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日本近海域のコールドシープにおける微生物群集とプレート活動との相関に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 15651008
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 環境動態解析
研究機関独立行政法人海洋研究開発機構

研究代表者

加藤 千明  独立行政法人海洋研究開発機構, 極限環境生物圏研究センター, グループリーダー (90360750)

研究分担者 佐藤 孝子  独立行政法人海洋研究開発機構, 極限環境生物圏研究センター, サブリーダー (20371734)
能木 祐一  独立行政法人海洋研究開発機構, 極限環境生物圏研究センター, サブリーダー
能木 裕一  独立行政法人海洋研究開発機構, 極限環境生物フロンティア研究システム, グループサブリーダー
研究期間 (年度) 2003 – 2004
研究課題ステータス 完了 (2004年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
2004年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2003年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
キーワードコールドシープ / 微生物学的多様性 / 日本海 / バクテリアマット / 硫酸還元菌 / イオウ酸化細菌 / 好圧菌 / 地殻活動
研究概要

2003年度の調査により得られた、北東日本海バクテリアマットサンプルより微生物学的多様性解析を行い、得られた結果をまとめた。また、本年度計画にあった日本海溝最深部でのサンプリングは、本調査研究そのものが調査機器の不具合の発生のためキャンセルとなったが、新たに、相模湾、釧路沖等のコールドシープのサンプルを得ることができ、引き続き微生物学的多様性解析を行った。得られた結果をまとめ、これまでのデータと比較したところ、次に示すいくつかの新知見が得られた。
1)コールドシープ特異的な微生物相の同定
北東日本海、日本海溝、相模湾の3つの海域のコールドシープの微生物学的多様性を比較した結果から、これらの底泥には共通した微生物相が存在することが明らかとなった。すなわち、表層より15〜20cmの深度でメタン生産菌、5〜15cm深度で硫酸還元菌コンソーシアム(硫酸還元バクテリアと、嫌気的メタン酸化アーキアより成る)が存在した。さらにそれより浅いところでは、イオウ酸化細菌と近縁な微生物が存在し、コールドシープ底泥中で微生物活動により生産された硫化水素をエネルギー源とする生態系を支えていることが示唆された。
2)グループ1硫酸還元バクテリアの提唱
硫酸還元バクテリア(SRB)は、コールドシープ底泥だけではなく一般海底にも広く分布しているが、微生物解析の過程でコールドシープ特異的なSRBの存在を示唆するデータが得られ、我々は系統樹で別れているこのグループを「グループ1硫酸還元バクテリア」として定義した。
これらの成果は、平成16年9月に米国で行われた、国際極限環境生物国際会議(Extremophiles2005 congress at Cambridge, USA)にて報告され、注目を浴びた。これまでの結果から、活発なコールドシープ活動が推定されている現場から、大量の現場特異的微生物相が見いだされているところから、こうした微生物の存在量がコールドシープの活動に依存している可能性が示唆され、本研究の目的であった、シープ特異的な微生物群集とプレート活動との相関は確実に存在することを明らかとした。
今後、この2年間の「萌芽研究」の成果をふまえ、環境ゲノム解析の手法を用いたプレー活動予測をターゲットとして、平成17年度より、基盤研究Aとして「日本近海域におけるコールドシープ環境のゲノム解析から見えるプレート活動予測」を申請した。

報告書

(2件)
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2004 その他

すべて 雑誌論文 (2件) 図書 (1件) 文献書誌 (1件)

  • [雑誌論文] Microbial diversity of bacterial mat samples collected at a depth of 3,100 m in the Japan Sea.2004

    • 著者名/発表者名
      Arakawa, S., Kato, C., Sato, T., Noei, Y.et al.
    • 雑誌名

      Marine Biotechnology 6

      ページ: 185-189

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Colwellia piezophila sp.nov., a novel piezophilic Colwellia species from deep-sea sediments of the Japan Trench.2004

    • 著者名/発表者名
      Nogi, Y., Hosoya, S., Kato, C., Horikoshi, K.
    • 雑誌名

      Int.J.Syst.Evol.Microbiol. 54

      ページ: 1627-1631

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [図書] 「難培養微生物研究の最新技術-未利用微生物資源へのアプローチ-」(工藤俊章、大熊盛也編)「第4章深海極限環境における微生物学的多様性と難培養性微生物」を執筆2004

    • 著者名/発表者名
      加藤千明, 荒川康
    • 総ページ数
      265
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Shizuka Arakawa, Chiaki Kato, Takako Sato, Yuichi Nogi, et al.: "Microbial Diversity of bacterial Mat Samples at a Depth of 3,100m in the Japan Sea."Marine Biotechnology (Springer-Verlag). 6(印刷中). (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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