| 研究課題/領域番号 |
15570199
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
人類学
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| 研究機関 | 独立行政法人理化学研究所 |
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研究代表者 |
深海 薫 独立行政法人理化学研究所, 情報解析技術室, 室長(副主任研究員待遇) (20225494)
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| 研究分担者 |
猪子 英俊 学校法人東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
舘野 義男 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構, 国立遺伝学研究所・生命情報・DDBJ研究センター, 教授 (00202424)
岩瀬 秀 独立行政法人理化学研究所, 情報解析技術室, 研究員 (10391872)
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| 研究期間 (年度) |
2003 – 2004
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| 研究課題ステータス |
完了 (2004年度)
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| 配分額 *注記 |
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2004年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2003年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
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| キーワード | 霊長類 / MHC / MIC / ゲノム / 免疫学 / 分子進化 / チンパンジー / アカゲザル |
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| 研究概要 |
当研究はアカゲザルを対象として、これらの遺伝子を含むゲノム領域の塩基配列を決定し、今まで私たちが配列決定したヒト、チンパンジーのデータと合わせ免疫、分子進化、ゲノム生物の視点から総合的に解析し、これらの遺伝子群の誕生年代とそれらを含んだゲノム領域の進化の動態を明らかにすることを目標に行われた。
まずアカゲザルのMHCクラスIならびにMIC(MHC Class I Chain Related)遺伝子群を含むゲノム領域の塩基配列の決定が行われた。次に決定されたアカゲザルのゲノム塩基配列のデータを用いて、MHC、MIC遺伝子群の各遺伝子のエクソンや蛋白質コード領域の位置の同定、LINEの探索が行われた。
こうして得られたデータを、ヒト、チンパンジーのデータと合わせて進化の動態をさらに解析した。その結果、配列決定を行った領域に見られる2つのゲノム断片重複、すなわちHLA-BとHLA-C遺伝子の重複とMICAとMICB遺伝子の重複が起こった年代を、この領域に存在するLINE配列を比較することにより推定する事が出来た。これに関しては以前ゴリラのデータを用いて推定を試みたが、ヒトとゴリラの分岐年代が600-800万年前とかなり大きな幅を持ってしか推定されていないこと、該当領域に存在するLINE配列のデータが得られなかったことにより、推定が大きな幅をもった値にならざるを得なかったものである。
本研究で得られた以上の成果は、論文の形にまとめて学術雑誌(Proceedings of the National Academy of Science of the USA)に投稿し、先日受理された。
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