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刷り込みドメインの染色体構造に影響する、転写因子による調節中枢の役割

研究課題

研究課題/領域番号 15590290
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 人類遺伝学
研究機関北海道医療大学 (2004)
長崎大学 (2003)

研究代表者

太田 亨  北海道医療大学, 個体差健康科学研究所, 助教授 (10223835)

研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2004年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2003年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワードゲノムインプリンティング / インプリンティング調節中枢 / インスレーター / 転写因子 / ゲノムインプリティング / インプリティング調節中枢 / ゲノム刷り込み / Snrpn isoform / 刷り込み調節中枢
研究概要

ヒト染色体15q11-q13に相補的なマウスのインプリンティングドメインの調節領域の機序解明をおこなってきた。当初の予定では、この調節中枢は何らかの転写因子やインスレーターの結合によりドメイン全体を調節するものと思われ、この転写因子の単離、その結合領域の欠失を作製し、機能解析を試みようとした。しかし、この調節領域を解析していくと、そのような単純な機序で作用するのではないことが明らかになり、より詳細な解析をおこなった。
具体的には、この調節領域のヒト、マウスの塩基配列の相同性から、3種類以上の5箇所の転写因子結合領域を見つけた。そのうちのひとつはCTCF結合領域と同様の塩基配列をもち、In vitroのゲルシフトアッセイでも陽性バンドが認められた。したがって、ヒト染色体11番に位置するH19遺伝子上流付近に存在するインプリンティング調節領域のCTCFのインスレーター作用と同様な機序が示唆された。その後、このCTCF結合領域をレーポーターアッセイで、インスレーター活性を解析したところ、インスレートする機能は認められなかった。また、この結合領域は、調節領域のすぐ下流に位置するSnurf-Snrpn遺伝子の転写をエンハンスすることが認められた。他の2つの転写因子もレポーターアッセイで、遺伝子発現にエンハンスに働くことがわかった。これらの転写因子がインプリンティングドメインの調節因子としていると思われる。
これらのことはglobin領域のLCR(locus control region)の機能と相似している。
また、今後さらにマウスtransgeneによる解析を行うためのコンストラクトを作製し、解析を行っている。
また、さまざまなインプリンティング遺伝子の解析もおこなった。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (9件)

すべて 2004 2003 その他

すべて 雑誌論文 (6件) 文献書誌 (3件)

  • [雑誌論文] Imprinting analysis of 10 genes and/or transcripts in a 1.5-Mb MEST-flanking region at human chromosome 7q32.2004

    • 著者名/発表者名
      Yamada T
    • 雑誌名

      Genomics 83(3)

      ページ: 402-412

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Imprinting analysis of 10 genes and/or transcripts in a 1.5-Mb MEST-flanking region region at human chromosome 7q32.2004

    • 著者名/発表者名
      Yamada T
    • 雑誌名

      Genomics 83(3)

      ページ: 402-412

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] On the conflicting reports of imprinting status of mouse ATP10a in the adult brain: strain-background-dependent imprinting?2003

    • 著者名/発表者名
      Kayashima T
    • 雑誌名

      J Hum Genet 48(9)

      ページ: 492-493

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Atp10a, the mouse ortholog of the human imprinted ATP10A gene, escapes genomic imprinting.2003

    • 著者名/発表者名
      Kayashima T
    • 雑誌名

      Genomics 81(6)

      ページ: 644-647

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] On the conflicting reports of imprinting status of mouse ATP10a in the adult brain : strain-background-dependent imprinting?2003

    • 著者名/発表者名
      Kayashima T
    • 雑誌名

      J Hum Genet 48(9)

      ページ: 492-493

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] On the conflicting reports of imprinting status of mouse ATP10a in the adult brain : strain-back ground-dependent imprinting?2003

    • 著者名/発表者名
      Kayashima T
    • 雑誌名

      J Hum Genet 48(9)

      ページ: 492-493

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada T. et al.: "Imprinting analysis of 10 genes and/or transcripts in a 1.5-Mb MEST-flanking region at human chromosome 7q32"Genomics. 83(3). 402-412 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kayashima T. et al.: "Atp10a, the mouse ortholog of the human imprinted ATP10A gene, escapes genomic imprinting"Genomics. 81(6). 644-647 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Yamasaki K. et al.: "Neurons but not glial cells show reciprocal imprinting of sense and an tisense transcripts of Ube3a"Human Molecular Genetics. 12(8). 837-847 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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