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家畜遺伝資源の保全に関する理論研究とデータベースの構築

研究課題

研究課題/領域番号 15658076
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 畜産学・草地学
研究機関京都大学

研究代表者

廣岡 博之  京都大学, 農学研究科, 教授 (60192720)

研究分担者 守屋 和幸  京都大学, 情報学研究科, 教授 (90159195)
野村 哲郎  京都産業大学, 工学部, 教授 (50189437)
佐藤 正寛  独立行政法人農業生物資源研究所, 遺伝資源研究グループ, 研究チーム長 (70370658)
研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
2005年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2004年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2003年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
キーワード遺伝的多様性 / 在来家畜 / 遺伝資源 / 見島牛 / 近交度 / 交配計画 / 最小血縁選抜 / 和牛 / 遺伝子的多様性 / 三島牛
研究概要

本プロジェクトから得られた主な結果は次の4点である。
1.日本の和牛の原型である見島牛の近交係数は現在30%を超えておりきわめて近交の進んだ状況にあることが示唆され、さらに100年以上にわたり完全に島内に隔離されていたことも考慮すると50%を超えている可能性が指摘された。
2.昭和初期から現在に至るまでの黒毛和種の発育様相の変遷が調べた結果、成熟体重に関しては昭和初期から現在に至るまでに大幅に大型化しているが、成熟速度に関しては一時期晩熟化したが、最近になって早熟化する傾向にあることが実証された。
3.世代の重複する家畜集団において遺伝的多様性を最大に維持する選抜方法を検討した。この研究においては、次世代の平均血縁係数を最小にする選抜方法と長期にわたる血縁係数を最小にする選抜方法が提唱され、いずれも無作為選抜の場合よりも集団の有効な大きさは2、3倍に拡大できることが示された。
4.集団の有効な大きさの推定法について理論面から検討した結果、集団の有効な大きさは、世代当たりの近交係数の上昇量や遺伝的多様性の低下量と反比例する関係にあり、遺伝資源の保存にあたっては最も重要なパラメータであった。動物集団に固有の繁殖構造を想定し、このパラメータを野外調査から得られる個体数などのデータから推定する方法が開発された。
最後に、最小血縁交配による最適な雄および雌の組み合わせを決定する手法として、シミュレーティド・アニーリングを用いた最適化プログラムの構築を行った。さらに、生産現場での血統情報の管理、交配シミュレーション等をGUIベースで実行可能なWindowsアプリケーションの構築を行った。以上の結果はすでに報告書としてまとめた。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 (12件) 文献書誌 (2件)

  • [雑誌論文] 見島牛の集団構造と遺伝的多様性2006

    • 著者名/発表者名
      広岡博之, 野村哲郎, 佐藤正矢, 村本知新, 米屋宏志, 小澤忍
    • 雑誌名

      在来家畜研究会報告 第23号(印刷中)

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] 昭和初期から現在までの和牛の発育様相の変遷に関する一検討2005

    • 著者名/発表者名
      広岡博之, 長命洋佑
    • 雑誌名

      肉用牛研究会報 79

      ページ: 9-14

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Methods for minimizing the loss of genetic diversity in conserved populations with overlaping generations2005

    • 著者名/発表者名
      Nomura T.
    • 雑誌名

      Conservation Genetics 6

      ページ: 655-663

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Effective population size under random mating with a finite number of matings2005

    • 著者名/発表者名
      Nomura T.
    • 雑誌名

      Genetic 171

      ページ: 1441-1442

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Use of the Syrian hamster, Mesocricetus auratus, in selection for fertility in animal breeding 1.Physiology of reproduction for selection experiments2005

    • 著者名/発表者名
      Masahiro SATOH
    • 雑誌名

      Journal of Animal Genetics 32・2

      ページ: 55-64

    • NAID

      10016145475

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Use of the Syrian hamster, Mesocricetus auratus, in selection for fertility in animal breeding 2.Selection for reproductive performance2005

    • 著者名/発表者名
      Masahiro SATOH
    • 雑誌名

      Journal of Animal Genetics 32・2

      ページ: 65-79

    • NAID

      10016145538

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] A comparison of restricted selection procedures to control genetic gains2004

    • 著者名/発表者名
      Ieiri, T.Nomura, H.Hirooka, M.Satoh
    • 雑誌名

      Journal of Animal Breeding and Genetics 121

      ページ: 90-100

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Improving environmental management for higher reproduction accelerates genetic improvement closed herd of swine2004

    • 著者名/発表者名
      Satoh M
    • 雑誌名

      Animal Science Journal 75

      ページ: 499-502

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] A method of computing restricted best linear unbiased prediction of breeding values for some animals in a population2004

    • 著者名/発表者名
      Satoh M
    • 雑誌名

      Journal of Animal Science 82

      ページ: 2253-2258

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Methods for minimizing the loss of genetic diversity in conserved populations with overlapping generations

    • 著者名/発表者名
      Nomura T
    • 雑誌名

      Conservation Genetics In press

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] 昭和初期から現在までの和牛の発育様相の変遷に関する一検討

    • 著者名/発表者名
      広岡博之, 長命洋佑
    • 雑誌名

      肉用牛研究会報 印刷中

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Effective population size under random mating with a finite number of matings

    • 著者名/発表者名
      Nomura T
    • 雑誌名

      Genetics In press

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] Ieiri, S., Nomura, T., Hirooka, H., M.Satoh: "A comparison of restricted selection procedures to control genetic gains."Journal of Animal Breeding and Genetics. 印刷中.

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] Satoh M.: "Including an additional systematic environmental effect within a generation in evaluation model improves accuracy of prediction of breeding values in a closed herd of pigs."Animal Science Journal. 75. 97-102 (2004)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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