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鉄硫黄クラスターの生合成機構:二種のクラスター形成マシナリーの分子構築と反応機序

研究課題

研究課題/領域番号 15510174
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物分子科学
研究機関大阪大学

研究代表者

高橋 康弘  大阪大学, 理学研究科, 講師 (10154874)

研究分担者 福山 恵一  大阪大学, 理学研究科, 教授 (80032283)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2004年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
2003年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワード鉄硫黄クラスター / 鉄硫黄タンパク質 / 生合成 / ISCマシナリー / SUFマシナリー / X線結晶構造解析 / 構造と機能 / 分子間相互作用
研究概要

我々は近年、Fc-Sクラスター(Fe-S蛋白質のコファクター)の形成に必須な二種の独立した大腸菌マシナリー(ISCとSUF)を明らかにした。残る重要課題は構造と機能、反応機構の解明である。マシナリーの個々の成分がどのような役割を演じているのか?また、複数の成分がどのように調和してマシナリーとしての機能を発揮するのか?二種類の合成系の存在意義と合わせて、分子レベルで詳しく理解する必要がある。本基盤研究では、以下の成果を得た。
1.大腸菌のISCとSUF、好熱菌Aquifex aeolicusのISC、好熱性古細菌Sulfolobus tokodaiiのSUFマシナリーの構成成分について、各々単独、または複合体として発現させ、大腸菌変異株の相補実験と並行して、精製と機能解析を進めた。SufB+SufC+SufDが複合体を形成することを見出し、さらにサブユニットの入れ替えを含むダイナミックな構造変換を行うことを明らかにした。またSufDについては、構造情報(下記)に基づいて種々の変異を導入し、機能的に重要な部位を同定した。一方、AquifexのIscUが意外にもFe-Sクラスター中間体を結合した状態で精製できることを見出し、変異を導入することによってさらに中間体の安定化を達成した。
2.上記精製タンパク質(複合体)の結晶化を試み、大腸菌のYfhJ(IscX)に続いて、SufA, SufC, SufDの構造決定に成功した。SufAの二量体では4残基のシステインが近接する機能部位の実体、SufCではATPase活性と構造変換を共役させ得るドメイン間の塩橋、SufDではβ-helix二量体という重要な構造を、次々に明らかにすることができた。一方、SulfolobusのSufC+SufD複合体についても良質の結晶を得ることができた。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (16件)

すべて 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (13件) 文献書誌 (3件)

  • [雑誌論文] Crystal Structure of Escherichia coli YfhJ, Protein, a Member of the ISC Machinery Involved in Assembly of Iron-Sulfur Clusters2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimitsu Shimomura
    • 雑誌名

      PROTEINS Structure, Function, and Bioinformatics 印刷中

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Escherichia coli YfhJ, Protein, a Member of the ISC Machinery Involved in Assembly of Iron-Sulfur Clusters2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimitsu Shimomura
    • 雑誌名

      PROTEINS Structure, Function, and Bioinformatics (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Escherichia coli YfhJ, Protein, a Member of the ISC Machinery Involved in Assembly of Iron-Sulfur Clusters2005

    • 著者名/発表者名
      Yoshimitsu Shimomura
    • 雑誌名

      PROTEINS Structure, Function, and Bioinformatics (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] An Intestinal Parasitic Protist Entamoeba histolytica Possesses a Non-redundant NIF-like System for Iron-Sulfur Ouster Assembly under Anaerobic Conditions2004

    • 著者名/発表者名
      Vahab Ali
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279

      ページ: 16863-16874

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Interchangeability and Distinct Properties of Bacterial Fe-S Cluster Assembly Systems : Functional Replacement of the isc and suf Operons in Escherichia coli with the nifSU-like Operon from Helicobacter pylori2004

    • 著者名/発表者名
      Umechiyo Tokumoto
    • 雑誌名

      J.Biochem. 262

      ページ: 199-209

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Intestinal Parasitic Protist Entamoeba histolytica Possesses a Non-redundant NIF-like System for Iron-Sulfur Cluster Assembly under Anaerobic Conditions.2004

    • 著者名/発表者名
      Vahab Ali
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279-16

      ページ: 16863-16874

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Interchangeability and Distinct Properties of Bacterial Fe-S Cluster Assembly Systems : Functional Replacement of the isc and suf Operons in Escherichia coli with the nifSU-like Operon from Helicobacter pylori.2004

    • 著者名/発表者名
      Umechiyo Tokumoto
    • 雑誌名

      J.Biochem. 262-2

      ページ: 199-209

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] An Intestinal Parasitic Protist Entamoeba histolytica Possesses a Non-redundant NIF-like System for Iron-Sulfur Cluster Assembly under Anaerobic Conditions2004

    • 著者名/発表者名
      Vahab Ali
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 279・16

      ページ: 16863-16874

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Interchangeability and Distinct Properties of Bacterial Fe-S Cluster Assembly Systems : Functional Replacement of the isc and suf Operons in Escherichia coli with the nifSU-like Operon from Helicobacter pylori2004

    • 著者名/発表者名
      Umechiyo Tokumoto
    • 雑誌名

      J.Biochem. 262・2

      ページ: 199-209

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Effect of iron-sulfur cluster assembly proteins on the expression of Escherichia coli lipoic acid synthase2003

    • 著者名/発表者名
      Marco Kriek
    • 雑誌名

      Protein Expr.Purif. 28

      ページ: 241-245

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of cluster N5 as a fast-relaxing [4Fe-4S] cluster in the Nqo3 subunit of the proton-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Paracoccus denitrificans2003

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Yano
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 278

      ページ: 15514-15522

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Effect of iron-sulfur cluster assembly proteins on the expression of Escherichia coli lipoic acid synthase.2003

    • 著者名/発表者名
      Marco Kriek
    • 雑誌名

      Protein Expr.Purif. 28-2

      ページ: 241-245

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Characterization of cluster NS as a fast-relaxing [4Fe-4S] cluster in the Ngo3 subunit of the proton-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Paracoccus denitrificans.2003

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Yano
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 278-18

      ページ: 15514-15522

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Marco Kriek: "Effect of iron-sulfur cluster assembly proteins on the expression of Escherichia coli lipoic acid synthase"Protein Expr.Purif.. 28・2. 241-245 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Takahiro Yano: "Characterization of cluster N5 as a fast-relaxing [4Fe4S] cluster in the Nqo3 subunit of the proton-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Paracoccus denitrificans"J.Biol.Chem.. 278・18. 15514-15522 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Vahab Ali: "An Intestinal Parasitic Protist Entamoeba histolytica Possesses a Non-redundant NIF-like System for Iron-Sulfur Cluster Assembly under Anaerobic Conditions"J.Biol.Chem.. (in press). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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