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立体異性化ヌクレオチドを含む特異な交叉型三重鎖形成核酸の機能化と遺伝子発現の制御

研究課題

研究課題/領域番号 15550144
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生体関連化学
研究機関群馬大学

研究代表者

篠塚 和夫  群馬大学, 工学部, 教授 (20206105)

研究分担者 森口 朋尚  群馬大学, 工学部, 助教授 (70334133)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2003年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードキメラDNA / インターカレーター / 交差型三重鎖 / 非ヌクレオシド性プラットホーム / ジアステレオマー / ピリミジンギャップ / 金属配位子 / 機能性キメラDNA / ビスヒロドキシプロピオン酸 / 交叉型三重鎖 / 亜リン酸化 / コンジュゲート / 熱安定性 / アントラキノン / 融解温度 / 交叉型三重
研究概要

これまで実施計画に従って研究を実施するとともに、以下のような成果を得ることができた。
先ず、インターヌクレオチド結合中のリン原子に、適当なアルキルリンカーを介してインターカレーターを結合したジヌクレオチド誘導体を構築し、生成するジアステレオマーを分離した後別々にキメラDNA中に導入したところ、一方の異性体のみが交差型三重鎖の安定性を向上すること、この効果は三重鎖形成時に特有であり、対応する二重鎖形成時には発現しないことを見出した(論文発表済み)。
次ぎに、通常三重鎖形成の標的となるポリピュリン鎖中に一ヶ所ピリミジン塩基が出現する、いわゆるピリミジンギャップを含む標的に対しても三重鎖形成を行うことのできる新たな三重鎖形成核酸の創製を目指し、非ヌクレオシド性プラットホームであるビスヒドロキシプロピオン酸とインターカレーター結合させたコンジュゲートを合成した。このコンジュゲートを導入した三重鎖形成核酸は、ピリミジンギャップを有するポリピュリン鎖に結合し、安定な三重鎖を形成できることを見いだした(論文発表済み)。三重鎖形成能の向上に関し、核酸塩基部の修飾についても検討を行った。その結果キメラDNAのリンカー鎖中のピリミジン塩基C-4位にインターカレ一夕ーを導入することで、交差型三重鎖の安定性を大きく向上できることを見いだした(論文発表済み)。同様に、ビスヒドロキシプロピオン酸とインターカレーター結合させたコンジュゲートを上記リンカー鎖中に導入した場合、得られる修飾キメラDNAは標的二重鎖とほぼ生理的条件下でも安定な三重鎖を形成出来るだけでなく、不斉炭素を持つビスヒドロキシプロピオン酸を導入することで生成するジアステレオマーの何れもが、ほぼ等しい三重鎖安定化効果を示すという、非常に意外な結果を得ることができた。これによって、ここで企図しているキメラDNAの修飾法は、立体化学に依存することなく初期の効果をもたらしうる、非常に用途の広い修飾法であることが示された(論文発表済み)。
金属配位子とインターカレーターからなる新規コンジュゲートとビスヒドロキシプロピオン酸とを結合させた三元系新分子を構築し、これを導入した新たな機能性キメラDNAの合成についても実施した。
これらの研究で得られた修飾キメラDNAを用いた、遺伝子機能の制御に関する実験を行った。

報告書

(4件)
  • 2005 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2006 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (16件) 文献書誌 (2件)

  • [雑誌論文] Modified α-β chimeric oligoDNA bearing a multi-conjugate of 2, 2-bis (hydroxymethyl)propionic acid/anthraquinone/polyamine exhibited improved and stereo-nonspecific triplex-forming ability.2006

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      ページ: 335-337

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Modified α-β chimeric oligoDNA bearing a multi-conjugate of 2,2-bis(hydroxymethyl)propionic acid/anthraquinone/polyamine exhibited improved and stereononspecific triplex-forming ability.2006

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      ページ: 335-337

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Modified α-β chimeric oligoDNA bearing a multi-conjugate of 2,2-bis(hydroxymethyl)propionic acid/anthraquinone/polyamine exhibited improved and stereo-nonspecific triplex-forming ability2006

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      ページ: 335-337

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triple helix forming ability of novel anthraquinone modified α-β chimeric DNA2005

    • 著者名/発表者名
      T.Moriguchi, A.T.M.Z.Azam, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. Sym. Ser., 49

      ページ: 7-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triple helix forming ability of novel anthraquinone modified α-β chimeric DNA.2005

    • 著者名/発表者名
      T.Moriguchi, A.T.M.Z.Azam, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.Sym.Ser. 49

      ページ: 7-8

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triple helix forming ability of novel anthraquinone modified α-β chimeric DNA2005

    • 著者名/発表者名
      T.Moriguchi, A.T.M.Z.Azam, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.Sym.Ser. 49

      ページ: 7-8

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Novel anthraquinone conjugate of 2,2-bis(hydroxymethyl)propionic acid incorporated to a TFO with phosphotriester linkage facilitates triplex formation with dsDNA. bearing a Pyrimidine-gapped polypurine sequence.2004

    • 著者名/発表者名
      M.Sato, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 14

      ページ: 1305-1308

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] α-β chimeric oligoDNA bearing intercalator-conjugated nucleoside inside the linker sequence remarkably improves thermal stability of an alternate-stranded triple helix.2004

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 14

      ページ: 5747-5750

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triplex forming ability of novel α-β chimeric oligonucleotides bearing an intercalator-conjugated nucleobase.2004

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. Sym. Ser., 48

      ページ: 207-208

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel anthraquinone conjugate of 2,2-bis(hydroxymethyl)propionic acid incorporated to a TFO with phosphotriester linkage facilitates triplex formation with dsDNA bearing a Pyrimidine-gapped polypurine sequence.2004

    • 著者名/発表者名
      M.Sato, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 14

      ページ: 1305-1308

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] α-β chimeric oligcDNA bearing intercalator-conjugated nucleoside inside the linker sequence remarkably inproves thermal stability of an alternate-stranded triple helix.2004

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 14

      ページ: 5747-5750

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triplex forming ability of novel α-β chimeric oligonucleotides bearing an intercalator-conjugated nucleobase.2004

    • 著者名/発表者名
      A.T.M.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.Sym.Ser. 48

      ページ: 207-208

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] α-βChimeric oligo-DNA bearing intercalator-conjugated nucleobase inside the linker sequence remarkably improves thermal stability of an alternate-stranded triple helix2004

    • 著者名/発表者名
      ATM.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.Lett. 14

      ページ: 5747-5750

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthesis and alternate-stranded triplex forming ability of novel α-βchimeric oligonucleotides bearing an intercalator-conjugated nucleobase2004

    • 著者名/発表者名
      ATM.Z.Azam, M.Hasegawa, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.Sym.Ser. 48

      ページ: 207-208

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Novel dinucleoside phosphotriester unit conjugated with an intercalator moiety in a Stereospecific manner enhances thermal stability of an alternate-stranded triple helix.2003

    • 著者名/発表者名
      T.Miyashita, N.Matsumoto, T.Moriguchi, K..Shinozuka
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters 44

      ページ: 7399-7402

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Novel dinucleoside phosphotriester unit conjugated with an intercalator moiety in a Stereospecific manner enhances thermal stability of an alternate-stranded triple helix.2003

    • 著者名/発表者名
      T.Miyashita, N.Matsumoto, T.Moriguchi, K.Shinozuka
    • 雑誌名

      Tetrahedron Letters 44

      ページ: 7399-7402

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2005 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Miyashita, N.Matsumoto, T.Moriguchi, K.Shinozuka: "Novel Dinucleotide Phosphotriester Unit Conjugated with an Intercalative Moiety in a Stereospecific Manner enhances Thermal Stability of an Alternate-Stranded Triple Helix."Tetrahedron Letters. 44. 7399-7402 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] M.Sato, T.Moriguchi, K.Shinozuka: "Novel Anthraquinone Conjugate of 2,2-Bis(hydroxymethyl)-propionic Acid Incorporated to a TFO with Phosphodiester Linkage Facilitates Triplex Formation with dsDNA Bearing a Pyrimidine-Gapped Polypurine Sequence."Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. 14・5. 1305-1308 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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