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両親媒性分子の自己組織化の大規模コンピュータシミュレーション

研究課題

研究課題/領域番号 15740262
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物物理・化学物理
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

藤原 進  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助教授 (30280598)

研究期間 (年度) 2003 – 2005
研究課題ステータス 完了 (2005年度)
配分額 *注記
3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
2005年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2004年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2003年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワード両親媒性分子 / 分子動力学シミュレーション / 自己組織化 / 粗視化モデル / 中間相 / ヘキサゴナル相 / ラメラ相 / 円筒状ミセル / 平面二分子層 / ミセル
研究概要

両親媒性分子の自己組織化機構を分子レベルで解明するため、我々は溶媒分子(水分子)と溶質分子(両親媒性分子)を共に粒子として顕わに扱う分子動力学シミュレーションを行った。シミュレーションモデルとして、以下の粗視化モデルを用いた。両親媒性分子は1つの親水性粒子と1つの疎水性粒子からなり、直線状に等間隔に並んだ剛体棒であるとした。溶媒分子は1つの親水性粒子でモデル化した。親水性粒子と疎水性粒子の間の相互作用は、ソフトコア・ポテンシャルで表し、親水性粒子同士及び疎水性粒子同士の間の相互作用は、レナード-ジョーンズ・ポテンシャルで表した。シミュレーションのアルゴリズムとして、かえる跳び法を用いた。アンサンブルとしてNVTアンサンブルを用い、系の温度を一定に保つため速度スケーリング法を適用した。シミュレーションの時間刻みはΔt^*=0.0025とし、相互作用ポテンシャルのカットオフ距離はr_c^*=3.0とした。また、周期境界条件を用いた。ここでは、全粒子数を5832とし、数密度を0.75とした。最初に、高温(T^*=10.0)においてランダムな両親媒性溶液を準備した。その後、T^*=1.3において急冷を行い、中間相形成過程の解析を行った。様々な両親媒性分子濃度(c_s=0.1〜0.9)で形成される構造を解析した結果、濃度の増加とともに、ミセル溶液からヘキサゴナル相へと変化し、さらにラメラ相へ変化することが分かった。さらに、両親媒性分子の自己会合を支配する主要な力は、疎水基-溶媒界面における疎水性引力と親水基の親水性斥力であるが、ヘキサゴナル相が形成されるためには親水性斥力が重要な役割を果たすことが明らかになった。それに対して、ラメラ相の形成には、疎水性斥力の効果が重要であることが分かった。

報告書

(3件)
  • 2005 実績報告書
  • 2004 実績報告書
  • 2003 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2006 2005 2003 その他

すべて 雑誌論文 (5件) 文献書誌 (2件)

  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation for Structure Formation of a Single Polymer Chain in Solution2006

    • 著者名/発表者名
      S.Fujiwara
    • 雑誌名

      Journal of Physical Society of Japan 75・2

      ページ: 24605-24605

    • NAID

      110004086875

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation of Micelle Formation in Amphiphilic Solution2005

    • 著者名/発表者名
      S.Fujiwara
    • 雑誌名

      物性研究 84・6

      ページ: 897-898

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulation of Micelle Formation in Amphiphilic Solution2005

    • 著者名/発表者名
      S.Fujiwara
    • 雑誌名

      Annual Report of National Institute for Fusion Science April 2004 - March 2005

      ページ: 368-368

    • 関連する報告書
      2005 実績報告書
  • [雑誌論文] Structure Formation of a Single Polymer Chain in Solution : A Molecular Dynamics Study2003

    • 著者名/発表者名
      S.Fujiwara
    • 雑誌名

      Journal of Macromolecular Science - Physics B42・3&4

      ページ: 455-466

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [雑誌論文] Pattern Analysis of Structural Dynamics : Application to Molecular System Relaxation2003

    • 著者名/発表者名
      R.R.Rosa
    • 雑誌名

      Brazilian Journal of Physics 33・3

      ページ: 605-610

    • 関連する報告書
      2004 実績報告書
  • [文献書誌] S.Fujiwara: "Structure Formation of a Single Polymer Chain in Solution : A Molecular Dynamics Study"Journal of Macromolecular Science - Physics. B42・3&4. 455-466 (2003)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書
  • [文献書誌] S.Fujiwara: "Molecular dynamics simulation of a single polymer chain in vacuum and in solution"Computer Physics Communications. 147. 342-345 (2002)

    • 関連する報告書
      2003 実績報告書

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公開日: 2003-04-01   更新日: 2016-04-21  

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