| 研究課題/領域番号 |
15591402
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
消化器外科学
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
池田 正孝 (2004) 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356)
大植 雅之 (2003) 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (40294095)
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| 研究分担者 |
関本 貢嗣 大阪大学, 医学系研究科, 助教授 (10273658)
山本 浩文 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (30322184)
池田 正孝 大阪大学, 医学系研究科, 助手 (80335356)
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| 研究期間 (年度) |
2003 – 2004
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| 研究課題ステータス |
完了 (2004年度)
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| 配分額 *注記 |
3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
2004年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
2003年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
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| キーワード | 大腸癌 / DNAチップ / 肝転移 / リンパ節転移 / 臨床応用 / マルチセンターシステム / 大腸菌 / 遺伝子発現プロファイル / 予後予測システム / 臨床診断型DNAチップ / cDNA microarray / 遺伝子発現 / オリゴヌクレオチド |
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| 研究概要 |
本研究の目的は、DNAチップ技術を応用し大腸癌に対して、これまでの病理組織診断ではできなかった臨床予後予測診断システムを構築することにより、大腸腫瘍学における臨床診断・予後の改善を目指すことである。大腸癌組織の遺伝子発現からみた臨床進行度診断、化学療法感受性予測診断の可能性の追求に加え、肝転移、リンパ節転移などの予測診断システムを確立し、関連遺伝子群の同定による治療標的の抽出を行う。
初年度は、大阪大学と関連病院で切除術された大腸癌の切除標本および臨床病理学的情報を収集し、マルチセンターシステムの基礎を構築し、標本、抽出RNA、標本情報、臨床病理情報の整理・管理体制を築いた。収集された大腸癌切除標本からmRNAを抽出し、超微量mRNA分析用マイクロラボチップによるquality checkを行なった上で、Target DNA(臨床検体)の調整を進める。また、これまでにcDNAマイクロアレイを用いて得られた200例の大腸癌データより、肝転移、リンパ節転移など臨床情報に深く関与する約200の遺伝子群を選択し、それぞれに対応した60merの特異的配列をもったオリゴDNAを高密度にスライドグラス上にスポットし、臨床診断用大腸癌オリゴDNAチップを開発・作製した。予備検討により決定されたプロトコールに従い一定条件下で臨床診断用大腸癌オリゴDNAチップによる遺伝子情報を順次取得し、肝転移、リンパ節転移の予測診断を主解析テーマとして、遺伝子発現情報と臨床病理学的データのマイニングを行う。さらにこれまでの解析に無関係なindependentサンプルを対象validation studyを行ない、臨床フィードバックの実現性の検証を行う。
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