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複数の確率的要因を含む集団遺伝学モデルの確率過程論的研究

研究課題

研究課題/領域番号 15540134
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 数学一般(含確率論・統計数学)
研究機関九州歯科大学

研究代表者

飯塚 勝  九州歯科大学, 歯学部, 助教授 (20202830)

研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
2005年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2004年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2003年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
キーワード確率過程 / 1次元一般化拡散過程 / 条件付き漸近分布 / 集団遺伝学 / 有効個体数 / 環境変動 / 分子進化 / 互助的進化 / 一般化拡散過程 / 条件付漸近分布 / 個体数変動 / 互助的中立突然変異 / 確率過程論 / 拡散モデル / 遺伝子系図学 / 条件付拡散過程
研究概要

集団遺伝学に現れる以下の確率モデルに対する確率過程論的研究を行った。
(1)集団遺伝学で提唱されている条件付き漸近分布の概念を、1次元一般化拡散過程に拡張し、その性質に関する極限定理を得た。これらの結果をBessel過程と出生死滅過程に適用した。また、本研究の端緒となった集団遺伝学モデルについては、これらの結果を用いて、複数個の確率的要因(ランダム・ドリフトと環境変動に伴う確率的自然淘汰)を含む拡散モデルにおける条件付き漸近分布の性質を考察した。
(2)個体数の確率的変動を伴う遺伝子系図学モデルと、個体数の確率的変動を伴うWright-Fisherモデル(突然変異が存在する場合)を定式化した。これらのモデルに対して、集団の有効個体数と呼ばれる特性量を定義し、その性質を明らかにした。さらに、これらの有効個体数と個体数の確率的変動を伴う拡散モデル(突然変異が存在する場合)とWright-Fisherモデル(突然変異が存在しない場合)に対して定義されている有効個体数の計4つの有効個体数の関係を明らかにした。その結果、突然変異が存在する場合の拡散モデルとWright-Fisherモデルの有効個体数は、突然変異率を無限小とした極限で、遺伝子系図学モデルの有効個体数に収束することが分かった。
(3)2つの遺伝子座において互助的相互作用が自然淘汰に働く集団遺伝学の確率モデルに関して、広範なパラメータ(自然淘汰の強度、突然変異率、組み換え率)の値に対してコンピュータ・シミュレーションを行い、二重突然変異体の集団への固定待ち時間(ある境界点への初到達時間)の分布、平均、分散を考察した。さらに、このモデルの拡散近似(離散時間マルコフ連鎖の拡散過程による近似)を導き、固定待ち時間の平均が従う偏微分方程式を得た。この偏微分方程式を解析的に解くことは困難なので、突然変異率と組み換え率が自然淘汰の強度に比べて十分小さいときに、この3次元拡散モデルをさらに近似する1次元拡散モデルを導出した。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2006 2004 その他

すべて 雑誌論文 (5件) 文献書誌 (1件)

  • [雑誌論文] Asymptotic conditional distributions related to one-dimensional generalized diffusion processes2006

    • 著者名/発表者名
      Masaru Iizuka, Miyuki, Maeno, Matsuyo Tomisaki
    • 雑誌名

      Tsukuba Journal of Mathematics Vol. 30(掲載決定)

    • NAID

      120005366085

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Asymptotic conditional distributions related to one-dimensional generalized diffusion processes.2006

    • 著者名/発表者名
      Ezuka, M, Maeno, 1..and Tomisaki, M.
    • 雑誌名

      to appear in Tsukuba Journal of Mathematics 30

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Asymptotic conditional distributions related to one-dimensional generalized diffusion processes2006

    • 著者名/発表者名
      Masaru Iizuka, Miyuki Maeno, Matsuyo Tomisaki
    • 雑誌名

      Tsukuba Journal of Mathematics Vol.30(掲載決定)

    • NAID

      120005366085

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Coalescent process with fluctuating population size and its effective size2004

    • 著者名/発表者名
      Akinori Sano, Akinobu Shimizu, Masaru Iizuka
    • 雑誌名

      Theoretical Population Biology Vol. 65

      ページ: 39-48

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Coalescent process with fluctuating population size and its effective size.2004

    • 著者名/発表者名
      Sano, A., Shimizu, A., Iizuka, M.
    • 雑誌名

      Theoretical Population Biology 65

      ページ: 39-48

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akinori Sano: "Coalescent process with fluctuating population size and its effective size"Theoretical Population Biology. 65. 39-48 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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