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遺伝子発現プロファイルを用いた生薬のフィンガープリント作成とターゲット分子の同定

研究課題

研究課題/領域番号 15590598
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 内科学一般(含心身医学)
研究機関山口大学

研究代表者

飯塚 徳男  山口大学, 医学部, 寄附講座教員 (80332807)

研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2004年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
2003年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードDNAマイクロアレイ / 生薬 / フィンガープリント / アルカロイド / 膵臓癌
研究概要

本研究では近年登場したDNAマイクロアレイ技術により、天然生薬構成成分のターゲット遺伝子を同定し、各成分の生物学的作用をプロファイリングすることにより、「whole drugとしての生薬とpurifyされた各成分の作用がどのように違うのか?」といった問題の解決をin silico studyで行うことである。
1.膵臓癌細胞8株において、huU95A^<【○!R】>(Affymetrix, Santa Clara, CA)を用いた12600遺伝子のDNAマイクロアレイ解析を行い、遺伝子発現プロファイルを作成した。
この8株に対し、生薬黄連と主成分berberineのターゲット遺伝子のスペクトルを検討した。
すなわち、感受性(ID50)とその発現が相関する遺伝子の同定を行ったところ、一部の遺伝子は生薬黄連と主成分berberineの共通のターゲットであることが判明し、Int.J.Cancer 107:666-672,2003.にて報告した。
2.黄連構成成分である(berberine, palmatin, groenlandicine, epiberberine, coptisine, berberrubine, columbamine, tetrahydroberberine)を用いて、その増殖抑制効果をMTT assayにて検討し、各ID50と発現量の相関する遺伝子をリストした。これらのID50に基づきクラスター解析を行ったところ、生薬黄連とberberineがひとつのクラスターを形成し、残りの7成分が別のクラスターを形成した。この結果により、一成分であるberberineのみで生薬黄連の薬効を説明できるものでであり、その結果を論文として発表した(Life Sciences in press)。
3.その他、当該研究期間中にDNAマイクロアレイ研究として英文(17報:Impact Factor 合計78.714)・和文(3報)を発表した。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (11件) 図書 (2件) 文献書誌 (6件)

  • [雑誌論文] Self-organizing-map-based molecular signature representing the development of hepatocellular carcinoma.2005

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      FEBS Lett. 579

      ページ: 1089-1100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Sex-based molecular profiling of hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma2005

    • 著者名/発表者名
      Takemoto N, Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Int.J.Oncol. 26

      ページ: 673-678

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Tumor HLA-DR expression linked to early intrahepatic recurrence of hepatocellular carcinoma.2005

    • 著者名/発表者名
      Matoba R., Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Int.J.Cancer 115

      ページ: 231-240

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular dissection of a medicinal herb with anti-tumor activity by oligonucleotide microarray2005

    • 著者名/発表者名
      Hara A., Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      life Sci. (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Self-organizing-map-based molecular signature representing the development of hepatocellular carcinoma.2005

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      FEBS Letters 579

      ページ: 1089-1100

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Tumor HLA-DR expression linked to early intrahepatic recurrence of hepatocellular carcinoma.2005

    • 著者名/発表者名
      Matoba R, Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Int.J.Cancer (in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular dissection of a medicinal herb with anti-tumor activity by oligonucleotide microarray2005

    • 著者名/発表者名
      Hara A, Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Life Sci. (in press)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Predicting individual outcomes in hepatocellular carcinoma.2004

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      LANCET 364

      ページ: 1837-1839

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] 肝細胞癌のトランスクリプトームと予後予測2004

    • 著者名/発表者名
      飯塚徳男 他
    • 雑誌名

      ゲノム医学 4

      ページ: 269-275

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Predicting individual outcomes in hepatocellular carcinoma.2004

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Lancet 364

      ページ: 1837-1839

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Molecular dissection of a medicinal herb with anti-tumor activity by oligonucleotide microarray

    • 著者名/発表者名
      Hara A, Iizuka N et al.
    • 雑誌名

      Life Sciences (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Hepatocellular carcinoma of differential viral origin : analysis by oligonucleotide microarray (Cancer-Handbook (edited by Prof.M.A Hayat))2005

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 出版者
      Elsevier Inc.(in press)
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [図書] Hepatocellular carcinoma of differential viral origin : analysis by oligonucleotide microarray (Cancer Handbook edited by Prof. M.A.Hayat)2005

    • 著者名/発表者名
      Iizuka N et al.
    • 出版者
      Elsevier Inc.(in press)
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Iizuka N, et al.: "Oligonucleotide microarray for prediction of early intrahepatic recurrence of hepatocellular carcinoma after curative resection"Lancet. 361. 923-929 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Iizuka N, et al.: "Telomerase activity and Nm23-H2 protein expression in hepatocellular carcinoma"Anticancer Resarch. 23. 43-47 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Iizuka N, et al.: "Differential gene expression in distinct virologic types of hepatocellular carcinoma : association with liver cirrhosis"Oncogene. 22. 3007-3014 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Iizuka N, et al.: "Identification of common or distinct genes related to antitumor activities of a medicinal herb and its major component"International Journal of Cancer. 107. 666-672 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Okada T, Iizuka N, et al.: "Gene expression profile linked to p53 status in hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma"FEBS Letters. 555. 583-590 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Iizuka N, et al.: "Molecular signature in three types of hepatocellular carcinoma with different viral origin by oligonucleotide microarray"International Journal of Oncology. 24. 565-574 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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