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小笠原諸島と琉球列島に分布する外生菌根菌の集団遺伝学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 15F15714
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 生物多様性・分類
研究機関独立行政法人国立科学博物館

研究代表者

保坂 健太郎  独立行政法人国立科学博物館, 植物研究部, 研究主幹 (10509417)

研究分担者 SHEEDY ELIZABETH  独立行政法人国立科学博物館, 植物研究部, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2015-04-24 – 2017-03-31
研究課題ステータス 完了 (2016年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
2016年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2015年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワード菌根菌 / 移入種 / 多様性 / 個体群 / 進化 / きのこ / リュウキュウマツ / 小笠原
研究実績の概要

リュウキュウマツが自然分布する琉球列島のうち、奄美大島、沖縄島、石垣島、宮古島を対象に、リュウキュウマツと共生する外生菌根菌であるチチアワタケ(イグチ目ヌメリイグチ科)およびアカハツ(ベニタケ目ベニタケ科)の2種の子実体を集中的にサンプリングした。また、リュウキュウマツが人為的に移入された先である小笠原諸島の父島および母島においても、同2種のサンプリングを集中的に行なった。サンプリングにおいては子実体が10メートル以上離れて発生している場合に別個体とみなした。
最終的にはチチアワタケ200個体以上、アカハツ120個体以上を採集し、解析に用いた。全個体からDNAを抽出し、核ITS領域の塩基配列で同一種であることを確認した後に、RAPD法により近隣に発生していた子実体の個体識別を行った。その結果残ったDNAサンプルをピコグリーンにより定量し、かつバイオアナライザーにより定性した。その結果DNAの質・量が十分であるものを次の解析に用いた。抽出DNAは2種類の制限酵素により断片化し、今回のプロジェクト用に作成したアダプターをライゲーションしたうえでRAD-Seq法により個体群を解析した。
イルミナ社MiSeqを用い、MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycle)キットにより計5ランのシーケンシングを行い、2種それぞれの全個体におけるSNPs(一塩基多型)を検出した。それぞれの遺伝子型を基にSTRUCTUREによるクラスター解析を行い、移入元(琉球列島)と移入先(小笠原諸島)における遺伝構造を解析した。その結果、(1) 琉球列島内では概ね島ごとに遺伝構造が異なること、(2)琉球列島と小笠原諸島では遺伝組成が異なることが示唆された。

現在までの達成度 (段落)

28年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

28年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (1件) (うち国際共著 1件、 査読あり 1件) 学会発表 (7件) (うち国際学会 2件、 招待講演 2件)

  • [雑誌論文] Dating the emergence of truffle-like fungi in Australia, by using an augmented meta-analysis2016

    • 著者名/発表者名
      Sheedy EM, Ryberg M, Lebel T, May TW, Bougher NL, Matheny PB
    • 雑誌名

      Australian Systematic Botany

      巻: 29 号: 5 ページ: 284-302

    • DOI

      10.1071/sb16025

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [学会発表] きのこの絶滅種標本からDNAを採り野外から検出する試み2017

    • 著者名/発表者名
      保坂健太郎
    • 学会等名
      日本植物分類学会第16回大会
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2017-03-09
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Dating the emergence of sequestrate fungi in Australia, using an augmented meta-analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Sheedy M
    • 学会等名
      日本地下生菌研究会(JATS)2017年度講演会
    • 発表場所
      神奈川県立生命の星・地球博物館(神奈川県小田原市)
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] On populations of ectomycorrhizal fungi introduced to the Bonin Islands2016

    • 著者名/発表者名
      Sheedy E, Hosaka K
    • 学会等名
      日本菌学会
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] ソライロタケをめぐる分類・生物地理・生態の謎2016

    • 著者名/発表者名
      保坂健太郎
    • 学会等名
      日本菌学会
    • 発表場所
      京都大学(京都府京都市)
    • 年月日
      2016-09-16
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Taxonomic history and distribution record of blue mushroom (Entoloma virescens)2016

    • 著者名/発表者名
      Hosaka K
    • 学会等名
      International Symposium of “East Asian Plant Diversity and Conservation 2016”
    • 発表場所
      東京大学(東京都)
    • 年月日
      2016-08-23
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] On populations of ectomycorrhizal fungi introduced to the Bonin Islands2016

    • 著者名/発表者名
      Sheedy E, Hosaka K
    • 学会等名
      Australian Mycological Society
    • 発表場所
      Queenstown, New Zealand
    • 年月日
      2016-05-03
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Investigating populations of mushrooms in Australia and Japan2015

    • 著者名/発表者名
      Sheedy EM
    • 学会等名
      日本菌学会関東支部第30回シンポジウム
    • 発表場所
      北里大学(東京都港区)
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 招待講演

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公開日: 2015-11-26   更新日: 2024-03-26  

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