| 研究課題/領域番号 |
15659500
|
|---|
| 研究種目 |
萌芽研究
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 研究分野 |
社会系歯学
|
|---|
| 研究機関 | 東北大学 |
|---|
研究代表者 |
高橋 信博 東北大学, 大学院・歯学研究科, 教授 (60183852)
|
|---|
| 研究分担者 |
小関 健由 東北大学, 大学院・歯学研究科, 教授 (80291128)
竹原 直道 九州歯科大学, 歯学部, 教授 (00038879)
佐藤 拓一 東北大学, 大学院・歯学研究科, 講師 (10303132)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2003 – 2004
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2004年度)
|
| 配分額 *注記 |
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2004年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2003年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
|
|---|
| キーワード | DNAチップ / 16S ribosomal RNA / DNAプローブ / DNAプライマー / 口腔細菌 / DNAプライヤー / 培養法 / PCR-RFLP法 / 菌種特異的PCR法 |
|---|
| 研究概要 |
本年度は、1.前年度設計した口腔細菌特異的プローブを作成し、DNAチップへの搭載の可否(実用性)を検討し、2.DNAチップへの搭載が可能と考えられた24種のプローブを用いて口腔微生物叢解析用DNAチップを試作し、口腔微生物種特異性、使用法などを検討した。
1.DNAチップ搭載用口腔細菌特異的プローブの作成:
プローブの特異性についてはGeneBankなどの既存のDNAデータベースから、プローブのDNAチップへの搭載の可否についてはDNAチップ作成手順などの実用性から検討し、その結果、24種の口腔微生物に対する特異的プローブが完成した。さらに、この1年間で新たに入手した口腔微生物16S ribosomal RNA遺伝子配列データに基づき、新たなプローブを設計・作成中である。
2.DNAチップ搭載用の24種の口腔微生物特異的プローブを用いた口腔微生物叢解析用DNAチップの試作:
DNAチップ作成共同研究企業にて、24種の口腔微生物特異的プローブを搭載したDNAチップを試作した。各プローブに該当する標準菌株由来DNAを用いて検討したところ、試作したDNAチップは24種の標準菌体由来DNAを特異的に検出することができることがわかった。さらに、DNAチップ上のスポットは肉眼で明瞭に判別でき、市販の可視光用透過型スキャナーで計測・記録することが十分可能であることが分かった。
現在、実際の臨床サンプルを用いて検討中であり、臨床サンプルに含まれる24種の口腔微生物の従来法による検出(通常のnested PCR法での検出)を終え、DNAチップによる検出との照合を進めつつある。
|
