プロテアーゼファミリーsedolisinの構造と機能"バイオサイエンスとインダストリー. 61・8. 11-16 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Wlodawer, A.: "Two inhibitor molecules bound in the active site of Pseudomonas sedolisin : a model for the bi-product complex following cleavage of a peptide substrate"Biochem.Biophys Res.Commun.. 314・2. 638-645 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] 小田 耕平: "新規プロテアーゼファミリー、セドリシンの発見"科学と工業. 78・4. 1-7 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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