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相補的塩基対間の水素結合形成を検出するスピンラベル化ヌクレオシドの開発

研究課題

研究課題/領域番号 15590012
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 化学系薬学
研究機関九州大学

研究代表者

麻生 真理子  九州大学, 大学院・薬学研究院, 助手 (30201891)

研究分担者 末宗 洋  九州大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (20095897)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2004年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2003年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードスピンラベル化ヌクレオシド / N-tert-ブチルアミノキシル / ESR / 塩基対 / 水素結合 / ESRスペクトル / pH依存症 / N-tert-アミノキシルラジカル / イノシン / アデノシン / シチジン / グアノシン
研究概要

安定ラジカル、N-tert-ブチルアミノキシル基を核酸塩基部に直接導入した核酸誘導体のスピンラベル化ヌクレオシドとしての有用性の検討を目的とし、プリン塩基またピリミジン塩基にN-tert-ブチルアミノキシル基を導入し、その安定性や挙動を検討した。相補的塩基との水素結合形成時のESRスペクトル変化を検討するため、室温で安定に存在する2-N-tert-ブチルアミノギシルアデノシン、2-N-tert-ブチルアミノキシルイノシン、8-N-tert-ブチルアミノキシルイノシン及び5-N-tert-ブチルアミノキシルシチジン誘導体のESRスペクトルを種々条件下測定した。5-N-tert-ブチルアミノキシルシチジン誘導体は有機溶媒中、グアノシン誘導体と水素結合を形成する条件下、ESRスペクトルが変化した。ESRスペクトルが変化した要因としては、グアノシンとの水素結合形成の結果、5-N-tert-ブチルアミノキシルシチジンのシチジン部分の電子密度分布が変化した、N-tert-ブチルアミノキシル基の自由度が変化した等が考えられる。
2-N-tert-ブチルアミノキシルアデノシンはオリゴヌクレオチドへの導入に成功し、相補鎖との二重鎖形成時ESRスペクトルを精査した。一本鎖では三本線のスペクトルが観測されたのに対し、相補鎖と二重鎖を形成した場合、三本線の高磁場側が消失した。オリゴヌクレオチドの自由度の減少がESRスペクトルが変化したと考えられ、EPRスペクトルにより一本鎖と二重鎖の状態が区別できた。また、2-N-tert-ブチルアミノキシルイノシンのESRスペクトルは、pH依存的に変化し、塩基部の電子状態の変化がESRスペクトルに反映されることがわかった。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2005 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (7件) 文献書誌 (2件)

  • [雑誌論文] Synthesis and EPR studies of 2-N-tert-butylaminoxylpurine Derivatives2005

    • 著者名/発表者名
      T.Kaneko, M.Aso, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Org.Lett 2

      ページ: 303-306

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthesis and EPR studies of 2-N-tert-butylaminoxylpurine Derivatives2005

    • 著者名/発表者名
      T.Kaneko, M.Aso, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Org.Lett. 2

      ページ: 303-306

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular design of novel spin-labeled nucleoside directly attached base moiety2004

    • 著者名/発表者名
      T.Kaneko, T.Katsurabara, Y.Matsui, M.Aso, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Simposium Series 48

      ページ: 5-6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular design of novel spin-labeled nucleoside directly attached base moiety2004

    • 著者名/発表者名
      T.Kaneko, T.Katsurabara, Y.Matsui, M.Aso, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Nucleic Acid Simposium Series 48

      ページ: 5-6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular design of novel spin-labeled nucleoside directly attached hase moiety2004

    • 著者名/発表者名
      Kaneko, T.Katsurabara, Y.Matsui, M.Aso, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Simposium Series 48

      ページ: 5-6

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Synthetic studies and properties of N-tert-butylaminoxyl nucleosides2003

    • 著者名/発表者名
      M.Aso, T.Kaneko, M.Nakamura, Y.Matsui, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research Supplement 3

      ページ: 9-10

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Synthetic studies and properties of N-tert-butylaminoxylnucleosides2003

    • 著者名/発表者名
      M.Aso, T.Kaneko, M.Nakamura, Y.Matsui, N.Koga, H.Suemune
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 3(Supplement)

      ページ: 9-10

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Aso et al.: "A simple and efficient method for synthesis of 5-substituted 2'-deoxyuridine nucleosides using metal-halogen exchange reaction of 5-iodo-2'-deoxyuridine sodium salt"Chemical Communications. 2. 1094-1095 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] M.Aso et al.: "Synthetic studies and properties of N-tert-butylaminoxyl nucleosides"Nucleic Acids Research Supplement. 3. 9-10 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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