ギガビット・インターネットを利用した癌遺伝子多型情報の解析

• 研究課題/領域番号: 15591933
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 形態系基礎歯科学
• 研究機関: 岡山大学
• 研究代表者: 河原 研二 岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助教授 (50076113)
• 研究分担者: 永井 教之 岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 教授 (90085770) ; 長塚 仁 岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助教授 (70237535) ; GUNDUZ Mehmet 岡山大学, 大学院・医歯学総合研究科, 助手 (70333507)
• 研究期間 (年度): 2003 – 2004
• 研究課題ステータス: 完了 (2004年度)
• 配分額: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円); 2004年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円); 2003年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
• キーワード: ギガビット・インターネット / 癌遺伝子多型情報 / ゲノムセミナー / 動画LIVE / IPv6・プロトコール / ギガビット / JGN / インターネット / SNP / ゲノム

研究概要

近年インターネットの発達は目覚ましいものがあるが、高齢社会の生活習慣病(高血圧、糖尿病)の多遺伝子性疾患、オーダーメイド医療への転換のための疾患感受性遺伝子(SNP)の解析が行われている。
これらの多量の個人情報の解析及び研究技術のグローバル化を目指し、無料のネットワーク、インターネット回線を利用し、国内で最も太い回線のTAO (Japan Giga Network : JGN)によるデータ配信をサーバー構築して試みた。今回、LIVEの実験操作として、総務省直轄の(TAO)ギガネットの接続許可を戴き、本学部にセットされた光ファイバー155Mbps超高速インターネット回線による動画像配信と教育効果の改善を目指した。研究代表者がTAO回線での接続経験を有する岡山市内の岡山理科大学との双方向けの動画像配信(70Mbps)のテストを数回行い、カリキュラム発信のHPやTV会議用のサーバーとしても役立つことを示した。
1年目は本学部に設置したATM回線(155Mbit)に接続するサーバー(購入備品)の構築を行った。稼働できる整備が備わっていた。
2年目は研究計画としてネットワークを構築する必要があり、以下の通りに行った。
(1)セキュリティーの面で接続先のインターネット、グローバルIPを現在使用のIPv4・プロトコールから個別を特定できるIPv6・プロトコールに変更した。ルーティング作業は河原が約3ヶ月かけて実証実験した。
(2)接続先には高速インターネット回線ギガビットネットワークセンター経由で英語により国内外に向けて発信を計画し、学会セミナーの企画、開催で韓国ソウル大学歯学部を訪問し、両者が接続できることを確認した。
(3)研究代表者の永井、長塚、Gunduzは口腔癌等の遺伝子を解析し、国内外に情報発信することを可能にした。

研究成果

• [雑誌論文] Characteritics of Melanosomes in Melanotic and Amelanotic Melanomas (2004)
  • 著者名/発表者名: You-jin Lee
  • 雑誌名: J.of Hard Tissue Biology 13(2) ページ: 89-92
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Effect of demethylating agent 5-aza-2(‘)-deoxycytidine and histone deacetylase inhibitor FR901228 on maspin gene expression in oral cell lines. (2004)
  • 著者名/発表者名: Murakami J.
  • 雑誌名: Oral Oncol. 40(6) ページ: 597-603
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Cyclin A correlates with the sensibility of human cancer cells to cytotoxic effects of 5-FU. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kawashima R.
  • 雑誌名: Int.J.Oncol. 24(2) ページ: 273-278
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Localization of heparanase in esophageal cancer cell : respective roles in prognosis and differentiation. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa T.
  • 雑誌名: Lab Invest. 84(10) ページ: 1289-1304
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Adjuvant targeted therapy with trastuzumab may decrease metastatic capacity in specific group of oropharyngeal cancer patients : downregulation of E-cadherin-catenin complex by cooperative effect of erbB-2 and human papillomavirus type 16 E6/E7 (2004)
  • 著者名/発表者名: Altundag O.
  • 雑誌名: Protooncogenes 63(2) ページ: 277-280
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Characteritics of Melanosomes in Melanotic and Amelanotic Melanomas (2004)
  • 著者名/発表者名: You-jin Lee, Esra Gunduz, Ryo Tamamura, Shin Takagi, Kenji Kawahara, Kan Rui, Huang Bingzhen, Gul San Ara Sathi, Mahmoud Hashem Al Sheikh Ali, Noriyuki Nagaoka, Jing Xiao, Noriyuki Nagai
  • 雑誌名: J.of Hard Tissue Biology 13(2) ページ: 89-92
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Effect of demethylating agent 5-aza-2(‘)-deoxycytidine and histone deacetylase inhibitor FR901228 on maspin gene expression in oral cell lines. (2004)
  • 著者名/発表者名: Murakami J., Asaumi J., Maki Y., Tsujigiwa H., Kuroda M., Nagai N., Yanagi Y., Inoue T., Kawasaki S., Tanaka N., Matsubara N., Kishi K.
  • 雑誌名: Oral Oncol. 40(6) ページ: 597-603
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Cyclin A correlates with the sensibility of human cancer cells to cytotoxic effects of 5-FU. (2004)
  • 著者名/発表者名: Kawashima R., Haisa M., Kitamura M., Takaoka M., Shirakawa Y., Takeda H., Uetsuka H., Gunduz M., Nagai N., Tanaka N., Naomoto Y.
  • 雑誌名: Int.J.Oncol. 24(2) ページ: 273-278
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Localization of heparanase in esophageal cancer cell : respective roles in prognosis and differentiation. (2004)
  • 著者名/発表者名: Ohkawa T., Naomoto Y., Takaoka M., Nobuhisa T., Noma K., Motoki T., Murata T., Uetsuka H., Kobayashi M., Shirakawa Y., Yamatsuji T., Matsubara N, Matsuoka J., Haisa M., Gunduz M., Tsujigiwa H., Nagatsuka H., Hosokawa M., Nakajima M., Tanaka N.
  • 雑誌名: Lab Invest. 84(10) ページ: 1289-1304
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Adjuvant targeted therapy with trastuzumab may decrease metastatic capacity in specific group of oropharyngeal cancer patients : downregulation of E-cadherin-catenin complex by cooperative effect of erbB-2 and human papillomavirus type 16 E6/E7 (2004)
  • 著者名/発表者名: Altundag O., Altundag K., Morandi P., Gunduz M.
  • 雑誌名: Protooncogenes 63(2) ページ: 277-280
  • 説明: 「研究成果報告書概要(欧文)」より
• [雑誌論文] Expression of Notch in a case of osteosarcoma of the maxilla (2004)
  • 著者名/発表者名: Kawakami T
  • 雑誌名: European Journal of Medical Research 9(11) ページ: 533-535
• [雑誌論文] Effects of demethylating agent 5-aza-2(')-deoxycytidine and histone deacetylase inhibitor FR901228 on maspin gene expression in oral cancer cell lines (2004)
  • 著者名/発表者名: Murakami J
  • 雑誌名: Oral Oncology 40(6) ページ: 597-603
• [雑誌論文] Expression of osteoclast differentiation factor and osteoclastogenesis inhibitory factor in rat osteoporosis induced by immunosuppressant FK506 (2004)
  • 著者名/発表者名: Fukunaga J
  • 雑誌名: Bone 34(3) ページ: 425-431
• [雑誌論文] Cyclin A correlates with the sensitivity of human cancer cells to cytotoxic effests of 5-FU (2004)
  • 著者名/発表者名: Kawashima R
  • 雑誌名: International Journal of Oncology 24(2) ページ: 273-278
• [雑誌論文] In vitro response of osteoblast-like and odontoblast-like cells to unsubstituted and substituted apatites (2004)
  • 著者名/発表者名: Inoue M
  • 雑誌名: Journal of Biomedical Materials Research 70A(4) ページ: 585-593
• [雑誌論文] Characteristics of Melanosomes in Melanotic and Amelanotic Melanomas (2004)
  • 著者名/発表者名: You-jin-Lee
  • 雑誌名: Journal of Hard Tissue Biology 13(2) ページ: 89-92
• [雑誌論文] Collaboration of dental field with web radio and video live by mit21 group (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawahara Kenji
  • 雑誌名: the Quintessence 22(3) ページ: 642-647
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Influence for gigabite network of dental digitalization I (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawahara Kenji
  • 雑誌名: the Quintessence 22(11) ページ: 2496-2499
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [雑誌論文] Influence for gigabite network of dental digitalization II (2003)
  • 著者名/発表者名: Kawahara Kenji
  • 雑誌名: the Quintessence 22(12) ページ: 2737-2740
  • 説明: 「研究成果報告書概要(和文)」より
• [文献書誌] 河原研二: "医療を変革させる歯科デジタル化でのネットワークの影響(I)"ザ・クインテッセンス. 22巻・11号. 2496-2499 (2003)
• [文献書誌] 河原研二: "医療を変革させる歯科デジタル化でのネットワークの影響(II)"ザ・クインテッセンス. 22巻・12号. 2737-2740 (2003)
• [文献書誌] Kimura A: "Gene expression of type I collagen in neoplastic chondrocytes"European Journal Medical Research. 8(4). 165-167 (2003)
• [文献書誌] Nishizaki K: "Mastoid obliteration by BMP-2/collagen composites: an experimental study using tissue engineering"American Journal of Otolaryngology. 24(1). 14-18 (2003)
• [文献書誌] Beder LB: "Abstract Genome-wide analyses on loss of heterozygosity in head and neck squamous cell carcinomas"Laboratory Investigation. 83(1). 99-105 (2003)
• [文献書誌] Takaoka M: "Heparanase expression correlates with invasion and poor prognosis in gastric cancers"Laboratory Investigation. 83(5). 613-622 (2003)