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ネギ属野菜の高密度染色体地図の作成

研究課題

研究課題/領域番号 15580025
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 園芸学・造園学
研究機関佐賀大学

研究代表者

田代 洋丞  佐賀大学, 農学部, 教授 (20039340)

研究分担者 執行 正義  山口大学, 農学部, 助教授 (40314827)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2004年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2003年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワードAllium cepa / タマネギ / シャロット / 連鎖地図 / AFLP / ネギ単一異種染色体添加系統 / SSR / 農業形質 / OTL / ネギ属野菜 / 染色体地図 / マイクロサテライト
研究概要

タマネギ(在来品種‘早玉')、シャロット半数体倍加系統(タイ産系統‘チェンマイ'由来)と両者のF_1個体を供試して96通りのプライマー組合せについてAFLP分析を行なったところ、64組合せでそれぞれの両親に特異的でF_1へ遺伝するAFLPマーカーが得られた。次に,両親に特異的なマーカーの遺伝分離をF2世代38個体において調査し、そのデータを基に連鎖地図作成ソフト「JoinMap Ver.3.0」によりAFLP地図を作成した。タマネギでは56個のマーカーから成る11の連鎖群が形成された。それぞれの連鎖群は7,14,4,5,3,2,2,8,5,4および2個のマーカーから成り,長さはそれぞれ,27.5,36.0,10.3,14.8,13.6,2.9,10.6,26.7,18.8,16.0および3.0cMであった。また,シャロットでは30個のマーカーから成る八つの連鎖群が形成され,各連鎖群は5,5,5,4,3,4,2および2個のマーカーからなり,長さはそれぞれ19.1,10.6,16.3,13.2,7.5,27.6、19.9および3.0cMであった。さらに、F_2世代において種々の農業形質(ほう芽日,抽だい日,分げつ数,葯色および球皮色)に関する調査を行ったところ,いずれの形質においても連続的な変異がみられた。
一方で,8種類のシャロット染色体(1A-8A)をそれぞれもつネギ単一異種染色体添加系統シリーズを用いてシャロット染色体特異的AFLPマーカーの開発を試みた。18通りのプライマー組合せを用いてネギとシャロットの間で増幅ピークの有無を比較したところ,615本がシャロットに特有なピークであった.これらのピークの有無を添加系統シリーズについて調べたところ,単一染色体特異的にみられたピークは,第1染色体(1A)が19本,2Aが26本,3Aが27本,4Aが15本,5Aが19本,6Aが12本,7Aが12本および8Aが8本であった。同様の分析を30種類のタマネギSSRプラーマーを用いて行なったところ,合計24個の染色体特異的SSRマーカーが得られ,そのうちの幾つかが連鎖地図にも挿入された。最終的に,タマネギ第12連鎖群は第1染色体に,また,シャロット第1連鎖群は第3染色体にそれぞれ対応していることが判明した。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2004 2003 2002

すべて 雑誌論文 (9件)

  • [雑誌論文] Chromosomal locations of microsatellite markers in Allium cepa L.2004

    • 著者名/発表者名
      N.Araki, N.Yamane, T.Wako, T.Ohara, A.Kojima, M.Shigyo
    • 雑誌名

      4TH INTERNATIONAL ISHS SYMPOSIUM ON EDIBLE ALLIACEAE, ABSTRACTS

      ページ: 111-111

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chromosomal locations of microsatellite markers in Allium cepa L2004

    • 著者名/発表者名
      N.Araki, N.Yamane, T.Wako, T.Ohara, A.Kojima, M.Shigyo
    • 雑誌名

      4th International ISHS Symposium on Edible Alliaceae, Abstracts

      ページ: 111-111

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chromosomal locations of microsatellite markers in Allium cepa L.2004

    • 著者名/発表者名
      N.Araki, N.Yamane, T.Wako, T.Ohara, A.Kojima, M.Shigyo
    • 雑誌名

      4TH INTERNATIONAL ISHS SYMPOSIUM ON EDIBLE ALLIACEAE 1.1

      ページ: 111-111

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] シャロットにおける蛍光AFLPマーカーの座乗染色体について2003

    • 著者名/発表者名
      荒木直幸, 執行正義, 田代洋丞, 若生忠幸, 小原隆由, 小島昭夫
    • 雑誌名

      園芸学会雑誌 72巻(別1)

      ページ: 152-152

    • NAID

      10024385611

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] タマネギ及びシャロット(Allium cepa L.)の高密度染色体地図(第1報)AFLPマーカーの開発2003

    • 著者名/発表者名
      辻修平, 前原佳世子, エンダン S., 執行正義, 一色司郎, 田代洋丞
    • 雑誌名

      園芸学会雑誌 72巻(別2)

      ページ: 524-524

    • NAID

      10019589973

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chromosomal locations of fluorescent AFLP markers in shallot2003

    • 著者名/発表者名
      N.Araki, M.Shigyo, Y.Tashiro, T.Wako, T.Ohara, A.Kojima
    • 雑誌名

      Journal of Japanese Society for Horticultural Science Vol.72(Suppl.1)

      ページ: 152-152

    • NAID

      10024385611

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] High density chromosome map of onion and shallot (Allium cepa L.) 1.Development of AFLP markers2003

    • 著者名/発表者名
      S.Tsuji, K.Maehara, S.Endang, M.Shigyo, S.Isshiki, Y.Tashiro
    • 雑誌名

      Journal of Japanese Society for Horticultural Science Vol.72(Suppl.2)

      ページ: 524-524

    • NAID

      10019589973

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Allium cepaにおけるマイクロサテライトマーカーの座乗染色体について2002

    • 著者名/発表者名
      荒木直幸, 山根直子, 若生忠幸, 小原隆由, 小島昭夫, 執行正義
    • 雑誌名

      園芸学会雑誌 71巻(別2)

      ページ: 486-486

    • NAID

      10019590581

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Chromosomal locations of microsatellite markers in Allium cepa2002

    • 著者名/発表者名
      N.Araki, N.Yamane, T.Wako, T.Ohara, A.Kojima, M.Shigyo
    • 雑誌名

      Journal of Japanese Society for Horticultural Science Vol.71(Suppl.2)

      ページ: 486-486

    • NAID

      10019590581

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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