8q23領域にマップされた家族性てんかん原因遺伝子のクローニング

• 研究課題/領域番号: 15390276
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 神経内科学
• 研究機関: 慶應義塾大学
• 研究代表者: 浅川 修一 慶應義塾大学, 医学部, 助手 (30231872)
• 研究期間 (年度): 2003 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 9,300千円 (直接経費: 9,300千円); 2004年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円); 2003年度: 6,100千円 (直接経費: 6,100千円)
• キーワード: 8番染色体 / てんかん / BAFME / CSMD3 / ポジショナルクローニング / 非翻訳RNA / 8q23 / 単一遺伝子疾患 / 単一遺伝子病 / ゲノム解析 / 良性家族性てんかん / FAME / ミオクローヌス / 常染色体

研究概要

BAFMEは8q23.3-q24.1領域にマップされている。我々はヒト8番染色体q22-qter領域約52Mbの網羅的解析を推進した.これらの解析の結果,BAFME領域中には我々が新規遺伝子として発見したCSMD3など、少なくとも46個のタンパク質コード遺伝子(FOG2,OXR1,STARS, ANGPT1,MGC35555,INT6,KIAA0103,FLJ30668,TRHR, CML66,DC 6,PKHDK1,EBAG9,FLJ20366,KCNV1,CSMD3,TRPS1,EIF3SC, MGC14595,RAD21,AARD, SLC3OA8,THRAP6,EXT1,SAMDL2,TNFRSF1 IB, COLECLO, MAL2,NOV, ENPP2,TAF2,MGC5528,DEPDC6,COL14A1,MRPL13,MTBP, SNTB1,HAS2,ZHX2,DER1,MGC21654,BJ-TSA-9,FL114825,ZHX1,ATAD2,FBXO32)が存在することが分かった.そこで3家系のBAFME家系に対して各コーディングエキソン配列,5'側の非翻訳エキソン,300-500bp程度のプロモータ領域をPCR増幅,塩基配列決定することにより変異検索を行った.またBAFME領域中に見出した5個の非翻訳RNA遺伝子(AK025035,AK025288,BC034804,Keio_929,Keio_930)についても変異検索を行った.さらに1家系について定量PCR法によってそれぞれの遺伝子の各エキソンの欠失や増幅の検索を行った。このように本研究では研究計画で予定していた膨大な変異検索を全て遂行したが,原因遺伝子は未だ同定できていない.以上の結果からBAFMEの変異は遺伝子のイントロン部分や遺伝子間のスペーサー部分、あるいは同領域中の未同定遺伝子に存在する可能性が高い。

研究成果

• [雑誌論文] COH1 analysis and linkage study in two Japanese families with Cohen syndrome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kondo I, Shimizu A, Asakawa S, Miyamoto K, Yamagata H, Tabara Y, Shimizu N.
  • 雑誌名: Glin.Genet. 67 ページ: 270-272
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Molecular cloning and characterization of gene for Golgi-localized syntaphilin-related protein on human chromosome 8q23. (2005)
  • 著者名/発表者名: Funakoshi E, Nakagawa KY, Hamano A, Hori T, Shimizu A, Asakawa S, Shimizu N, Ito F.
  • 雑誌名: Gene. 344 ページ: 259-271
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] COH1 analysis and linkage study in two Japanese families with Cohen syndrome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kondo I, Shimizu A, Asakawa S, Miyamoto K, Yamagata H, Tabara Y, Shimizu N.
  • 雑誌名: Clin.Genet. 67 ページ: 270-272
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] COH1 analysis and linkage study in two Japanese families with Cohen syndrome. (2005)
  • 著者名/発表者名: Kondo I, Shimizu A, Asakawa S, Miyamoto K, Yamagata H, Tabara Y, Shimizu N.
  • 雑誌名: Clin Genet. 67 ページ: 270-272
• [雑誌論文] Finishing the euchromatic sequence of the human genome. (2004)
  • 著者名/発表者名: International Human Genome Sequencing Consortium.
  • 雑誌名: Nature. 431 ページ: 931-945
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Finishing the euchromatic sequence of the human genome. (2004)
  • 著者名/発表者名: International Human Genome Sequencing Consortium
  • 雑誌名: Nature 431 ページ: 931-945
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Finishing the euchromatic sequence of the human genome. (2004)
  • 著者名/発表者名: International Human Genome Sequencing Consortium
  • 雑誌名: Nature. 431 ページ: 931-945
• [雑誌論文] A novel giant gene CSMD3 encoding a protein with CUB and sushi multiple domains : a candidate gene for benign adult familial myoclonic epilepsy on human chromosome 8q23.3-q24.1. (2003)
  • 著者名/発表者名: Shimizu A, Asakawa S, Sasaki T, Yamazaki S, Yamagata H, Kudoh J, Minoshima S, Kondo I, Shimizu N.
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 309 ページ: 143-154
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] A novel giant gene CSMD3 encoding a protein with CUB and sushi multiple domains: a candidate gene for benign adult familial myoclonic epilepsy on human chromosome 8q23.3-q24.1. (2003)
  • 著者名/発表者名: Shimizu A, Asakawa S, Sasaki T, Yamazaki S, Yamagata H, Kudoh J, Minoshima S, Kondo I, Shimizu N
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun. 309 ページ: 143-154
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [文献書誌] Shimizu A, Asakawa S, Sasaki T, Yamazaki S, Yamagata H, Kudoh J, Minoshima S, Kondo I, Shimizu N.: "A novel giant gene CSMD3 encoding a protein with CUB and sushi multiple domains : a candidate gene for benign adult familial myoclonic epilepsy on human chromosome 8q23.3-q24.1."Biochem Biophys Res Commun.. 309. 143-154 (2003)