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バイオインフォマティクスを用いたダイオキシン受容体標的遺伝子の系統的同定

研究課題

研究課題/領域番号 15591162
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 胎児・新生児医学
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

小崎 健次郎  慶應義塾大学, 医学部, 助教授 (30234743)

研究分担者 三橋 隆行  慶應義塾大学, 医学部, 助手 (80338110)
米元 純三  独立行政法人国立環境研究所, 総合研究官 (30072664)
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2004年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
2003年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードダイオキシン / ダイオキシン受容体 / バイオインフォマティクス / マイクロアレイ / ヒト完全長cDNA配列 / teratogen
研究概要

約5000個のヒト完全長cDNA配列(東大医科研が公開)と、ヒトゲノム配列と逐次比較し、約2800個の遺伝子について、転写開始点から10kb上流までの配列をデータベース化した。同様にマウス完全長cDNA配列(理化学研究所が公開)とマウスゲノム配列を逐次比較し、転写開始点から10kb上流までの配列をデータベース化した。これらのデータベースを用いて、転写開始点から10kb上流までの配列におけるダイオキシン反応性モチーフ(塩基配列GCGTG : Dioxin responsive element以下DRE)の分布を、定量化し、DREが転写開始点上流近傍に多く存在することを示した。DREの分布と遺伝子発現量との間の相関を見るため、まずマイクロアレー(Affymetrix社)を用いた解析により、ダイオキシン曝露の有無によるマウス胎児前脳の遺伝子発現量の差について検討した。同じcDNAサンプルを用いて2度のマイクロアレー解析を行い、ダイオキシン曝露群の遺伝子発現量が2度とも2倍以上に増加した遺伝子は6個(Cyp1a1,Rgs5,Atm,Cyp1b1,Cyp1a1,Nnt,Archain1)、2度とも0.5倍以下に減少した遺伝子は6個(Nfia,Xlr3b,Mab2112,Gbe1,Hemgn,Mid1)存在した。遺伝子発現変化の再現性をReal-time PCR法により確認した。既にダイオキシンにより遺伝子が誘導される事が示されている本実験ではCyp1a1やCyp1b1の遺伝子発現が増加したことから、充分量のAHRRが胎児全脳に到達したと考えられる。発達遅滞をきたすヒトの先天異常症候群の原因遺伝子であるMid1が減少したことはダイオキシン曝露と中枢神経異常の関連を考える上で注目に値するデータである。

報告書

(3件)
  • 2004 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2004 その他

すべて 雑誌論文 (10件) 文献書誌 (4件)

  • [雑誌論文] Position-specific expression of Hox genes along the gastrointestinal tract.2004

    • 著者名/発表者名
      Yahagi N, Kosaki R, Ito T, Mitsuhashi T, Shimada H, Tomita M, Takahashi T, Kosaki K.
    • 雑誌名

      Congenital Anomalies 44

      ページ: 18-26

    • NAID

      10018085417

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Marfanoid Habitus With Abnormal Situs.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Bird LM, Maeda J, Higuchi M, Jones MC, Matsumoto M.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics 127A

      ページ: 310-312

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Premature ovarian failure in a female with proximal symphalangism and NOG mutation.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Sato S, Hasegawa T, Matsuo N, Suzuki T, Ogata T.
    • 雑誌名

      Fertility and Sterility 81

      ページ: 1137-1139

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書 2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Absent inner dynein arms in a fetus with familial hydrocephalus-situs abnormality.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Ikeda K, Miyakoshi K, Ueno M, Kosaki R, Takahashi D, Tanaka M, Torikata C, Yoshimura Y, Takahashi T.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics 129

      ページ: 308-311

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Premature ovarian failure in a female with proximal symphalangism and NOG mutation.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Sato S, Hasegawa T, Matsuo N, Suzuki T, Ogata T.
    • 雑誌名

      Fertility 81

      ページ: 1137-1139

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Absent inner dynein arms in a fetus with familial hydrocephalus-situs abnormality.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Ikeda K, Miyakoshi K, Ueno M, Kosaki R, Takahashi D, Tanaka M, Torikata C Yoshimura Y, Takahashi T.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics 129

      ページ: 308-311

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] Absent inner dynein arms in a fetus with familial hydrocephalus-situs abnormality.2004

    • 著者名/発表者名
      Kosaki K, Ikeda K, Miyakoshi K, Ueno M, Kosaki R, Takahashi D, Tanaka M, Torikata C, Yoshimura Y, Takahashi T.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics 129A

      ページ: 308-311

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] OEIS compelx With del(3)(q12.2q13.2).

    • 著者名/発表者名
      Kosaki R, Fukuhara Y, Kosuga M, Okuyama T, Kawashima N, Honna T, Ueoka K, Kosaki K.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics (印刷中)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] OEIS compelx With del(3)(q12.2q13.2).

    • 著者名/発表者名
      Kosaki R, Fukuhara Y, Kosuga M, Okuyama T, Kawashima N, Honna T, Ueoka K, Kosaki K.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics (in print)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2004 研究成果報告書概要
  • [雑誌論文] OEIS complex With del(3)(q12.2q13.2).

    • 著者名/発表者名
      Kosaki R, Kosaki K, Kawashima N, Ueoka K, Fukuhara Y, Kosuga M, Honna, T, Okuyama T.
    • 雑誌名

      American Journal of Medical Genetics (印刷中)

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Yahagi N, Kosaki R, Ito T, Mitsuhashi T, Shimada H, Tomita M, Takahashi T, Kosaki K.: "Position-specific expression of Hox genes along the gastrointestinal tract."Congenital Anomalies. 44. 18-26 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kosaki K, Bird LM, Maeda J, Higuchi M, Jones MC, Matsumoto M.: "Marfanoid Habitus With Abnormal Situs."American Journal of Medical Genetics. (印刷中).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kosaki K, Sato S, Hasegawa T, Matsuo N, Suzuki T, Ogata T.: "Premature ovarian failure in a female with proximal symphalangism and NOG mutation."Fertility and Sterility. (印刷中).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Kosaki K, Ikeda K, Miyakoshi K, Ueno M, Kosaki R, Takahashi D, Tanaka M, Torikata C, Yoshimura Y, Takahashi T.: "Absent inner dynein arms in a fetus with familial hydrocephalus-situs abnormality."American Journal of Medical Genetics. (印刷中).

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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