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グライコプロテオームを中心とした複合オミクス解析による疾患モデルの糖鎖機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 15H01841
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関国立研究開発法人産業技術総合研究所

研究代表者

成松 久  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 招聘研究員 (40129581)

研究分担者 梶 裕之  国立研究開発法人産業技術総合研究所, .生命工学領域, 研究チーム長 (80214302)
栂谷内 晶  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (60392635)
佐藤 隆  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (90371046)
安形 清彦  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 招聘研究員 (00611138)
研究期間 (年度) 2015-04-01 – 2018-03-31
研究課題ステータス 完了 (2017年度)
配分額 *注記
40,300千円 (直接経費: 31,000千円、間接経費: 9,300千円)
2017年度: 11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2016年度: 11,700千円 (直接経費: 9,000千円、間接経費: 2,700千円)
2015年度: 16,900千円 (直接経費: 13,000千円、間接経費: 3,900千円)
キーワード糖鎖 / 糖転移酵素 / 糖タンパク質 / 糖ペプチド / 糖鎖機能 / グライコプロテオミクス / グライコミクス / 糖鎖改変 / グライコーム解析 / プロテオーム / 疾患モデル / トランスクリプトーム / グライコプロテオーム解析 / トランスクリプトーム解析
研究成果の概要

糖鎖の生体内機能を解明する方法の一つは、糖鎖の生合成を担う糖転移酵素遺伝子を改変(欠損)し、それによって生じた表現型を解析することである。本研究では糖鎖改変細胞・マウスを用い、新規グライコプロテオミクス技術等の解析により、糖転移酵素が生合成する特定糖鎖のキャリア糖タンパク質を同定し、表現型に関連する分子群とそのメカニズムの解明を試みた。グライコプロテオミクス技術・IGOT法ならびに新規技術(Glyco-RIDGE法)を用いることで、各種糖鎖(Lewis x、LacdiNAc、pLN、コンドロイチン硫酸構造など)のキャリア分子の同定や表現型の解析を行った。

報告書

(4件)
  • 2017 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2016 実績報告書
  • 2015 実績報告書
  • 研究成果

    (39件)

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 (10件) (うち国際共著 1件、 査読あり 10件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (28件) (うち国際学会 11件、 招待講演 6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Incomplete clearance of apoptotic cells by core 1-derived O-glycan-deficient resident peritoneal macrophages.2018

    • 著者名/発表者名
      Wakui H, Fuseya S, Suzuki R, Shimbo M, Okada R, Hamada M, Kuno A, Hagiwara K, Sato T, Narimatsu H, Kudo T, Takahashi S.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 122 号: 2 ページ: 2017-2023

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.12.066

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of Poly-N-Acetyllactosamine-Carrying Glycoproteins from HL-60 Human Promyelocytic Leukemia Cells Using a Site-Specific Glycome Analysis Method, Glyco-RIDGE.2018

    • 著者名/発表者名
      Togayachi A, Tomioka A, Fujita M, Sukegawa M, Noro E, Takakura D, Miyazaki M, Shikanai T, Narimatsu H, Kaji H.
    • 雑誌名

      J Am Soc Mass Spectrom.

      巻: - 号: 6 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1007/s13361-018-1938-6

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Postnatal lethality and chondrodysplasia in mice lacking both chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase-1 and -2.2017

    • 著者名/発表者名
      Shimbo M, Suzuki R, Fuseya S, Sato T, Kiyohara K, Hagiwara K, Okada R, Wakui H, Tsunakawa Y, Watanabe H, Kimata K, Narimatsu H, Kudo T, Takahashi S.
    • 雑誌名

      PLoS One.

      巻: 12 号: 12 ページ: e0190333-e0190333

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0190333

    • NAID

      120007134461

    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Contribution of Lewis X Carbohydrate Structure to Neuropathogenic Murine Coronaviral Spread2016

    • 著者名/発表者名
      Kakizaki M, Togayachi A, Narimatsu H, Watanabe R.
    • 雑誌名

      Japanese Journal of Infectious Diseases

      巻: 69 号: 5 ページ: 405-413

    • DOI

      10.7883/yoken.JJID.2015.499

    • NAID

      130005416321

    • ISSN
      1344-6304, 1884-2836
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書 2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Formation of fibroblastic reticular network in the brain after infection with neurovirulent murine coronavirus2016

    • 著者名/発表者名
      R. Watanabe, M. Kakizaki, Y. Ikehara, A. Togayachi
    • 雑誌名

      Neuropathology

      巻: 36(6) 号: 6 ページ: 513-526

    • DOI

      10.1111/neup.12302

    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Large-scale mutational analysis in the EXT1 and EXT2 genes for Japanese patients with multiple osteochondromas.2016

    • 著者名/発表者名
      Ishimaru D, Gotoh M, Takayama S, Kosaki R, Matsumoto Y, Narimatsu H, Sato T, Kimata K, Akiyama H, Shimizu K, Matsumoto K.
    • 雑誌名

      BMC Genet.

      巻: 17 号: 1 ページ: 52-52

    • DOI

      10.1186/s12863-016-0359-4

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Comparison of analytical methods for profiling N- and O-linked glycans from cultured cell lines : HUPO Human Disease Glycomics/Proteome Initiative multi-institutional study.2015

    • 著者名/発表者名
      Ito H, Kaji H, Togayachi A, Narimatsu H.et al.
    • 雑誌名

      Glycoconj J.

      巻: なし

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Large-Scale Identification of N-Glycan Glycoproteins Carrying Lewis x and Site-Specific N-Glycan Alterations in Fut9 Knockout Mice.2015

    • 著者名/発表者名
      Noro E, Togayachi A, Sato T, Tomioka A, Fujita M, Sukegawa M, Suzuki N, Kaji H, Narimatsu H.
    • 雑誌名

      J Proteome Res.

      巻: 14(9) 号: 9 ページ: 3823-3834

    • DOI

      10.1021/acs.jproteome.5b00178

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Large-scale identification of secretome glycoproteins recognized by Wisteria floribunda agglutinin: A glycoproteomic approach to biomarker discovery.2015

    • 著者名/発表者名
      Sugahara D, Tomioka A, Sato T, Narimatsu H, Kaji H.
    • 雑誌名

      Proteomics.

      巻: 15(17) 号: 17 ページ: 2921-33

    • DOI

      10.1002/pmic.201400443

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Influenza A Virus-Induced Expression of a GalNAc Transferase, GALNT3, via MicroRNAs Is Required for Enhanced Viral Replication.2015

    • 著者名/発表者名
      Nakamura S, Horie M, Daidoji T, Honda T, Yasugi M, Kuno A, Komori T, Okuzaki D, Narimatsu H, Nakaya T, Tomonaga K.
    • 雑誌名

      J Virol.

      巻: 90 号: 4 ページ: 1788-801

    • DOI

      10.1128/jvi.02246-15

    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Fut9ノックアウトマウスを用いた脳におけるルイスxキャリアタンパク質の網羅的な解析(Large-scale identification of glycoprotein carrying Lewis x in the brain using Fut9 knockout mice)2017

    • 著者名/発表者名
      野呂絵里花、栂谷内晶、富岡あづさ、助川昌子、藤田弥佳、鈴木奈美、梶裕之、成松久
    • 学会等名
      日本糖質学会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Deletion of B3glct disrupts craniofacial, skeletal, and cardiac development in mice2017

    • 著者名/発表者名
      Haltiwanger R, Rubel D, Grady R, Uddin S, Komatsu D, Bamforth S, Schneider J, Sato T, Narimatsu H, Holdener B.
    • 学会等名
      24th INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON GLYCOCONJUGATES(Jeju, Korea)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] マウス卵管におけるフコシル化糖鎖sialyl Lewis Xの生合成経路の解析2017

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕之、松浦寛明、小林純子、栂谷内晶、成松久、Kay-Hooi Khoo、川島博人
    • 学会等名
      第61回日本薬学会関東支部大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] Developement of site-specific glycome analysis method of complex glycoproteome2017

    • 著者名/発表者名
      Azusa Tomioka, Chiaki Okatani, Erika Noro, Toshihide Shikanai, Hisashi Narimatsu. Hiroyuki Kaji
    • 学会等名
      HUPO World Congress (Dublin, Ireland)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of glycoproteins with novel LacdiNAc structures synthesized by B3GALNT2.2017

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Nakane, Kiyohiko Angata, Takashi Sato, Hiroyuki Kaji, and Hisashi Narimatsu
    • 学会等名
      The 9th ACGG conference(Hong Kong, China)
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] β3GalNAcT2糖転移酵素はtype I LacdiNAc構造をN型糖鎖とO型糖鎖上に形成する2017

    • 著者名/発表者名
      安形清彦、中根隆浩、古川早苗、佐藤隆、澤木弘道、曽我部万紀、久保田智己、梶裕之、成松久
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] β3GalNT2糖転移酵素によって合成されるtype I LacdiNAc構造キャリアタンパク質の同定2017

    • 著者名/発表者名
      中根隆浩、安形清彦、佐藤隆、梶裕之、成松久
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 腎糸球体足細胞におけるムチン型O結合型糖鎖の機能解明2017

    • 著者名/発表者名
      布施谷清香, 岡田理沙, 鈴木陸, 新保未来, 涌井宏優, 中村勇輝, 坪内鴻奈, 臼井俊明, 森戸直記, 萩原梢, 佐藤隆, 成松久, 高橋智, 工藤崇
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] マクロファージでのTim4タンパク質の安定発現にムチン型糖鎖は必須である2017

    • 著者名/発表者名
      涌井宏優, 布施谷清香, 岡田理沙, 鈴木陸, 新保未来, 濱田理人, 萩原梢, 佐藤隆, 成松久, 高橋智, 工藤崇
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 全身性誘導コンディショナルノックアウトマウスを用いたムチン型糖鎖新規機能2017

    • 著者名/発表者名
      鈴木陸, 中村勇輝, 涌井宏優, 岡田理沙, 布施谷清香, 坪内鴻奈, 萩原梢, 佐藤隆, 成松久, 高橋智, 工藤崇
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
  • [学会発表] 複雑性の極み: 糖鎖修飾状態の解析への挑戦2017

    • 著者名/発表者名
      梶裕之、富岡あづさ、野呂絵里花、岡谷千晶、藤田弥佳、助川昌子、成松久
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 関連する報告書
      2017 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] B3GALNT2糖転移酵素によって合成される新規LacdiNAc構造キャリアタンパク質の同定2016

    • 著者名/発表者名
      中根 隆浩, 安形 清彦, 佐藤 隆, 梶 裕之, 成松 久
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-12-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 糖タンパク質大規模解析とデータベース構築: 糖鎖付加位置マッピングから位置ごとのグライコーム解析へ2016

    • 著者名/発表者名
      梶 裕之, 富岡あづさ, 野呂絵里花, 藤田弥佳, 助川昌子, 岡谷千晶, 鹿内俊秀, 成松久
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Both Chondroitin Sulfate N-Acetylgalactosaminyltransferase-1 and -2 are Required for Endochondral Ossification2016

    • 著者名/発表者名
      Miki Shimbo, Risa Okada, Hiromasa Wakui, Riku Suzuki, Sayaka Fuseya, Kozue Hagiwara, Takashi Sato, Hisashi Narimatsu, Satoru Takahashi, and Takashi Kudo.
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 腎糸球体足細胞におけるムチン型糖鎖の役割2016

    • 著者名/発表者名
      布施谷清香, 岡田理沙, 鈴木陸, 新保未来, 涌井宏優, 臼井俊明, 森戸直記, 萩原梢, 佐藤隆, 成松久, 高橋智, 工藤崇
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-28
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Successful translational research based on combination of multiple glyco- proteomics technologies.2016

    • 著者名/発表者名
      成松久
    • 学会等名
      Swedish MS/proteomic meeting
    • 発表場所
      University of Gothenburg(Gothenburg,Sweden)
    • 年月日
      2016-11-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 最近のグライコプロテオミクス: 糖鎖付加部位ごとの糖鎖不均一性の大規模解析法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      梶 裕之
    • 学会等名
      第14回日本糖鎖科学コンソーシアム(JCGG)シンポジウム
    • 発表場所
      御茶ノ水ソラシティカンファレンスセンター(東京都千代田区)
    • 年月日
      2016-11-01
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] 佐藤隆, 梶裕之, 千葉靖典, 成松久2016

    • 著者名/発表者名
      Characterization of Wisteria Floribunda lectin and Its Application for Glycoproteomics Study
    • 学会等名
      8th Asian Community of Glycoscience and Glycotechnology
    • 発表場所
      Jiangnan University (Wuxi, China)
    • 年月日
      2016-10-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Analyses of glycogene expression by RNA sequencing to determine the different glycan synthesis.2016

    • 著者名/発表者名
      安形清彦, 辻川紫華子, 佐藤隆, 栂谷内晶, 成松久
    • 学会等名
      8th Asian Community of Glycoscience and Glycotechnology
    • 発表場所
      Jiangnan University (Wuxi, China)
    • 年月日
      2016-10-14
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] 糖タンパク質の糖鎖不均一性の大規模解析2016

    • 著者名/発表者名
      梶 裕之, 富岡あづさ, 野呂絵里花, 藤田弥佳, 助川昌子, 岡谷千晶, 鹿内俊秀, 成松久
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      仙台国際センター/東北大学川内北キャンパス(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-09-27
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
  • [学会発表] Accurate mass- and glycan composition-based assignment of glycosylation site-specific glycomes of complex glycoprotein mixture2016

    • 著者名/発表者名
      梶 裕之, 富岡あづさ, 野呂絵里花, 藤田弥佳, 助川昌子, 岡谷千晶, 鹿内俊秀, 成松久,
    • 学会等名
      Human Proteome Organization World Congress
    • 発表場所
      Taipei International Convention Center(Taipei,Taiwan)
    • 年月日
      2016-09-20
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Use of whole transcriptome analysis to determine glycogene expression in hepatic cells2016

    • 著者名/発表者名
      安形清彦, 澤木弘道, 辻川紫華子, 雄長誠, 栂谷内晶, 成松久
    • 学会等名
      6th Charles Waren Workshop 2016
    • 発表場所
      北海道大学(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-08-24
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Large-scale identification of glycoproteins carrying Lewis x and site-specific glycan alterations in Fut9 knockout mice.2016

    • 著者名/発表者名
      Erika Noro, Hiroyuki Kaji, Hisashi Narimatsu.
    • 学会等名
      KHUPO 16th Annual International Proteomics Conference
    • 発表場所
      Daejeon Convention Center(Daejeon, Korea)
    • 年月日
      2016-03-28
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Roles of Chondroitin Sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase-1 and -2 in Endochondral Ossification.2015

    • 著者名/発表者名
      Miki Shimbo, Takashi Sato, Kozue Hagiwara, Risa Okada, Hiromasa Wakui, Hisashi Narimatsu, Satoru Takahashi, and Takashi Kudo.
    • 学会等名
      BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] Novel LacdiNAc structures on N- and O-glycans synthesized in vivo by 3GalNAcT2.2015

    • 著者名/発表者名
      Kiyohiko Angata, Takahiro Nakane, Sanae Furukawa, Takashi Sato, Hiromichi Sawaki, Maki Sogabe, Tomomi Kubota, Hiroyuki Kaji, and Hisashi Narimatsu.
    • 学会等名
      The 7th ACGG conference
    • 発表場所
      ホテル大観荘(宮城県松島市)
    • 年月日
      2015-11-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Identification of glycoproteins with novel LacdiNAc structures synthesized by B3GALNT2.2015

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Nakane, Kiyohiko Angata, Takashi Sato, Hiroyuki Kaji, and Hisashi Narimatsu
    • 学会等名
      The 7th ACGG conference
    • 発表場所
      ホテル大観荘(宮城県松島市)
    • 年月日
      2015-11-13
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] α1,3-フコース転移酵素9ノックアウトマウスを用いた新規グライコプロテオミクス技術による糖鎖付加部位特異的グライコームの網羅的な解析2015

    • 著者名/発表者名
      野呂絵里花、栂谷内晶、佐藤隆、富岡あづさ、藤田弥佳、助川昌子、鈴木奈美、梶裕之、成松久
    • 学会等名
      第34回日本糖質学会
    • 発表場所
      東京大学安田講堂(東京都文京区)
    • 年月日
      2015-07-31
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [学会発表] α1,3-フコース転移酵素9ノックアウトマウスを用いた糖鎖付加部位特異的グライコームの網羅的な解析2015

    • 著者名/発表者名
      野呂絵里花、栂谷内晶、佐藤 隆、富岡 あづさ、藤田弥佳、助川昌子、鈴木奈美、梶裕之、成松久
    • 学会等名
      JHUPO第13回大会
    • 発表場所
      くまもと森都心プラザ(熊本県熊本市)
    • 年月日
      2015-07-23
    • 関連する報告書
      2015 実績報告書
  • [図書] A Practical Guide to Using Glycomics Databases:GlycoGene Database (GGDB) on the Semantic Web.2016

    • 著者名/発表者名
      成松久, 鈴木芳典, 木下フローラ聖子, 鹿内俊秀, 藤田典昭, 佐藤隆, 栂谷内晶, 横尾岳彦, 安形清彦, 久保田智巳, 野呂絵里花
    • 総ページ数
      13
    • 出版者
      Springer
    • 関連する報告書
      2016 実績報告書

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公開日: 2015-04-16   更新日: 2019-03-29  

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