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NMRの新手法の開発-立体化学研究に有用なスピン結合定数の測定法の開発とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 15580089
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物生産化学・生物有機化学
研究機関東京大学

研究代表者

降旗 一夫  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助手 (20219091)

研究分担者 田之倉 優  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (60136786)
大久保 明  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (20111479)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2004年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2003年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
キーワードHR-HMBC / BIRD-J-resolved HMBC / HR(High Resolution)-HMBC / HMBC / J-scaling
研究概要

本研究は、複雑な天然有機化合物の構造解析、主として立体構造の解析を行うためのプロトン-炭素間の遠隔スピン結合定数を観測する方法の開発を主目的にし、二つの新しい方法、HR-HMBC(15年度)とBIRD-J-resolved HMBC(16年度)を開発した。
有機化合物の立体化学の研究では、NMRによるプロトン-プロトンのスピン結合定数の解析が重要である。ポリケタイド抗生物質にはメチル基を含んだスピン系(-CH_A-CH_B(CH3)-CH_c^-)が多く存在する。このようなスピン系において、メチンプロトンH_Bは複雑に分裂し、ビシナルプロトンとのスピン結合定数を読みとることがしばしば困難であった。このような複雑に分裂したH_Bのプロトンにおいて、スピン結合を解析することが立体化学研究のうえで重要になる場合がある。このような複雑なスピン系でのプロトン-プロトンのスピン結合定数を観測する目的で新しくBIRD-J-resolved HMBC法を開発した。
既にlong range J_<CH>を観測する方法としてHR-HMBC法を開発した。この方法では、F_1軸方向において、通常の測定point数でプロトン-プロトンのスピン分裂が観測可能となるように見かけ上の分解能を高めることができる。このパルス系列にBIRDパルスを応用し、ビシナルプロトンをdecouplingし、HR-HMBCスペクトルを観測する方法を開発した(例えばスピン系(-CH_A-CH_B(CH3)-CH_c-)のメチル基)。その結果、メチンプロトンH_BはH_AとH_Cとのスピン分裂だけになり、H_Bのプロトンの解析は容易となる。この方法をモデル化合物portmicin、さらにはmonazomicin,に応用した結果、プロトン-プロトンのスピン結合定数の解析が容易となり立体化学の研究に応用できることが判明した。また、プロトンの連結したスピン系において、HMBCスペクトルにおけるの^2J結合、^3J結合のクロスピークの区別も可能となった。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (10件) 文献書誌 (3件)

  • [雑誌論文] Structure Elucidation and Synthesis of Lycoposerramine-B, a Novel Oxime-Containing Lycopodium Alkaloid from Lycopodium serratum Thunb.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      J.Org.Chem. 70

      ページ: 658-663

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mevashuntin, a novel metabolite produced-by inhibition of the mevalonate pathway in Streptomyces prunicolor2005

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      Tetrahedron Lett. 46

      ページ: 1273-1276

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Application of NMR screening techniques for observing ligand binding with a protein receptor.2005

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      Magn.Reson.Chem. 43

      ページ: 69-72

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Mevashuntin, a novel metabolite produced by inhibition of the mevalonate pathway in Streptomyces prunicolor2005

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      Tetrahedron Lett. 46

      ページ: 1273-1276

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structures of grixazone A and B, A-factor-dependent yellow pigments produced under phosphate depletion by Streptomyces griseus.2004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata, et al.
    • 雑誌名

      J.Antibiotics 57

      ページ: 218-223

    • NAID

      10012685846

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Presence of Copalyl Diphosphate Synthase Gene in an Actinomycete Possessing the Mevalonate Pathway.2004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      J.Antibiotics 57

      ページ: 739-747

    • NAID

      10014024066

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Computational and NMR Analyses for the Identification of Bound Water Molecules in Ribonuclease T12004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      ANARITICAL SCIENCES 20

      ページ: 1471-1474

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Structures of grixazone A and B, A-factor-dependent yellow pigments produced under phosphate depletion by Streptomyces griseus.2004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      J.Antibiotics 57(3)

      ページ: 218-223

    • NAID

      10012685846

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Presence of Copalyl Diphosphate Synthase Gene in an Actinomycete Possessing the Mevalonate Pathway.2004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      J.Antibiot. 57

      ページ: 739-747

    • NAID

      10014024066

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Computational and NMR Analyses for the Identification of Bound Water Molecules in Ribonuclease T2004

    • 著者名/発表者名
      K.Furihata et al.
    • 雑誌名

      ANARITICAL SCIENCES 20

      ページ: 1471-1474

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Furihata, et al.: "Improvement of double pulsed field gradient spin-echo ROESY experiments for identification of bound waters"Magn.Reson.Chem.. 41. 955-958 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] S.Chijiwa, K.Furiha, et al.: "Biosynthetic studies of versipelostatin, a novel 17-membered α-tetronic acid involved macrocyclic compound isolated for Steptmyces versipellis"Tetrahedron Lett.. 44. 5897-5900 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] S.Nishimura, K.Furihata, et al.: "Geranylgeranyltransferase Type I Inhibitor from the Marine Sponge Stylissa aff. massa"Organic Letters. 5. 2255-2257 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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